Staffel 3

Die EOS-7-Raumstation wurde zerstört, während ZWEI, FÜNF und SECHS noch an Bord waren. ZWEI und SECHS entkommen der Explosion im Shuttle, doch der wird beschädigt und treibt bald ziellos durchs All. DREI, der von Lt. Anders in eine Fluchtkapsel gezogen wurde, befindet sich nun auf einem nahegelegenen, verlassenen Planeten in Haft. FÜNF und Truffault finden sich unterdessen auf einem Volkov-Rusi-Zerstörer wieder, der von ihren Rivalen ins Visier genommen wird.

Zurück auf der Raza wendet die Crew ihre Aufmerksamkeit Ryo Ishida und dem gestohlenen Blink Drive zu. Es gelingt ihr, Ishidas geheime Forschungsstation zu orten. Als ZWEI, DREI und SECHS sie betreten, geht jedoch etwas schief. Die Einrichtung wird in eine Region transportiert, in der die Regeln der Physik nicht gelten. Unterdessen erlebt FÜNF auf der Raza Flashbacks zu ihrem Leben vor der Gedächtnislöschung, während der Android versucht, die verlorenen Crewmitglieder zu orten.

Die Raza erhält einen Notruf von Tabor. Als die Crew ankommt, ist er jedoch nirgendwo zu finden. Stattdessen erwartet sie sein früherer Assistent Adrian in einer äußeren Kolonie mitten in einer Pattsituation mit ihrem Gegner, der Traugott Corp. SECHS und ZWEI sind sich nicht einig darüber, ob sie eingreifen und für die Minenarbeiter kämpfen sollten. Als der Konflikt am Boden eskaliert, wird ihnen die Entscheidung abgenommen.

Ohne dass die restliche Crew es bemerkt hat, steckt DREI in einer Zeitschleife fest und erlebt denselben Tag immer und immer wieder. Er muss sein Team davon überzeugen, was mit ihm passiert, und einen Weg finden, aus der Schleife zu entkommen. Unterdessen hat ein mysteriöser Söldner die Raza infiltriert, und DREI muss mit Sarahs neuer Realität zurechtkommen.

Eine Freundin von Adrian wird von einem Rivalen Tabors gefangen genommen. Im Austausch für ihre Freilassung verlangt er eine ganz bestimmte Datei. Die Crew entdeckt, dass die Datei Informationen über die Konstruktion einer geheimen Kampfflotte der Ferrous Corp enthält, und will helfen. Das Problem ist nur, dass Adrian sich nicht ganz sicher ist, wo Tabor die Datei versteckt hat.

Die Crew der Raza aus der alternativen Realität, Portia, Boone, Tash, Wexler und der alternative Android, stiehlt einen Ishida-Cruiser und hintergeht Commander Truffault. Als die reguläre Crew herausfindet, was die alternative Crew angerichtet hat, wird ihnen klar, dass sie sich mit ihren Doppelgängern auseinandersetzen müssen. Sie nutzen Adrian als Vermittler und wollen die alternative Crew dingfest machen, doch die gibt nicht so leicht auf.

SECHS ist zurück auf der Raza, nachdem er vor dem Fallout eines Chemiewaffenangriffs gerettet wurde. Während er sich auf dem Raumschiff erholt, hat er immer wieder Flashbacks von seinem Leben vor der Gedächtnislöschung. Diese Erinnerungsfetzen und das seltsame Verhalten seiner Crew lassen SECHS an seiner Realität zweifeln.

Ferrous Corp. führt einen Angriff auf ein Meeting in den äußeren Kolonien durch, doch die Führungsriege kann mit SECHS zurück auf die Raza fliehen. Als man einen von ihnen tot in seinem Quartier auffindet, wird die Crew misstrauisch gegenüber den Neuzugängen. Unterdessen stellt FÜNF fest, dass der Android sich merkwürdig verhält. Bevor sie dem jedoch auf den Grund gehen kann, wird das Schiff abgeriegelt und Ryo trifft ein, um den Blink Drive zurückzufordern.

Der Blink Drive startet selbsttätig und transportiert die Raza fast 600 Jahre in die Vergangenheit. Da es keine Aufzeichnung zu anderen Zivilisationen zu dieser Zeit gibt, entscheidet die Crew, die Erde aufzusuchen, um ihre Vorräte aufzustocken. Als sie sich bereits in der Erdumlaufbahn befinden, entdeckt der Android (Zoie Palmer), dass aus einer kleinen Stadt in Wisconsin ein Subraum-Signal gesendet wird, dass identisch mit dem des Blink Drives ist. Um das Phänomen zu untersuchen, bezieht die Crew ein Haus in der Vorstadt. Sie ziehen die Aufmerksamkeit einer Gruppe Jugendlicher auf sich.

Victor und zwei andere upgegradete Androiden brauchen Hilfe, die Janah-12-Spacestion zu verlassen, nachdem sie einen Zusammenstoß mit einem ihrer früheren Besitzer hatten. Die Raza bringt sie an einen Zufluchtsort, wo sie den Schöpfer des Upgrades treffen. Der hat neue Informationen über ZWEI und über die Vergangenheit der Androiden.

Die Crew nutzt eine Information, die aus den Erinnerungen des Androiden gewonnen wurde. Die führt sie nach Nova-17, wo man einen Dwarf-Star-Posten vermutet. Als sie in die Umlaufbahn eintreten, beginnt DREI, seltsame Träume zu haben, und wird zunehmend aufgewühlt. Als die Crew den Ort untersucht, stellt sie fest, dass es sich um eine Lagereinrichtung für Hunderte von künstlichen Menschen handelt, die Ähnlichkeit mit ZWEI haben. Bevor sie das näher untersuchen können, trifft ein Mikkei-Zerstörer ein.

ZWEI ist von Ryo gefangen genommen worden. Damit will er die Crew der Raza zwingen, ihm den Blink Drive auszuhändigen. DREI, FÜNF und SECHS nutzen Transfer Transit, um nach Zairon zu reisen und zu versuchen, zu einer Einigung zu kommen. Ryo versucht, seine früheren Kollegen zu überzeugen, ihm den Blink Drive auszuhändigen. Die Umsetzung seiner Pläne wird jedoch von Gegnern in den eigenen Reihen erschwert.

Die Crew der Raza entdeckt den tatsächlichen Standort von Project Phoenix. In dem Versuch, Ferrous einen tödlichen Schlag zu versetzen, überzeugt sie Commander Truffault, dass die Zeit zum Handeln gekommen ist. Zusammen schmieden sie einen Plan, die Werft zu zerstören, bevor die neue Ferrous-Flotte eingesetzt werden kann. Jemand hat jedoch ein doppeltes Spiel getrieben, was dazu führt, dass ZWEI, DREI und SECHS gefangen genommen werden. Um zu entkommen, müssen sie sich auf einen Spion innerhalb der Ferrous-Einrichtung verlassen.