Die Avengers machen sich auf die Suche nach dem vor Jahren von Tonys Vater geschaffenen ‚Projekt Arsenal‘. Denn sie hoffen, dass es ihnen im Kampf gegen den neuen Superschurken Thanos helfen kann.
Um ein Held zu sein, muss man manchmal große Opfer bringen. Dies wird den Avengers klar, als Tony gezwungen ist Arsenal einzusetzen. Mit Arsenal soll verhindert werden, dass Thanos den Stein der Macht in seinen Besitz bringt.
Thor und Hulk wird klar, dass zwar gegen einen freundschaftlichen Wettstreit von Zeit zu Zeit nichts einzuwenden ist, dass aber ihr verbissenes und andauerndes Kräftemessen Menschenleben in Gefahr bringen könnte.
Red Skull verfügt über Informationen, die den Avengers dabei helfen könnten, die Welt vor Thanos zu schützen. Doch ein unbekannter Eindringling entführt Skull. Captain Amerika muss bald feststellen, dass es sich bei dem Eindringling um seinen alten Partner Bucky Barnes handelt. Der nennt sich nun Winter Soldier und ist zurückgekehrt um Rache zu nehmen.
Die Avengers kämpfen gegen Lady Zartra. Doch dann stellt sich heraus, dass sie eine kleine Gruppe Rebellen um sich geschart hat, um die Bewohner von Atlantis von der Schreckensherrschaft des grausamen Attuma zu befreien. Sie möchte auch, dass Atlantis Frieden mit der Welt an der Oberfläche schließt.
Ein mysteriöser neuer Schurke nimmt sich nacheinander die Avengers vor. Doch dann stellt sich heraus, dass er sich im Kampf Wissen zu Nutze macht, das Falcon bei S.H.I.E.L.D. erarbeitet hat.
Der Zeitstein, einer der Infinity-Steine, verbindet sich mit Tony Starks Arc-Reaktor und löst Zeitsprünge aus, durch die Tony rasant verjüngt wird. Doch das ist nicht alles. Der Stein transportiert auch Dinosaurier und andere Gefahren der Vergangenheit in das New York der Gegenwart.
M.O.D.O.K. hat mit Hilfe des Gedankensteins S.H.I.E.L.D. unter seine Kontrolle gebracht. Mit dem Stein ist er in der Lage, den Verstand anderer zu kontrollieren und Körper zu tauschen. Und so finden sich die Avengers auf einmal in der Gestalt eines ihrer Mitstreiter wieder.
Jessie ist eifersüchtig auf Tonys neue Kollegin Victoria Montesano. Im Gegenzug will sie Tony auch eifersüchtig machen, indem sie wieder Kontakt mit ihrem Ex-Freund Ted Hoover aufnimmt, der ein männliches Super-Model geworden ist. Währenddessen versuchen Ravi und Luke Bertrams Gesundheitszustand zu verbessern: mit katastrophalen Auswirkungen.
Thor und die Avengers kehren nach Asgard zurück, um gegen Loki zu kämpfen und so zu verhindern, dass die Erde und Asgard kolidieren. Ein Ereignis, das Teil von Lokis Fluchtplan aus Walhalla ist.
Falcon und Hawkeye werden versehentlich in eine gefährliche Welt teleportiert, in der keine Elektrizität existiert. Dort muss Falcon sich und seinem Begleiter beweisen, dass er auch ohne die Hilfe fortschrittlicher Technologie ein echter Held sein kann.
Thor und Black Widow versuchen, die Infinity-Steine von der Erde fortzubringen, bevor Thanos sie an sich reißen kann und so die Macht über das gesamte Universum erlangt.
Die Avengers versuchen erneut Thanos zu stoppen, der mittlerweile alle fünf Infinity-Steine besitzt. Denn wenn es ihnen diesmal nicht gelingt ihn zu besiegen, wird er das Universum unterwerfen.
Iron Man und Captain America versuchen, ihre Freundschaft wiederherzustellen. Doch dann entdeckt Cap, dass Iron Man gefährliche Informationen über Ultron verheimlicht, einem System mit künstlicher Intelligenz.
Ultron kehrt zurück. Weil er noch mächtiger geworden ist, gelingt es ihm, die Kontrolle über den Avengers Tower und Iron Mans Halle der Rüstungen zu übernehmen. Wird diese Tat das Ende der Avengers einleiten?
Nachdem Ultron den Avengers Tower ausgelöscht hat und die Avengers getrennt sind, sucht Iron Man nun Hilfe bei Ant-Man. Als die anderen aber zufällig erfahren, dass Ant-Man versucht M.O.D.O.K. zu stoppen, der gestohlene Pym Partikel für seine dunklen Zwecke missbraucht, eilen sie zur Hilfe, um den Tyrannen aufzuhalten.
Captain Americas Team wird langsam bewusst, dass es nicht so toll ist für S.H.I.E.L.D. zu arbeiten wie erwartet, als sie in einer gefährlichen Situation kommentarlos Befehle befolgen und mit The Winter Guard zusammenarbeiten müssen.
Iron Man und Captain America lösen ihre Differenzen und führen die Avengers wieder zusammen, während sie versuchen die Welt vor der ultimativen Bedrohung durch Ultron zu retten.
Die Avengers sind wieder vereint und haben mit Ant-Man ein neues Mitglied dazubekommen. Davon ist Hawkeye gar nicht begeistert und möchte lieber aussteigen. Doch Captain America verlangt das Hawkeye seinen Nachfolger auf der Monster-Insel trainiert, bevor er geht. Was sie jedoch nicht wissen, ist dass sich Red Skull dort versteckt hält…
Hulk findet heraus, dass Speed Demon, das schnellste Mitglied der Squadron Supreme, Chaos und Verwüstung im Avengers Tower anrichtet. Wird Hulks durchschlagende Kraft ausreichen, um es mit der Super-Geschwindigkeit dieses Schurken aufzunehmen?
Nun, da Ant-Man ein Avenger ist, versucht er die Fehler seiner Vergangenheit wieder gutzumachen, indem er die Schurken zur Strecke bringt, die er früher einmal mit der neuesten Technik versorgt hat. Einer davon ist Dr. Spectrum, einer der mächtigsten Mitglieder der Squadron Supreme, der nun damit droht, die Erde zu zertstören.
Thor ist davon überzeugt, das Zarda, eine Kriegerin der Squadron Supreme, eine gute Seite hat und eine Verbündete der Avengers werden könnte. Doch Hulk weiß, dass Zarda ein doppeltes Spiel treibt und versucht seinen Freund Thor zu schützen, bevor sie ihre dunklen Ziele erreicht.
Die Avengers werden von dem unglaublich mächtigen Squadron Supreme zum Kampf herausgefordert. Nur ein Team kann gewinnen – werden sich die Avengers durchsetzten?
Die Squadron Supreme haben die Welt erobert und die Avengers dem Tod überlassen. Doch die Squadron und der Rest der Welt wissen nicht, dass die Avengers untergetaucht sind. Sie entwickeln einen Plan, um die Welt zu retten und die Squadron Supreme ein für alle Mal zu stoppen.
Als Aliens die Avengers bitten, Sie vor mysteriösen Eindringlingen zu retten, finden Sie den kürzlich geflohenen Thanos und seine Generäle beim Plündern des Planeten. Unterdessen ist Tony davon überzeugt, dass es Zeit wird neue Herausforderungen für die derzeit so erfolgreichen Avengers zu suchen. Cap jedoch glaubt es ist besser auf den Boden der Tatsachen zu bleiben.
Um die Erde endgültig zu beherrschen, greift Thanos die Erde an. Er will die Avengers vernichten und somit die Hoffnung auf Erden zerstören. Doch die Avengers entdecken, dass sie nicht nur acht Helden sind – sie sind ein Vorbild für alle.