Joshua Nolan (Grant Bowler) und Irisa (Stephanie Leonidas) konnten gerade noch rechtzeitig aus ihrer unterirdischen Gefangenschaft befreit werden, um herauszufinden, dass feindliche Truppen in Richtung Stadt marschieren.
Nolan (Grant Bowler) und Irisa (Stephanie Leonidas) müssen eine mysteriöse Alien-Rasse, die so genannten "Omec", unterstützen, um eine diplomatische Krise zu überwinden, die zur Zerstörung der Stadt führen könnte.
Bürgermeisterin Amanda Rosewater verhandelt mit den Omec über die Zukunft der Stadt Defiance. Währenddessen kehren die Tarrs zurück und sehen sich vor die Entscheidung gestellt, wem gegenüber sie loyal sein wollen: Den Menschen, den Omec oder dem Votanis-Kollektiv.
Jessica "Berlin" Rainer untersucht einen Bombenanschlag, den das Votanis-Kollektiv im Zentrum von Defiance verübt hat. Währenddessen nimmt Stahmas geheim gehaltenes Verhältnis mit T'evgin, dem mysteriösen Omec-Anführer, eine überraschende Wendung.
Amanda und Doc Yewll müssen die Hilfe der Omec in Anspruch nehmen, während Datak und Stahma den entscheidenden Schritt gegen General Rahm Tak vom Votanis-Kollektiv in die Wege leiten.
Joshua Nolan und Jessica "Berlin" Rainer verfolgen die Tarrs, nachdem deren Verbindungen zum Votanis-Kollektiv aufgedeckt wurden. Derweil sieht Alak Tarr seiner Zukunft als Vater ins Auge.
Ein Waffenhändler auf der Durchreise sorgt für etwas Unruhe, was zur Folge hat, dass es zwischen Amanda (Julie Benz), Nolan (Grant Bowler) und Berlin (Anna Hopkins) zu Uneinigkeit kommt. Während Nolan Probleme hat, die Miliz auf die Beine zu stellen, sorgt Stahmas (Jaime Murray) Anwesenheit andernorts für etwas Ärger. Datak (Tony Curran) und Alak (Jesse Rath) machen derweil eine lehrreiche Erfahrung.
Defiance wird belagert, also müssen Nolan (Grant Bowler), Amanda (Julie Benz), Irisa (Stephanie Leonidas) und die gesamte Miliz die Stadt bis aufs Blut gegen das Votanis-Kollektiv verteidigen. Datak (Tony Curran) erinnert sich unterdessen an die harten Lehrstunden seines Vaters und trifft dann eine wichtige Entscheidung, während sich Stahma (Jaime Murray) auf eine unerwartete Reise begibt.
Nach einem brutalen Mord suchen Nolan (Grant Bowler) und Irisa (Stephanie Leonidas) nach dem ungewöhnlichen Biest. Doc Ywell (Trenna Keating) untersucht indes das Opfer, während Amanda (Julie Benz) den Neuankömmling Stahma (Jaime Murray) nicht willkommen heißen will. T'evgin (Conrad Coates) findet unterdessen etwas über seine Tochter heraus.
Amanda (Julie Benz) heißt eine Delegation des Votanic Collective in Defiance willkommen. Unterdessen wird die Loyalität von Stahma (Jaime Murray) auf eine harte Probe gestellt. T'evgin (Conrad Coates) arbeitet indes daran, sich an das Leben auf der Erde zu gewöhnen.
Kindzi (Nichole Galicia) befreit Nolan (Grant Bowler) aus den Fängen der VC, während sie ihn nach Südamerika transportieren, um dort ein Gerichtsverfahren abzuhalten, statt ihn in den Händen der Feinde sterben zu lassen.
Nolan (Grant Bowler), Amanda (Julie Benz) und Irisa (Stephanie Leonidas) suchen nach einem Weg, den unverwundbaren Kindzi vom Aufwachen abzuhalten und bringen mehr Omec auf die Erde. Datak (Tony Curran) scheint aus dem tödlichen Compound zu entkommen. Stahma (Jaime Murray) fleht Alak (Jesse Rath) um Vergebung an, bevor es zu spät ist.
Das Team sieht ein, dass eine mögliche Selbstmordmission der einzige Weg ist, die Omec-Bedrohung auf der Erde ein für alle Mal zu beenden.