Iron Man trommelt die Avengers zusammen um den Tod von Captain America zu rächen. Sie kämpfen gemeinsam gegen die geballte Kraft der Partnerschaft von Red Skull und M.O.D.O.K. und dabei entdecken sie etwas, womit sie nie gerechnet hätten …
Als Iron Mans Anzug, samt des ‚arc reactors‘, gestohlen wird, kämpfen die Avengers gegen die Zeit, um sein Leben zu retten. Währenddessen lassen M.O.D.O.K. und Red Skull Microbots frei, die die Avengers gegeneinander aufbringen sollen.
Falcons Umzug in die Stark Zentrale nimmt einen unvorhergesehenen Lauf, als Phantome den Stark Tower überfallen und alle Avengers, bis auf Falcon, gefangen nehmen. Falcon muss einen Weg finden die Phantome zu stoppen, die Avengers zu befreien und das Portal, aus dem die Phantome kamen, zu zerstören und das komplett auf sich allein gestellt.
Thors größte Ängste werden wahr, als Ulik aus der Unterwelt emporsteigt, die verschwundene Asgardischen Streitaxt im Gepäck. Dr. Doom stiehlt die Axt und die Avengers vereinen sich, um sie wieder zurückzuerlangen. Dabei stellt sich ihnen Midgard Serpent in den Weg.............
Nachdem sie gegen eine Gruppe Vampire, angeführt von einer gebissenen schwarzen Witwe, gekämpft haben, machen sich die Avengers auf den Weg zu Draculas Lager, um ihn aufzufordern, sie von seinem Bann zu befreien. Thor hält die Aktion für eine Falle laufen, während Captain America sich sicher ist, dass Dracula hinter ihm her ist. Was sind Draculas wahre Motive?
Justin Hammer fordert die Avengers heraus. Sie sollen sich seinem neuesten Roboter stellen. Während des Kampfes finden die Avengers heraus, dass dieser Android lernfähig ist und darum ihre eigenen Kampftechniken gegen sie einsetzen kann. Die Avengers müssen nun zusammenarbeiten und neue Techniken entwickeln, bevor dieser Super Adaptoid sie besiegen kann.
Die Avengers sind dem neuen Superhelden Hyperion dankbar, als dieser die Erde vor einem riesigen Meteoriten rettet. Sie bekommen jedoch bald den Eindruck, dass er zu gewalttätig gegen Kriminelle vorgeht. Hyperion würde gerne gemeinsam mit den Avengers die Erde vor der Verderbtheit und dem Bösen retten, die auch seinen eigenen Planeten zerstörte. Die Avengers haben jedoch das Gefühl, dass Hyperion ihnen nicht die ganze Wahrheit über das frühe Ende seines Planeten und seiner Einwohner gesagt hat.
Hawkeye und Black Widow sollen in einer geheimen S.H.I.E.L.D. Mission den Sohn eines Super-Bösewichts festsetzen. Als sich herausstellt, dass er eine Waffe besitzt, die Moleküle manipulieren kann, wird ihnen klar, dass das Geheimhalten der Mission ein großer Fehler war.
Für die Avengers heißt es ‚schwimm oder ertrinke‘, als der Anführer der versunkenen Stadt Atlantis New York überflutet. Hulk kann seine Wut kaum kontrollieren und hat daher Schwierigkeiten mit dem Rest des Teams zusammenzuarbeiten, während die Stadt unerwartet schnell im Ozean versinkt.
Doctor Doom erlangt die Befehlsgewalt über den Destroyer, eine Waffe, die von Odin zum Zweck gebaut wurde, die asgardische Waffenkammer zu bewachen. Thor muss die Avengers nun überzeugen, der einzigen Person zu trauen, die den Destroyer stoppen könnte ’ Loki!
Die Avengers erfahren wie es ist in Hulk’s Haut zu stecken, als sie alle, durch eine Gamma-Strahlen Attacke von Red Skull, in wütende und unkontrollierbare Monster verwandelt werden. Nun ist es an dem ungleichen Paar, Hulk und Black Widow, die Stadt vor den Hulk-Vengers zu beschützen.
Die Welt der Avengers steht auf dem Kopf, als der formwandelnde Unruhestifter, Impossible Man, Falcon zum Star seines neusten Action-Films macht. Dieser ahnt nichts Böses, bis er merkt, das in diesem Kassenschlager die ganze Welt auf dem Spiel steht!
Iron Man und Captain America geben sich als Bösewichter aus, um Red Sculls geheime Vereinigung von Anti-Helden, Cabal, zu infiltrieren. Der Plan geht auf, bis sich die beiden Avengers so sehr über ihre Strategie streiten, dass ihre Tarnung auffliegt und sie es alleine mit der ganzen Cabal aufnehmen müssen.
Als Hulk eine Bruchlandung auf der Erde macht, verliert er sein Gedächtnis. Das einzige, was er noch mit Sicherheit zu wissen glaubt, ist dass die Welt dem Untergang geweiht ist. Die Avengers rekonstruieren einen typischen Tag in Hulks Leben, um herauszufinden, was den Stärksten unter ihnen so ausgeknockt haben könnte.
Thor besucht seinen Vater in Asgard. Als er auf die Erde zurückkehrt, entdeckt er, dass Dr. Doom eine alternative Realität entwickelt hat, in der die Avengers sich ihrer Superhelden Kräfte nicht bewusst sind. Nur Thors Hammer kann diese neue Realität zerstören, doch Dr. Doom hat diesen eingefroren …
Red Skull und seine Geheime Verbindung wollen die Avengers besiegen. Es gelingt ihnen tatsächlich als Team zusammenzuarbeiten und so Captain Amerika gefangenzunehmen. Nun wollen die Avengers herausfinden, wie es der Geheimen Verbindung gelungen ist ihren Plan zu durchkreuzen, denn Captain America und der Tri-Carrier müssen gerettet werden. Sie sind also abgelenkt. Red Skull kann der Geheimen Verbindung unterdessen ein entsetzliches neues Mitglied hinzufügen.
Die Avengers wetten miteinander, dass es ihnen gelingt, vierundzwanzig Stunden ohne Technik auszukommen. Sie entschließen sich, diesen Tag im Wilden Land zu verbringen. Doch dann stellt sich heraus, dass Justin Hammer dort Vibranium für Red Skull abbauen will.
Hulk und Hawkeye befinden sich plötzlich inmitten eines Spiels um Leben und Tod, in der intergalaktischen Fernsehsendung von Mojo. Sie müssen den brutalen Torgo überlisten, wenn sie überleben wollen.
Die Avengers riskieren ihr Leben um doctor Doom zu retten! Es kommt zu einer Straßenschlacht zwischen Red Skulls Geheimorganisation ‚Cabal‘, den Avengers und Doctor Doom, in der Cap zum Helden wird.
Odin kommt in den Avengers Tower, um seinen Sohn Thor aufzufordern seine ‚Vergnügungen‘ auf der Erde zu beenden und nach Asgard zurückzukehren. Thor verspricht für immer nach Hause zukommen, wenn er nicht beweisen kann, das er Gutes auf Erden bewirkt.
Die Avengers und Red Skulls Geheimorganisation haben eine Auseinandersetzung, die das Team für immer verändert. Tony begreift, dass man sich nicht nur auf Statistiken verlassen kann, die menschliche Intuition und unersätzlich.
Galactus greift die Erde an und Iron schafft es in zu einem anderen Planeten zu locken. Doch dann finden die Avengers heraus, dass der Planet ebenfalls bewohnt ist und unter dem Schutz der Guardians of the Galaxy steht!
Falcons Mutter ist zu Besuch, als ein Pym-Partikel entweicht. Das Problem daran: Dieses instabile Teilchen kann die Körpergröße beeinflussen …
Hawkeye hat vor langer Zeit den Circus of Crime verlassen und sich den Avengers angeschlossen. Doch seine Vergangenheit holt ihn ein, als der „Zirkus“ in die Stadt kommt – und zwar um Vergeltung an seinem Verrat zu üben.
Red Skull und seine geheime Verbindung greifen erneut die Avengers an. Doch sein Plan ist es, seine Anhängerschaft zu opfern, um sich dadurch zu Cosmic Skull zu verwandeln.
Im letzten Showdown müssen die Avengers Cosmic Skull vernichten. Doch dafür sollen sie sich mit der geheimen Verbindung zusammentun. Schaffen sie es, zusammen zu arbeiten und damit einen neuen Schurken zu Fall zu bringen?