Der Mönch William von Baskerville und sein Novize Adson reisen in wichtiger Mission zu einem einsamen Kloster in Norditalien. Dort geschehen rätselhafte Morde, die sie sofort unter die Lupe nehmen.
William und Adson vermuten, dass ein Serienmörder für die Todesfälle verantwortlich ist. Eine Spur führt in die verschlossene Bibliothek. Unterdessen nähert sich die Papst-Delegation dem Kloster.
William und Adson gelingt es nach und nach, Venantius’ Botschaft zu entschlüsseln. Es mehren sich zudem Hinweise, dass sich in dem Kloster ehemalige Anhänger des Ketzers Fra Dolcino aufhalten.
Während die Suche nach Berengar andauert, wächst im Kloster die Angst. Zwischen Benno, Berengar und Venantius scheint es eine seltsame Verbindung zu geben. William wagt sich erneut in die Bibliothek.
Zwischen den Delegationen der Franziskaner und des Papstes kommt es zur ersten Auseinandersetzung. Bernardo Gui vermutet Ketzer unter den Mönchen des Klosters. Adson kehrt zum Mädchen im Wald zurück.
Williams Beitrag in der Debatte wird von einer schlimmen Nachricht unterbrochen: Ein weiterer Mord ist geschehen, und es gibt bereits einen Verdächtigen. Adson sucht nach dem vermissten Mädchen.
Bernardo Gui fordert die Verurteilung des Mönches, den er der Ketzerei bezichtigt. Unterdessen ermitteln William und Adson weiter und wagen sich ein weiteres Mal in die verbotene Bibliothek.
Bernardo Gui will mit seinen Gefangenen abreisen. William und Adson machen in der Bibliothek eine Entdeckung, die alles verändert – und schließlich in einer gigantische Katastrophe mündet.