Die Welt wird von einem Geschlecht riesiger Kannibalen beherrscht. Das letzte Refugium der Menschen ist eine Festung mit mehreren konzentrischen Mauern. Hinter diesen Mauern lauert das Verderben.
Der junge Eren Jäger erlebt ein traumatisches Ereignis ohne Gleichen: seine Mutter wird vor seinen Augen von einem Titanen verschlungen. Eren hat nur noch ein Lebensziel – die Vernichtung dieser Monster.
Eren, Armin und Mikasa haben sich für den Aufklärungstrupp gemeldet. Als erstes müssen sie eine hammerharte Ausbildung absolvieren.
Das Kampftraining geht weiter. Unter den Rekruten gibt es oft Spannungen und handgreifliche Auseinandersetzungen. Eren nimmt kein Blatt vor den Mund und kritisiert offen die Feigheit einiger Rekruten.
Die Rekruten lernen, dass die Titanen nur an einer einzigen Stelle ihrer monströsen Körper verwundbar sind. Eren und Arnim erleben die Grausamkeit der Titanen hautnah am eigenen Leibe.
Mikasa beweist Kampfgeist und Mut – sowohl gegenüber den Titanen als auch gegenüber Menschen. In einer Rückblende erfahren wir, weshalb Mikasa so furchtlos ist und warum sie so sehr an Eren hängt.
Angesichts der Brutalität und Unbezwingbarkeit der Titanen machen sich Verzweiflung und Mutlosigkeit breit. Allein Mikasa hat noch die Kraft und den Willen zu Kämpfen. Und sie bekommt ganz unerwartete Hilfe.
Armin, Mikasa und Conny entschließen sich dazu, den plötzlich aufgetauchten Titanen, der scheinbar auf ihrer Seite steht, gegen den Schwarm von Titanen einzusetzen. Diese verfolgen die Menschen allerdings bis ins Lagerhaus.
Durch ein Wunder ist Eren aus dem Körper des Titanen, von dem er einst verschlungen wurde, unversehrt wiederauferstanden. Aber deshalb ist er jetzt selbst hoch verdächtig ein Titan zu sein.
Eren erkennt, dass er tatsächlich zu einem Titanen geworden ist. Der Schlüssel zum Verständnis könnte ein Geheimnis sein, das ihm einst sein Vater vermachte. Zunächst aber kommt alles auf Arnim an.
Kommandant Dott Pixis glaubt daran, dass Eren Titanenkräfte besitzt und ist bereit ein großes Risiko einzugehen - Eren soll in einer spektakulären Aktion seine Titanenkraft zum Nutzen der Menschen einsetzen.
Erens Verwandlung in einen Titanen klappt wie geplant, doch der Titan macht nicht was besprochen und verabredet war. Was ist schiefgelaufen? Was ist mit Eren? Steckt er im Körper des Titanen fest?
Nachdem es Armin gelungen ist, Eren im Körper des Titanen wiederzubeleben, ist dieser Titan für viele Menschen der letzte Hoffnungsträger im Kampf gegen die Barbarei der Titanen.
Erens Verhalten als "Steuerzentrum" eines Titanen macht vielen Menschen Angst. In einem öffentlichen Militärtribunal soll entschieden werden, was mit Eren passieren soll.
Eren stößt zum Aufklärungstrupp, noch dazu zur Elite unter Führung von Levy! Doch seine neuen Kameraden sind seltsame Typen und begegnen ihm mit Misstrauen. Dann trägt sich in der Nacht noch ein merkwürdiges Verbrechen zu …
Eren Jäger wird einer Spezialeinheit vorgestellt. Außerdem erhält er Informationen über Levis Vergangenheit, und Hanji Zoe zeigt ihm gefangene Titanen, mit denen Experimente durchgeführt werden sollen.
Während ihrer Expedition baut der Trupp eine Formation auf, in der sich eine Gruppe rund um die Kerngruppe verteilt, um vor nahenden Titanen warnen zu können. Nachdem es Armins Trupp schafft, einen abnormalen Titan zu erledigen, taucht plötzlich ein Titan mit einem weiblichen Körper auf. Hinzu kommt auch, dass dieser Titan den Schwertern standhalten kann und intelligent genug ist, um die erfahrenen Soldaten umzubringen. Die Titanin fängt Armin, lässt ihn jedoch am Leben, nachdem sie sein Gesicht gesehen hat.
Armin, Reiner und Jean bleiben nach ihrem Zusammentreffen mit der Titanin allein mit nur einem Pferd zurück, werden jedoch bald darauf von Christa gerettet. Sie warten auf den Befehl, sich zurückzuziehen, müssen jedoch feststellen, dass ihre Mission fortgesetzt wird, obwohl sie in eine andere Richtung umgeleitet wird. Die Nachrichten bezüglich der Titanin erreichen derweil auch die Kerngruppe. Die gesamte Formation erreicht die riesigen Bäume.
Da immer mehr Wachen von der Titanin ermordet werden, bittet Eren seinen Trupp, ihn kämpfen zu lassen, jedoch raten sie ihm, dass er Levis (Hiroshi Kamiya) Entscheidung vertrauen soll. Eren erwägt, sich einfach in einen Titanen zu verwandeln. Levi sagt ihm, dass er sich entscheiden muss, ob er seiner eigenen Kraft oder seinen Kameraden vertrauen will. Eren erinnert sich daran, wie Hange und Levi ihre Titanenexperimente an ihm probierten, welche jedoch scheiterten, da er nicht in der Lage war, sich auf Kommando zu verwandeln.
Erwin und Levi versuchen, die Identität des weiblichen Titans herauszubekommen, was jedoch scheitert, da dieser den Menschen in sich beschützt. Jean, Armin und der Rest des Trupps realisieren, dass es Erwins Plan war, Eren als Köder zu benutzen, um den Maulwurf der Einheit zu entlarven. Währenddessen wunderen sich die anderen, was wohl innerhalb des Waldes passiert. Die Titanin lockt derweil weitere Titanen zu sich...
Erwin erzählt Hange, dass es ein Fehler war zu denken, dass alle Menschen, die sich in Titanen verwandeln können, wie Eren seien, da die Kräfte der Titanin weit über Erens hinausgehen. Währenddessen verwandelt sich der Maulwurf woanders wieder in seine Titanenform und macht Jagd auf Levis Trupp. Eren wird wieder mal davon abgehalten, sich auch zu verwandeln. Petra, Erd und Auruo nehmen der Titanin ihre Siche und versuchen, ihr die Arme abzunehmen.
Levi befiehlt Mikasa, die Titanin abzulenken, um Eren zurückzubekommen. Er selbst schafft es, sie zu schwächen, doch Mikasa wird bei dem Versuch, den finalen Stoß zu setzen, verletzt. Levi rettet Mikasa und zieht sich eine Verletzung an seinem Bein dabei zu. Sie befreien Eren aus dem Mund der Titanin, bevor diese schwer verletzt gegen einen Baum stößt. Dieter versucht, die Leiche seines Freundes Ivan zu retten und zieht damit die Aufmerksamkeit der Titanen auf sich.
Annie hat einen Traum, wie sie von ihrem Vater trainiert wird. In dem Stohess-Bezirk wird die Militärpolizei berufen, die Kavallerie zu unterstützen, wenn diese wieder einreitet. Die Militärpolizei wird als korrupt und faul gezeigt, was Annies Kameraden Hitch sogar motivierte, dieser beizutreten. Armin bittet Annie um Hilfe, da er Eren dabei hilft, aus der Hauptstadt zu fliehen. Annie lehnt das zunächst ab, willigt schließlich jedoch ein.
Ein paar Tage, bevor Eren in die Hauptstadt gebracht wird, offenbaren ihm Erwin und Armin, dass sie einen Plan haben, wie sie die Person, von der sie glauben, dass sie die Titanin sei, fangen könnten. Eren versucht, sich wieder zum Titanen zu verwandeln, schafft es jedoch nicht. Mikasa glaubt, dass ihn seine Gefühle für Annie davon abhalten. Als ein weiterer Tunnel zusammenbricht und Eren einschließt, lenken Mikasa und Armin die Titanin ab.
Eren und Annie kämpfen als Titanen gegeneinander durch ganz Stohess und sorgen dabei für Zerstörung und Tod, während Hange ihren Männern befiehlt, auszuharren, bevor sie Annie festnehmen. Titan-Eren kann Titan-Annie besiegen und ist kurz davor, sie zu essen, hält jedoch inne, da er sie weinen sieht. Ihr Körper wird von einem Kristall umgeben. In dem Epilog sehen wir zudem, dass sich in den Mauern anscheinend größere Geheimnisse verbergen, als bisher gedacht...