Severide wird das Kommando über die Einheit entzogen, weil dort eine zu hohe Personalfluktuation herrscht. Zwar ist Chief Boden bereit, Severide mit Führungsschulungen zu unterstützen, doch bis dahin wird Dallas Patterson die Truppe leiten. Nachdem Casey bei einer Undercover-Aktion knapp dem Tod entgangen ist, überdenkt er sein Leben und möchte einen Neuanfang mit Dawson wagen. Die eröffnet ihm, dass sie schwanger ist.
Bei den Untersuchungen rund um den Brand des Crack-Hauses überschlagen sich die Ereignisse und Boden riskiert dabei seinen Job. Dawson lanciert die Information, wo Beweise dafür zu finden seien, dass das Feuer kein Unfall war. Zwischenzeitlich haben sich einige Zeugen entschlossen, doch nicht auszusagen. Während Severide immer noch damit hadert, dass Patterson jetzt das Team leitet, läuft es privat gut für ihn, denn es bahnt sich eine Beziehung mit der Anwältin Jamie Killian an.
Gerade als die internen Ermittlungen rund um den Crack-Haus-Brand und die Beteiligung der Feuerwehr zu eskalieren drohen, erreicht das Team ein Notruf aus genau dieser Gegend. Der Einsatz veranlasst einen der Zeugen, seine Haltung zu überdenken und das Department 51 zu entlasten. Zwischenzeitlich findet Dawson Beweise, dass der zwielichtige Immobilienhai Roger Maddox hinter der Brandstiftung steckt. Dass ausgerechnet seine Freundin Jamie Maddox vor Gericht vertritt, ist für Severide ein unverzeihlicher Vertrauensbruch.
Nach ihrem Zusammenbruch im Zusammenhang mit den gestohlenen Beweisen wird die schwangere Dawson bewusstlos mit inneren Blutungen ins Krankenhaus eingeliefert. Severide geht derweil dem Verschwinden der Beweismittel aus Dawsons Büro nach und ist sich sicher, dass es einen Maulwurf geben muss. Schon bald wird klar, wo die undichte Stelle in der Abteilung ist. Währenddessen ist, zum Leidwesen aller Feuerwehrleute, das „Molly’s“ von einer Schließung bedroht.
Nachdem ein Feuer die Pläne für die Hochzeitsfeier eines Paares aus der Nachbarschaft zunichte gemacht hat, bietet Boden spontan an, die Feier in die Feuerwache zu verlegen. Damit ist Chief Riddle, der seine politischen Ambitionen gefährdet sieht, jedoch nicht einverstanden. Ebenso wenig gefällt ihm Severides Gesuch, wieder auf seinen alten Posten zurück zu dürfen. Dawson nimmt, nachdem sie ihr Kind verloren hat, ihre Arbeit wieder auf. Abends im „Molly’s“ kommen sich Borelli und Chili sehr nahe.
Die Atmosphäre im Department 51 ist alles andere als freundlich. Alle leiden unter ihrem neuen Vorgesetzten Captain Patterson, insbesondere Severide. Als der in einer brenzligen Einsatzsituation einen Befehl Pattersons missachtet, ist das für ihn ein willkommener Anlass, Severides Entlassung zu fordern. Mouch bekommt als Dank für einen Einsatz von einem Roadie der Gruppe „Rush“ Konzerttickets geschenkt. Zusammen mit Otis, Casey und Herrmann trifft Mouch die Band backstage.
Captain Patterson suspendiert Severide für einen Tag. Severides Vater Benny möchte, dass sein Sohn etwas gegen Patterson unternimmt und schlägt vor, in dessen Vergangenheit nach etwas Belastendem zu suchen. Als sich Severide dagegen sträubt, nimmt sein Vater die Sache selbst in die Hand. In der Zwischenzeit scheint Chief Riddles Verschwörung gegen Chief Boden Wirkung zu zeigen. Mithilfe gefälschter Beweismittel sieht sich Boden in die Enge getrieben.
Die Verschwörung um Boden nimmt immer merkwürdigere Züge an. Inzwischen glaubt der Chief, dass der Immobilienhai Maddox etwas mit der Sache zu tun haben könnte. Währenddessen versucht auch Severide Licht ins Dunkel zu bringen und sucht seine Exfreundin Jamie auf, die als Anwältin für Maddox arbeitet. Die behauptet, nichts zu wissen, was ihr Severide allerdings nicht glaubt. Derweil beschließt Otis, wieder mehr am gesellschaftlichen Leben teilzunehmen und fragt Brett nach einem Date.
Chief Riddle scheint am Ziel zu sein, als Boden verhaftet und Patterson dessen Nachfolger geworden ist. Inzwischen hat die Schmutzkampagne, hinter der ganz augenscheinlich Maddox steckt, auch Dawson erreicht: Sie wird mit einem Video belastet. Gerade zur rechten Zeit scheint sich Severides Freundin Jamie eines Besseren besonnen zu haben und hilft mit einem wichtigen Hinweis. Chili und Borrelli geraten derweil in eine peinliche Situation.
Nachdem er im „Molly’s“ von Freddy Clemente niedergestochen wurde, wird Christopher Herrmann ins Chicago Med gebracht. Er hat eine Menge Blut verloren und muss notoperiert werden. Dr. Rhodes und Schwester April kümmern sich um ihn, während Dawson außer sich ist vor Sorge. Severide ist mittlerweile wieder zurück auf seinem Posten, derweil sich Borelli zunehmend wegen Chilis unberechenbarem Verhalten Sorgen macht.
Chicago bereitet sich auf einen verheerenden Wirbelsturm vor. Gleichzeitig tritt der von der Messerattacke genesene Herrmann trotz der Bedenken seiner Frau wieder zum Dienst an. Chilis unberechenbares Verhalten hat Folgen, als sie bei einem Einsatz fast jemanden tötet. Dawson und Brett melden Boden den Vorfall. Als der Sturm schließlich die Stadt erreicht, ist es ausgerechnet Herrmanns Wohngegend, die besonders betroffen ist. Der Feuerwehrmann macht sich große Sorgen um seine Familie.
Als Herrmann vor Gericht gegen Freddy Clemente aussagen soll, tritt dessen Vater auf den Plan und bittet für seinen Sohn inständig um Vergebung. Casey kämpft für den Erhalt einer Behelfsunterkunft, die für die obdachlos gewordenen Opfer des letzten Tornados bereitgestellt worden war und nun abgerissen werden soll. Derweil müssen Dawson (Monica Raymund) und Brett (Kara Killmer), die Chili bei Boden gemeldet hatten, mit den Folgen dieser Denunziation leben.
Durch eine Massenschießerei gerät die Feuerwache 51 in eine äußerst gefährliche Situation. Unterdessen fahndet Casey nach dem verschwundenen Geld einer Spendenaktion für die Opfer eines Wirbelsturms und Jimmy Borelli erklärt sich bereit, die Wache in einem Boxkampf gegen die Polizisten vom 21. Distrikt zu vertreten.
Severide konfrontiert Chili mit dem merkwürdigen Verhalten, das sie in letzter Zeit an den Tag gelegt hat. Währenddessen tritt Jimmy Borelli im Boxring gegen Antonio Dawson in der jährlichen „Battle of the Badges“ an. Außerdem sind die meisten Feuerwehrleute der Wache 51 der Meinung, dass Casey ein idealer Kandidat für den Stadtrat wäre.
In der Feuerwache 51 geht ein seltsamer Anruf einer benachbarten Feuerwache ein. Die ungewöhnlichen Umstände veranlassen Severide und Cruz, die Untersuchung der Angelegenheit selbst in die Hand zu nehmen. Die Feuerwehrleute begrüßen mit Stella Kidd eine neue Kollegin. Deren Verpflichtung wirkt sich auf die gesamte Feuerwache aus. Inzwischen macht Casey Fortschritte bei der Bewerbung um den Stadtratsposten. Er muss allerdings feststellen, dass einige der potenziellen Wähler spezielle Forderungen an ihn haben.
Caseys politischer Gegner in der Wahl zum Stadtrat kämpft mit schmutzigen Tricks. Nachdem Casey sich mit einer stadtweiten Schmutzkampagne auseinandersetzen muss, überlegt er, seine Kandidatur zurückzuziehen. Trudys Bruder plant Mouchs Junggesellenabschied, während Sylvie Brett und Jimmy Borelli sich als neue Partner zusammenraufen. Das Team versucht derweil, einen Mann zu befreien, der in einem brennenden Fahrzeug eingeschlossen ist.
Als Severide und Cruz überprüfen, ob es in einem Haus durch eine defekte Gasleitung zu einem Kohlenmonoxid-Unfall gekommen ist, machen sie eine grausige Entdeckung. Im Kamin finden sie die sterblichen Überreste eines Kindes. Severide glaubt, dass es sich um ein vor Jahren als vermisst gemeldetes Kind handelt. Casey wird dafür kritisiert, dass er neben seiner Arbeit als Feuerwehrmann zusätzlich im Stadtrat tätig werden will. Dawson veranstaltet im Molly's eine Party für Casey.
Sylvie ist zufällig Zeugin eines Mordes geworden. Nun wird sie von dem Täter bedroht. Er will sich an ihr rächen, falls sie zur Polizei gehen sollte. Sylvie erhofft sich Hilfe von Antonio vom Chicago Police Department. Währenddessen muss das Team der Feuerwache 51 zu einem Großeinsatz ausrücken. In einem Restaurant ist ein Feuer ausgebrochen und einige Gäste wurden in einem Raum des Gebäudes von den Flammen eingeschlossen. Indes bekommt Mouch kurz vor seiner Hochzeit kalte Füße.
Ein Schüler wurde bei einer Schießerei unter Gangmitgliedern tödlich verwundet. Casey ist fest entschlossen, den Täter zu finden. Unterdessen kümmert sich Severide um den neunjährigen Sohn von Detective Holloway, die mit einem Undercovereinsatz in der Feuerwache 51 beschäftigt ist. Otis macht eine überraschende Entdeckung, während Herrmann und Stella darüber streiten, wer besser eine Bar betreiben kann.
Während Severide weiterhin auf den kleinen Sohn von Detective Holloway aufpasst, die bei Gericht aussagt, zwingt ihn eine plötzlich veränderte Situation, mit den Folgen fertig zu werden. Die Besatzung der Feuerwache rückt zu einem Brand in einer Kunstgalerie aus, in der ein Mensch eingeschlossen ist. In dem allgemeinen Chaos muss Cruz eine schnelle Entscheidung treffen. Casey bekommt ein verdächtiges Paket. Währenddessen wirft Brett Otis vor, sich nicht um die wichtigen Dinge in seinem Leben zu kümmern.
Dawson kümmert sich um einen Jungen, den sie aus einer brennenden Wohnung gerettet hat. Als Severide bei dem Versuch, neue Schutzmasken für das Team zu besorgen, an seine Grenzen stößt, bittet er Casey, seinen politischen Einfluss geltend zu machen und ein paar Fäden zu ziehen. Cruz und Brett greifen zu einem Trick, um Otis dazu zu bringen, sein Blut untersuchen zu lassen. Währenddessen endet Kidds großartige Idee für das „Molly’s“ in einem Desaster.
Die Besatzung von Firehouse 51 fährt zu einem Einsatz, bei dem Dutzende Menschen in den Trümmern eines einstürzenden Gebäudes eingeschlossen wurden. Chief Boden muss unter großem Zeitdruck Entscheidungen über Leben und Tod treffen. Dawson kämpft mit aller Kraft gegen bürokratische Hürden, um etwas für Louie zu erreichen. Dabei bekommt sie unerwartet Hilfe. Severide und Kidd treffen sich weiterhin auch außerhalb der Feuerwache, während es zwischen Casey und Antonio zu Spannungen kommt.
Jimmy Borelli und Lt. Wallace Boden sind sich nicht einig, was die Bewertung der jüngsten Ereignisse angeht. Andernorts wird Casey von seiner neuen Politberaterin Susan Weller dazu aufgefordert, in größeren Kategorien zu denken. Während Kidd (Miranda Rae Mayo) sich mit ihrem unzuverlässigen und labilen Ex Grant auseinandersetzen muss, kämpft Dawson nach wie vor um die Pflegschaft für den kleinen Louie.