Auf der Straße begegnet Yumi und Naeko Takagi und wundern sich, da er eigentlich noch arbeiten müsste, doch er entgegnet ihnen, dass er früher aufgehört habe. Er hätte noch etwas zu erledigen, will jedoch nicht verraten, worum es dabei geht. Später sitzt Takagi am Flughafen, wo er in seinem Notizbuch ein Bild anschaut und mit Weinen beginnt.
Die Detective Boys erhielten ein Päckchen von einem fremden Mann, das sie Sato übergaben. Es beinhaltete einen Tablet PC, auf dem eine Liveübertragung zu sehen war, die den gefesselten Takagi zeigt, der sich auf einem Brett in größerer Höhe befindet. Hauptkommissar Matsumoto fragt Megure nach den Familienangehörigen der drei Frauen, die vor etwa einem Jahr Selbstmord begingen. Yuko Tokugi wurde in Kōchi geboren, doch ihre Familie zog vor Kurzem um, sodass deren aktueller Aufenthalt nicht mehr bekannt ist. Natalie Kuruma wurde in Hokkaidō geboren und ihre Mutter starb bei einem Autounfall. Der familiäre Hintergrund des dritten Selbstmordopfers, Hikoe Kyoka, ist nicht bekannt, jedoch soll sie in einem Dialekt aus der Region Hakata gesprochen haben. Plötzlich bewegt sich das Bild der Kamera. Die Polizisten gehen von einem Erdbeben aus und rufen sofort die zuständige Behörde an, um herauszufinden, wo gerade eines aufgetaucht ist. Diese teilen ihnen jedoch mit, dass es im Moment keines gibt, sodass die Polizisten davon ausgehen, dass Takagi sich womöglich im Ausland befindet. Dann hört das Wackeln jedoch auf und eine Krähe erscheint im Bild. Diese war es wohl auch, die die Kamera in Bewegung gebracht hatte. Hauptkommissar Matsumoto gibt nun die Anweisung, sich auf die Selbstmordfälle zu konzentrieren, da er den Täter aus diesem Umfeld vermutet.
Natalie Kuruma, die Selbstmord beging, verstarb gegen zehn Uhr und die Polizei geht davon aus, dass zu diesem Zeitpunkt die Bombe unter dem Brett explodieren wird, sodass ihnen nur noch 18 Stunden bleiben. Als der Sprengstoff droht in die Tiefe zu stürzen, verhindert Inspektor Takagi dies und holt ihn auf das Brett zurück. Seine Kollegen gehen daraufhin davon aus, dass sich um ihn Menschen befinden, die er nicht durch eine Explosion in Gefahr bringen will.
Ein Mann sitzt vor seinem Fernseher und trinkt Bier, dabei erhält er eine Nachricht auf seinem Handy. In einem anderen Raum trinkt eine Frau ihren Kaffee und erhält ebenfalls eine Nachricht. Ein weiterer Mann erhält eine Nachricht auf seinem Mobiltelefon, als er gerade vor seinem PC eine Zigarette raucht.
Durch Zufall gelangten Conan und Takagi an einen Tatort, an dem ein Mann eben aus seiner Wohnung in den Tod gestürzt war. Sie entdeckten dabei drei Verdächtige, die allesamt in der Firma des Toten gearbeitet haben. Um ihre Unschuld zu überprüfen, betraten sie die Wohnungen der Verdächtigen. In der ersten zeigte ihnen der Fotograf Keisuke Ogino ein Glas Bier, in dem sich noch immer Schaum befindet. Die zweite Verdächtige, die Redakteurin Kaori Tsukihara, zeigte ihnen ihren noch dampfenden Kaffee und der Journalist Kazutomo Sodesaki konnte eine noch rauchende Zigarette vorweisen. Diese drei Gegenstände verschaffen jedem der Verdächtigen scheinbar ein Alibi, Tod von Daisaku Katsumoto so lang her war, dass Schaum, Dampf oder Rauch bereits verschwunden gewesen wären, wenn einer der drei Verdächtigen der Täter gewesen wäre.
Ein Lieferwagen des Fuchs Paketdienstes enfernt sich von einem Haus, woraufhin eine Bombe im Haus explodiert und ein Mann leblos am Boden liegen bleibt. Zwei Stunden später explodiert erneut eine Bombe, nachdem der Lieferwagen ein Paket brachte. Mao Misawa läuft ihrem entlaufenen Hund Candy hinterher. Der Hund kommt zu einem Lieferwagen und springt in das Innere. Kurz bevor das kleine Mädchen den Wagen erreicht, schließen sich die Türen und der Wagen fährt los. Die Detective Boys stehen vor dem Eingang der Detektei Mori und unterhalten sich. Mao läuft auf die Gruppe zu und wirft sich weinend in Ayumis Arme. Es stellt sich heraus, dass es sich bei dem Mädchen um Ayumis Nachbarin handelt. Mao erzählt ihnen vom Verschwinden ihres Hundes und die Detective Boys versprechen ihr bei der Suche zu helfen.
Professor Agasa besucht gemeinsam mit Conan und den Detective Boys ein Eis-Festival. Dort treffen sie auf die Exekutivkomiteevorsitzende Mika Itakura, die Agasa eingeladen hat. Die Detective Boys erfahren, dass Frau Itakuras Vater ein alter Freund von Professor Agasa war. Der ehemalige Bürgermeister des Dorfes verstarb bei einem Autounfall vor einem Jahr, da die Bremsen an seinem Wagen versagten. Auf dem Gelände treffen sie auf den Eisbildhauer Tetsuya Shiota. Frau Itakura erzählt, dass die meisten Eisskulpturen von ihm stammen. Herr Shiota weist darauf hin, dass die Dorfbewohner ihn unterstützen. Der neue Bürgermeister Taro Yamaguchi erscheint und verkündet der Gruppe, dass das Fest dieses Jahr zum letzten Mal stattfinden wird. Frau Itakura weist den Bürgermeister daraufhin, dass er dies nicht entscheiden kann. Doch der Sekretär Kazuyuki Ogi klärt sie auf, dass das Ende des Festivals bereits beschlossen ist. Herr Yamaguchi will an Stelle des Festivals ein Hotel bauen. Mit der geplanten Vertragsunterzeichnung sollen die Finanzen gesichert werden. Er gesteht, dass er froh über den Tod Herrn Itakuras ist.
Inspektor Takagi beschließt nach einem Frühstück die Strecke zurück zu joggen. Auf seinen Weg trifft er eine andere Joggerin, doch als er sie grüßt, läuft diese sofort schneller. Takagi überholt die Frau und läuft weiter. Kurz darauf entdeckt er eine Tasche mitten auf dem Weg. Als er sich gerade nach der Tasche bückt, kommt die Joggerin von vorher hinzu. Takagi öffnet die Tasche und stellt erstaunt fest, dass diese voller Geldscheinen ist. Takagi bringt die Tasche zusammen mit der Frau ins Fundbüro. Dort wird festgestellt, dass sich in der Tasche 30 Millionen Yen befinden. Takagi erkundigt sich, ob jemand nach der Tasche sucht, doch dies ist nicht der Fall. Nachdem Frau Sasamoto erfährt, dass Takagi Inspektor ist, entschuldigt sie sich für ihr Misstrauen. Takagi erfährt, dass Frau Sasamoto jeden Tag diese Strecke läuft.
An einem regnerischen Abend sind Conan, Ran und Kogoro mit dem Auto auf dem Weg zu der Villa des Bildhauers Tsuge Hikari. Auf Rans Nachfrage bestätigt Kogoro, dass es sich bei Tsuge um denjenigen handelt, dessen Freundin ihn vor einiger Zeit engagieren wollte, um zu überprüfen ob er noch eine weitere Freundin hat. Doch Kogoros Klientin Kaoru Sasamori ist bei einem Sturz vor drei Monaten ums Leben gekommen. Kogoro erinnert sich dabei an die Trauerfeier zurück, an der er ebenfalls teilgenommen hatte. Dort hatte Kaorus Bruder Takashi eben jenen Bildhauer und Kaorus ehemaligen Freund, zu dessen Villa sie gerade fahren, des Mordes an seiner Schwester beschuldigt. Nun hat Tsuge sie wiederum eingeladen, um ihnen die Identität des wahren Mörders mitzuteilen.
Vor zehn Jahren erregte ein Fall in den Medien große Aufmerksamkeit. In Zusammenarbeit mit dem Schriftsteller Yusaku Kudo, ermittelte die Polizei um Juzo Megure und Kogoro Mori und ging von einem Mord aus, da mit dem Blut des Opfers das Schriftzeichen für Tod geschrieben wurde. Letztlich teilte Yusaku ihnen aber mit, dass die Zusammenarbeit beendet ist und er sich sehr sicher sei, dass dies kein Mordfall wäre. Er versicherte es ihnen auf seinem Namen Yusaku Kudo.
Im weiteren Gespräch schlägt Subaru Okiya vor, zuerst Yusaku Kudo zu dem Fall zu befragen und danach Kinichi anzurufen. Sera, die das Synonym Kinichi für Shinichi nicht kennt, plaudert aus, dass Shinichi in Wahrheit der Besitzer des Hauses und ein berühmter Schülerdetektiv ist. Aus diesem Grund erklärt Subaru den Mädchen, dass er dachte Shinichi wäre nur ein normaler Schüler, statt der Oberschuldetektiv, der als verstorben gilt. Sera widerlegt das Gerücht, weil sie bereits zwei Fälle über das Telefon mit Shinichi löste. Diese Tatsache lässt Subaru aufmerksam werden und er erfährt dann auch, dass Kinichi und Shinichi dieselbe Person ist. Daraufhin äußert Sera den Vorschlag Shinichi anzurufen und nach seiner Meinung zu dem Fall zu fragen. Sofort stürmt Conan aus dem Raum und gibt an, auf die Toilette zu müssen.
Kogoro telefoniert und wird von seinem Gesprächspartner zur Nihonbashi-Postfiliale bestellt. Der Mann bittet ihn in fünf Minuten ein Päckchen entgegenzunehmen. Kogoro rennt mit einer braunen Papiertasche zum vereinbarten Treffpunkt. Dabei wird er von mehreren Personen beobachtet. Während Kogoro einen Koffer annimmt, kommt Conan mit seinem Solarskateboard bei der Filiale an. Conan rennt in das Gebäude und beobachtet unbemerkt wie Kogoro den Koffer etwas abseits öffnet. Er findet darin ein Funkgerät und einen Zettel. Mehrere Mitarbeiter der Firma „New Image“ welche sich auf den Import von amerikanischen Autos spezialisiert hat, wurden angegriffen und verletzt. Der Präsident der Firma Gen Ishida erhielt einen Drohanruf des Täters, der von ihm 24 Millionen Yen forderte. Vor fünf Tagen übernahm Kogoro den Fall. Conan beobachtet, wie Kogoro Geldbündel aus der Papiertüte in dem Koffer verstaut. Plätzlich erscheint Inspektorin Sato vor ihm und fragt, was er hier macht. Conan erklärt ihr, dass er zusammen mit Ran ins Einkaufzentrum gehen wollte, als er Kogoro sah. Sato ermahnt Conan, dass Kogoro aus beruflichen Gründen hier ist und ihn nicht stören soll.
Während Ran die Polizei verständigt, sieht Conan sich am Tatort um. Er bemerkt einen Behälter mit Schlaftabletten neben der Badewanne. Im Wasser schwimmt ein Blütenblatt, das aussieht wie eine gelbe Kirschblüte. Unerwartet erscheinen Inspektor Takagi und Inspektorin Sato in der Wohnung. Sato berichtet, dass ein registriertes Boot vom Heikyu-Fluss als gestohlen gemeldet wurde. Die Polizei fand das Boot in der Nähe mit Herrn Nishizawas Fingerabdrücken.
Die Detective Boys, Kogoro, Ran und Sonoko machen Urlaub in Kyoto. Dort besuchen sie, mit Ausnahme von Kogoro, zu aller erst ein Schokoladen-Geschäft, um dort regionale Schokolade zu erwerben. Doch leider sind die sogenannten "Kyoto Vögel" auf merkwürdige Weise verschwunden. Die Verkäuferin ist sich jedoch ziemlich sicher, dass am heutigen Morgen 40 Kisten von diesen geliefert wurden. Kurz darauf erscheint Kozo Umehara, der zuständige Lieferant und erzählt, dass auch viele der anderen Geschäfte keine Schokolade mehr haben. Herr Umeharas Angestellte können sogar noch weitere Geschäfte ausfindig machen, denen die Schokolade ebenfalls gestohlen wurde. Auch Kogoro erscheint etwas später und bietet seine Hilfe an.
Conan, Ran und Kogoro sind zusammen mit Yurika Suwayama auf dem Weg zum Suwayama-Weingut, auf dem sich viele Weinfelder befinden. Diese werden von Yurika und ihrem Mann Kengo Suwayama gepflegt. Gelegentlich kommt auch Tomoaki Mizumachi vorbei und hilft bei der Arbeit. Am Weinberg angekommen darf Kogoro ein Glas Wein kosten und trifft auf den Restaurant Manager Akihiro Yamaguchi, der zu Besuch ist, um einen Geschäftsvertrag mit Yurika abzuschließen. Allerdings ist Kengo, der den Vertrag fertig machen sollte, spurlos verschwunden. Kurz darauf erscheinen Tomoaki und Shuji Takashina, ein Arbeiter der Weinkellerei und erzählen, dass sie Kengo den ganzen Tag noch nicht gesehen haben. Allerdings hat er den unterschriebenen Vertrag zurückgelassen. Nachdem Tomoaki den Moris die Weinfelder gezeigt hat, bleibt Kengo weiterhin verschwunden und Yurika fängt an sich Sorgen zu machen.
Im Beika Stadtzentrum haben die Detective Boys an einem Blumenbeet mitgearbeitet. Dieses wurde jedoch von einer unbekannten Person verwüstet. Deswegen beschließen sie den berühmten Meisterdetektiv Kogoro Mori um Hilfe zu bitten und den Schuldigen zu finden. Beim Blumenbeet angekommen, zeigt sich Kogoro Mori sehr desinteressiert und kann nur knapp daran gehindert werden wieder zu gehen. Genta bemerkt einen fehlenden Ziegelstein in der Umrandung des Beetes, der von den Kindern selbst hergestellt wurde. Kurz darauf stoßen die zwei Mitarbeiterinnen vom Stadtzentrum Toshiko Yamazaki und Saki Okamura zur Gruppe. Die beiden bringen dabei die Stütze für einen Baum an. Plötzlich erscheint Ryunosuke Okuda und kritisiert, dass dies völlig falsch ist.
Kogoro neuste Klientin ist Misaki Yanai und besucht die Yanaiseibi Oberschule. Unter anderem besuchte sie dieselbe Grund- und Mittelschule wie Ran und Sonoko. Da sie glaubt, dass der Tod ihrer Schwester Nagisa Yanai kein Selbstmord war, möchte sie, dass Kogoro dies untersucht und der Polizei beweist, dass ihre Schwester umgebracht wurde. Misaki war einer der beiden Zeugin, die die Tat beobachtet hat und wurde bereits von der Polizei befragt. Kogoro ruft kurz darauf Kommissar Megure an und erfährt, dass es sich um einen Selbstmord handelt. Allerdings sieht dies Misaki anders und erzählt Kogoro alles über den Vorfall. So bat Misakis Lehrerin Harue Kodama sie vor fünf Tagen um 18:00 Uhr in die Schule zu kommen, um mit ihr etwas zu besprechen. Frau Kodama ist die Theaterlehrerin von Misaki und Nagisa und hatte Nagisa bereits eine wichtige Rolle für ein Theaterstück gegeben.
Als die Detective Boys in den Beika-Park gehen, entdecken sie einen toten Mann, der von einem Objekt erdrückt wurde, das einem UFO ähnelt. Wenig später erscheint Inspektor Takagi mit seinen Kollegen und nimmt die Ermittlungen auf. Conan erkennt währenddessen, dass die Lasche der Tasche des Opfers abgerissen wurde. Kurz darauf kann Inspektor Takagi neue Erkenntnisse zur Identität des Opfers liefern. Der Mann hieß Osamu Iwabuchi und lebte im Beika-Bezirk. Der Todeszeitpunkt beläuft sich auf ein Uhr. Zudem wurde er nach seinem Tod noch einmal von dem UFO zerquetscht, da er zwei Wunden an verschiedenen Stellen hat. Plötzlich erscheint der Physikprofessor Shozo Onuma und behauptet, dass das UFO Modell ihm gehöre und aus seinem Labor verschwunden ist.
Die Detective Boys fahren mit dem Professor zu einem Camping-Ausflug in die Präfektur Gunma. Da Conan erkältet ist, sucht Ai in ihrem Medizinkästchen nach passender Medizin. Conan findet somit heraus, dass Ai das Gegenmittel zum APTX 4869 immer mit sich rumträgt.
Professor Agasa fuhr mit den Detective Boys zum Campen nach Gunma. Als der Professor merkte, dass er seine Ausrüstung vergessen hatte, gingen er und Conan einkaufen, wobei sie auf Sera trafen, die sich den beiden sofort anschloss. In der Zwischenzeit sammelten Ai, Genta, Mitsuhiko und Ayumi Brennholz. Dabei hörten sie ein Geräusch und als die dessen Ursprung folgten, sahen sie, wie eine Gestalt eine weibliche Leiche vergrub. Auf der Flucht entdeckten sie eine Hütte, in der sie sich verstecken wollten. Dabei stießen sie auf eine blutige Axt. Die Kinder wollten die Hütte wieder verlassen, doch die Tür wurde inzwischen vom Täter von außen verschlossen. Zudem nahmen sie den Geruch von Rauch war und bemerkten, dass die Hütte zu brennen begann. In der Zwischenzeit hat auch die Polizei von Gunma unter der Leitung von Kommissar Yamamura die Leiche gefunden, wobei deren seltsame Handhaltung auffiel. Die Polizei konnte drei Verdächtige ausmachen. Conan entdeckte aufsteigenden Rauch, doch Yamamura meinte, dass dies wohl Camper seien, die ein kleines Feuer gemacht haben. Währenddessen breiten sich die Flammen in der Hütte immer weiter aus…
Gin und Wodka sind mit Gins Porsche unterwegs. Während der Fahrt telefoniert Gin mit Vermouth. Sie berichtet Gin über die Ergebnisse von Bourbons Recherchen, die besagen, dass das gesuchte Organisationsmitglied Sherry sich derzeit in Gunma versteckt hält und mit dem Bell Tree Express fahren möchte. Gin zeigt sich überrascht, dass Sherry mit der Mystery-Train fahren möchte, doch Vermouth bezeichnet dies als eine gute Möglichkeit für Sherry, unerkannt die Kanto-Region zu verlassen. Zugleich sind sie sich sicher, nun eine gute Möglichkeit gefunden zu haben, um Sherry erwischen zu können. Außerdem ist Gin erfreut darüber Vermouth wieder über Sherry sprechen zu hören, da er bereits befürchtet hat, sie wolle dieser gegenüber Gnade walten lassen. Vermouth bezeichnet dies als unsinnig und beendet das Gespräch. Zugleich erinnert sie sich an ihr Versprechen gegenüber Conan, Sherry nicht mehr zu verfolgen.[1] Sie denkt sich, dass es ja nun Bourbon ist, der sie verfolgt und nicht sie selbst.
Nach kurzer Zeit in der Kabine B von Waggon 8 gehen Conan und Masumi davon aus, dass der Tod von Herrn Murobashi nicht auf einen Selbstmord, sondern auf einen Mord zurückzuführen ist. Dem entgegnet Ran zwar, dass die Tür von innen verriegelt war und sie diese aufbrechen mussten, allerdings sind Masumi und Conan aufgrund verschiedener Indizien von einem Mord überzeugt. So spricht das Fehlen von Verbrennungen an der Eintrittswunde für einen Schuss aus größerer Distanz, außerdem befindet sich ein Schalldämpfer auf der Pistole, wodurch sie auch Sonokos Einwand, Herr Murobashi habe die Waffe von sich weggehalten, entkräften können. Um dennoch Schmauchspuren an der Hand des Opfers zu hinterlassen, hat der Täter ihrer Meinung nach Herrn Murobashi die Waffe in die Hand gelegt und dann in die gegenüberliegende Sitzbank geschossen, was eine Erklärung für das dortige Einschussloch wäre. Allerdings gehen die beiden auch davon aus, dass sich der Täter inzwischen die Schmauchspuren von den Händen gewaschen und seine Kleidung längst aus dem fahrenden Zug geworfen hat, was zugleich aber auch darauf hindeutet, dass sich der Mörder noch an Bord befindet.
Kogoro und Sera fragen Taisaku Noto aus Kabine A in Waggon 8 nach einem Feuer vor fünf Jahren, bei dem er zu den Überlebenden gehörte. Kogoro erinnert sich, dass Herr Noto bei ihrem ersten Aufeinandertreffen eine Tasche bei sich hatte und denkt, dass es sich dabei um ein Werkzeug gehandelt haben könnte, mit dem man einen Mord in einem verschlossenen Raum inszinieren kann. Herr Noto öffnet die Tasche und zeigt Kogoro den Inhalt. Es handelt sich nur um ein Shinai. Conan unterbricht das Gespräch und bittet den Mann einmal den Gang entlang zu laufen. Er erklärt, dass möglicherweise der Täter von hinten gefilmt wurde und will seine Unschuld damit überprüfen.
Conan klärt noch immer mit Kogoros Stimme den Mord an Etsuto Murobashi auf. Taisaku Noto wirft ein, dass Satoru Ando, den Kogoro als Täter identifiziert hat, nicht einfach ein zusätzliches Glied in die Sicherheitskette hätte einfügen können. Außerdem wäre der Plan missglückt, wäre die Lampe über seiner Kabine nicht defekt gewesen. Auch Mari Idenami argumentiert, dass sie nur den Zugbegleiter gerufen hat, da die Weckeruhr geklingelt hatte. Auch dies hätte der Täter nicht vorhersehen können. Doch Kogoro erwidert, dass der Zugbegleiter erwähnt hatte, dass die Uniform eines Kollegen fehlt, wofür auch Ando verantwortlich ist. Er verkleidete sich als ein Schaffner, um Vorbereitungen für den Mord treffen zu können und präparierte somit Kette, Lampe und Weckeruhr zuvor. Ando verteidigt sich nicht mehr und erzählt die Beweggründe für seine Tat. Vor etwa zwei Jahren erkannte er eines seiner Bilder auf einer Auktion wieder, obwohl dieses bei dem Feuer vor fünf Jahren hätte verbrannt sein müssen. Er fand heraus, dass der Besitzer des Gemäldes Murobashi war und schlussfolgerte, dass Murobashi das Gemälde damals stahl und anschließend das Feuer legte, um den Diebstahl zu vertuschen. Jedoch beachtete er dabei nicht, dass zahlreiche Menschen sterben würden. Ando wollte Murobashi eigentlich dazu bewegen, seine Tat zu gestehen, doch als dieser eine abfällige Bemerkung machte, die sich auf das Feuer von vor fünf Jahren bezog, bei dem auch Andos Frau starb, änderte er seinen Plan und entschied, Murobashi zu töten.
In Hiroshi Agasas Haus reflektieren Conan Edogawa und Ai Haibara die Ereignisse im Bell Tree Express, in denen die Organisation involviert war. Ai äußert sich verärgert darüber, zuvor nichts von dem Plan erfahren zu haben, ihren Tod inszenieren zu lassen, um so die Organisation zu täuschen. Der Professor weist daraufhin, dass die Anwesenheit der Organisation noch fraglich war und erst durch die Bestätigung von Vermouths Aufenthalt im Zug, der Plan in Kraft treten konnte. Die mutmaßliche Verwanzung des Abteils der Detective Boys soll den Austausch von Informationen erschwert haben. Nach dem Aktivieren des Rauchgases flüchtete somit Ai in das Abteil B in Waggon 8, in dem sich die Leiche des Ermordeten befand, und wurde von der dort wartenden Yukiko Kudo hingewiesen, ihr die weiteren Schritte zu überlassen. Ahnungslos über diese Vorgänge erhielt Ai von Conan ein Handy, mit dem sie Kaito Kid informierte, was er in der Verkleidung als Shiho Miyano dem Organisationsmitglied Bourbon zu sagen hatte. Conan sieht den positiven Effekt der Aktion in der Enttarnung des Kellners und Privatdetektiven Toru Amuro als Bourbon. Amuros derzeitiger krankheitsbedingter Urlaub im Café Poirot deutet auf keine Rückkehr, da er nun von Sherrys Tod überzeugt sein dürfte. Gleichwohl ist Conan bereit weitere Ermittlungen zu Amuros Person durchzuführen, sollte dieser erneut auftauchen.
Conan begab sich mit Kogoro, Ran und Sonoko auf einen Tennisplatz, wo sie Toru Amuro, dessen wahre Identität als Bourbon Conan nun kennt, begegneten. Nachdem Conan durch einen Schlag bewusstlos wurde, erholte er sich in einem Raum. Als er aufwachte, entdeckte er die Leiche von Saburo Ishiguri.
Als Conan, Ran und Kogoro in einem Restaurant essen, erhält Kogoro einen Anruf von Reiji Himuro. Herr Himuro beobachtet sie dabei von einem nahgelegenen Apartment. Kogoro erfährt schließlich, dass jemand wegen ihm sterben wird. Wenig später fällt ein Mann von einem Dach und wird von einem Polizisten gefunden. Conan bemerkt Herrn Himuro am Fenster und läuft mit Kogoro und Ran direkt dorthin. Sie treffen Herrn Himuro, einen ehemaligen Bankräuber, der ihnen erzählt alte Zeiten wieder aufleben zu lassen. Kogoro kennt Herrn Himuro bereits von früher. Plötzlich erscheint die Presse und fotografiert Kogoro und Himuro. Währenddessen wird der tote Mann, welcher Shingo Nuao heißt, regungslos gefunden. Er war Automechaniker bei der Firma Taiyo. Kommissar Megure, Inspektor Takagi und Inspektor Chiba leiten die Ermittlungen und können den Absprungsort des Mannes ausfindig machen. Es handelt sich um eine Feuertreppe bei der ein Stück des Geländers abgebrochen ist. Im Leichenhaus identifiziert Kogoro den Toten und erklärt, dass er ihn von früher kannte. Dank des Toten konnte er Himuro fangen. Herr Nuao war einige Zeit der Untergebene von Himuro, jedoch verriet er Himuro an die Polizei.
Als die Detective Boys in den Sommerferien von einem Ausflug mit Professor Agasa zurückkehren, beobachten sie während der Busfahrt zwei Gestalten, die sich auf dem Dach eines Gebäudes streiten. Als dann einer der beiden vom Dach gestoßen wird, steigen die Kinder und der Professor sofort an der nächsten Haltestelle aus und laufen zur Absturzstelle. Dort hat bereits eine Frau den schwer verletzten Mann bemerkt und einen Rettungssanitäter gerufen. Dieser ruft sofort die Polizei an, als die Detective Boys von ihren Beobachtungen erzählen. Wenig später finden sie heraus, dass der Mann Masaaki Ogata heißt und in Beika lebt.
Auf dem Heimweg kommen Conan, Ran und Kogoro an einem Wohngebiet vorbei, in dem viele Geschäfte abgerissen und neue gebaut werden. Als sie plötzlich ein lautes Geräusch von einer nahliegenden Baustelle hören, laufen sie direkt dorthin, um nachzuschauen. Dort sehen sie wie der Bauarbeiter Masao Kaneda versucht seinen Kollegen Yuji Inomata aus einem Berg herabgestürzter Rohren zu befreien. Während Conan, Kogoro und Naoki Murase helfen das Opfer zu befreien, ruft Ran den Krankenwagen. Allerdings ist Herr Inomata bereits tot. Als Kommissar Megure, Inspektor Takagi und Inspektor Chiba wenig später die Ermittlungen aufnehmen, stellt sich heraus, dass Herr Inomata der Besitzer der Baustelle war und dass am Gurt, der die Rohre festhielt, ein künstlicher Schnitt entdeckt wurde. Das Opfer wurde beim Rauchen von den Rohren überrascht. Da Herr Kaneda, Herr Nojima und Herr Murase die einzigen sind, die zur Tatzeit am Tatort waren, sind sie die Verdächtigen. Des Weiteren stellt sich heraus, dass Herr Kaneda Schulden bei Herr Inomata hatte. Aber auch Herr Nojima und Herr Murase hatten ein Motiv.
Heiji und Kazuha betreten die Detektei Mori und Heiji verkündet stolz, dass er und Shinichi einen Fall haben. Da dieser sich aber nicht in der Detektei befindet, löst das bei Ran Verwirrung aus und Heiji gerät in Erklärungsnot, redet sich jedoch leicht heraus. Heiji erklärt, dass sich der Tatort in Tokio befindet und Kommissar Otaki als Unterstützung dabei ist. Es handle sich bei dem Fall um einen Mord in einem verschlossenen Raum. Hidemichi Mizuki hatte sich in seiner Wohnung erhängt, während er unter polizeilicher Beobachtung stand, jedoch gab es Ungereimtheiten zu dem vermeintlichen Suizid, welche Kommissar Otaki jetzt klären möchte.
Nach der Befragung der Verdächtigen schlägt Kazuha vor Shinichi anzurufen und diesen um Hilfe zu bitten. Heiji fühlt sich daraufhin in seiner Ehre verletzt und sagt, dass man nicht zwei braucht um den Fall zu lösen. Daraufhin bekommen er und Conan einen Geistesblitz und sie glauben, den Trick des Täters erkannt zu haben. Inzwischen ist auch Kommissar Megure am Tatort angekommen und Kommissar Otaki schildert ihm die Ereignisse. Kogoro stellt die These auf, dass der Mörder Herrn Fuura von der Seite erschossen habe, als der Aufzug die entsprechende Etage erreicht hatte. Dem widerspricht Naoko Izutsu, die zusammen mit den beiden anderen Verdächtigen Isao Mutsu und Yoda Takurou von Conan zum Tatort zurückgeholt wurde. Nach Frau Izutsu hätte man nämlich den Arm des Täters durchs Fenster sehen können. Auch Kogoros zweite Theorie wird von Inspektor Megure schnell entkräftet.
Goro Otaki, Heiji und Kazuha verabschieden sich von Conan, Ran und Kogoro. Heiji und Kazuha gehen jedoch allein zum Bahnhof, um nach Osaka zurückzukehren, da Otaki noch etwas zu erledigen hat. Otaki fährt mit seinem Auto zu einer Villa. Er erinnert sich dabei an ein Telefonat mit Heizo Hattori, der ihn bat, an deiner Stelle zu einer Besprechung über eine Testamentsvereinbarung zu gehen. Am Ende seines Telefonats machte Heizo die merkwürdige Bemerkung, dass Otaki aufpassen soll, dass ihm nicht ebenfalls sein ganzes Blut ausgesaugt wird. Otaki wird von Heiji und Conan, die sich heimlich auf die Rückbank des Autos geschlichen haben, aus seinen Gedanken gerissen. Kogoro, Ran und Kazuha folgen ihnen mit einem geliehenen Auto. Otaki erklärt Conan und Heiji, um was für einen Fall es sich handelt. Vor einem halben Jahr wurde nahe der Villa die Leiche einer Frau, die ein Dienstmädchen in dem Haus war, im Wald gefunden. Sie war an den Füßen aufgehängt und hatte ein sehr blasses Gesicht. Heiji schließt sofort auf einen hohen Blutverlust, da eine Arterie durchtrennt wurde, doch Otaki erklärt, dass es keine große Wunde gab. Es wurden nur zwei kleine Einstichstellen an ihrem Nacken gefunden, woraufhin die drei sofort an Vampire denken müssen.
Die Angehörigen der Familie Torakura, außer Asanobu und Kamiyo Torakura, betrachten ungläubig das Bild, auf dem Hakuya Torakura, der eigentlich nicht im Raum war, zu sehen ist. Heiji und Conan leihen sich das Foto aus, um es Ran und Kazuha zu zeigen. Als sie jedoch mit der Haushälterin Hikaru Hinohara die Küche betreten, finden sie niemanden vor. Heiji spricht an, dass Hikaru die Tochter der Verlobten von Hakuya ist. Hikaru bestätigt dies und erzählt, dass ihre Mutter in Hakuyas Krankenhaus behandelt wurde. Hakuya übernahm auch die Arztkosten und kümmerte sich um sie. Vor einiger Zeit verstarb sie jedoch. Nachdem Hikaru die Universität beendet hatte, stellte der Hausherr sie ein. Heiji entdeckt eine große Menge Mehl auf dem Küchenboden und Conan ergänzt, dass es eine Stelle gibt, wo sich keines befindet. Er vermutet, dass dort zuvor etwas stand. Das Hauspersonal kommt in die Küche und berichtet, dass Ran und Kazuha in die Speisekammer gegangen sind, um Knoblauch zu suchen.
Heiji und Conan laufen sofort zur Küche, um Ran und Kazuha vor Hikaru und dem Inhalt des verschlossenen Kühlschranks zu schützen. Zur selben Zeit öffnet Kazuha mit dem Schlüssel das Schloss des Kühlschranks. Plötzlich erscheint hinter den beiden ein Schatten, vor dem sie sich erschrecken. Wenig später erreichen Heiji und Conan die Küche und sehen dort Hikaru, die eine große Menge Gyoza isst. Als sie den Kühlschrank ansprechen, zeigt Kazuha ihnen, dass dort lediglich eine große Dose Seegras aufbewahrt wird. Daraufhin beschließen sie mit den Familienmitgliedern in das Zimmer des Hausherren Hakuya zu gehen, da sie bereits die Hälfte der Geheimnisse aufgeklärt haben. Im Zimmer angekommen zeigen sie ihnen, dass Hakuya durch eine Geheimtür im Sarg und im Boden entkommen ist und dann in der Speisekammer ankam. Sie glauben, dass Hakuya sich weiterhin versteckt, um noch weitere Morde zu begehen. Derweil haben Ran und Kazuha für die anderen Gyoza zubereitet und rätseln darüber, was vorgefallen ist.
Hikaru erreicht mit dem Sake das Zimmer von Ruri, doch Kishiharu lehnt das Getränk ab, weil er es nur für die schlafende Ruri bestellt hat. Als Kishiharu jedoch das Zimmer verlässt, öffnet Ruri wieder ihre Augen. Im Nebenzimmer kommt es derweil zum Streit zwischen dem Ex-Paar Mina und Johei. Sofort entfernt sich Mina aus dem Zimmer und nimmt stattdessen den Sake mit. Zur selben Zeit erfährt Kommissar Otaki von Heiji, dass mit Kamiyo eine weitere Person ermordet wurde. Heiji teilt ihnen jedoch mit, dass er die Identität des Täters bereits kennt, ihn aber wegen mangelnder Beweise noch nicht überführen kann. Während des Telefonats bemerkt Conan an seinem Knie Salzkristalle vermischt mit Schlamm, welche vom Tatort stammen müssen. Plötzlich bekommen sowohl Conan als auch Heiji eine Idee und können auch die letzten Rätsel lösen.
Conan, Ran und Kogoro wollen das Noh-Masken-Museum besuchen, weil Kogoro das Leben von Jisaburo Izumi beschützen soll, doch dieses ist geschlossen. Wenig später erscheint Naruya Akaza und möchte mit Herrn Izumi sprechen. Daraufhin öffnet sich das Tor und auf einem Bildschirm erscheint die als Noh-Teufel verkleidete Moyono Mibu. Diese lässt Herr Akaza rein, während die Moris ihm folgen. Doch im Empfangsbereich weisen Frau Mibu und zwei Männer die drei zurück und fordern sie auf zu gehen. Der eine Mann stellt sich als Seinosuke Nagata vor und ist der Manager des Museums. Der andere heißt Tatsuro Seikanji und ist leitender Angestellter des Museums. Als Kogoro von einem Brief erzählt und dass er Herr Jisaburo beschützen soll, möchte Herr Akaza, dass Kogoro, Conan und Ran bleiben. Später erzählt Herr Akaza Kogoro, dass er ein guten Bekannter von Herr Izumi ist und jemand nach dessen Leben trachtet. Währenddessen reden die drei Angestellten miteinander und diskutieren über einen Plan, der durch Kogoro zu scheitern droht. Herr Nagata spricht von einer Falle, die für Herr Akaza gedacht war und nun gefährlich werden könnte.
Während Conan und Ran von Tatsuro Seikanji in die Vorratskammer gesperrt wurden, hat Seinosuke Nagata einen Stein in den Brunnen geworfen an dem ein Seil befestigt ist. Das andere Ende ist an der großen Statue hinter Jisaburo Izumi angebracht und sorgt dafür, dass die Statue auf Herr Izumi fallen wird. Conan und Ran können sich schließlich aus der Vorratskammer befreien und Herr Seikanji bewusstlos schlagen. An der Feuerstelle erzählt Herr Izumi inzwischen vor Frau Mibus Augen, dass Frau Mibu die Tochter seines bereits verstorbenen Freunds Kodo Matsumoto ist. Da sich Frau Mibus Mutter von ihm trennte, hatte Frau Mibu den Nachnamen ihrer Mutter. Da Naruya Akaza die Masken von Herrn Matsumoto billig an Herrn Izumi weiterverkaufte, hätte Frau Mibu ein Motiv gehabt. Da Herr Izumi Herr Akazas Geschäftspartner war, ist er ebenfalls betroffen. Kurz darauf verschwindet die Pflegerin Hatsuho Toba, um die Eingangshalle zu überprüfen.
Conan, Ran und Kogoro sind in Shizuoka, weil Kogoro von der Kriminalautorin Chika Kaido zu einem Interview eingeladen wurde. Dort begrüßen sie Frau Kaido, ihren Ehemann Yuichi Kaido und ihre Schülerin Koko Shimura. Doch es stellt sich heraus, dass Kogoro kein Interview geben soll, sondern Frau Kaidos Schülerin und ihren Ehemann beobachten soll, die vermutlich eine Beziehung haben. Nachdem sich Kogoro mit den beiden unterhalten hat, ziehen sich die Moris am späten Abend in das Gästehaus zurück. Um zwei Uhr nachts hört Kogoro plötzlich Frau Kaido laut lachen. Am nächsten morgen finden sie Frau Kaido, ihren Mann und Koko tot im Haus auf. Es gibt jedoch keine Anzeichen für einen Mord, lediglich neben Herrn Kaido entdeckt Conan eine Dose Schlaftabletten. Zudem fällt Conan ein Krug auf, von dem er einen ähnlichen bereits gesehen hat. Der Boden des Krug ist ziemlich feucht und im Mülleimer befinden sich zwei leere Bierdosen, zwei Schokoladenriegel und benutzte Taschentücher. An Frau Kaidos Computer entdeckt Kogoro ein offenes Textfenster, in dem die Sätze „Ein teuflischer Kreislauf", „Falscher Weg" und „Der Letzte ist der Gewinner und wird laut lachen" stehen. Kurz darauf erscheint Kommissar Yokomizo mit Inspektor Okawara, um in dem Fall zu ermitteln.
Als Ran mit Sonoko in ein Cafe geht und Sonoko ihr zwei Karten von dem bereits ausverkauften Konzert der Black Roses in Tokio zeigt, schreit plötzlich [Haruka Kona]] auf, dessen Karten gestohlen wurden. Sofort verdächtigt sie Sonoko , woraufhin Sonoko drei Stunden mit der Polizei reden muss, um das Missverständnis zu klären. Am nächsten Tag erzählt Sonoko Ran und Conan im Cafe von ihrem Gespräch. Plötzlich erscheint Haruka und zeigt allen auf ihrem Handy ein Angebot einer Internetseite bei dem es sich um zwei Konzertkarten handelt. Der Anbieter nennt sich dabei "coffee rumba" und muss nach Haruka eine Person sein, die in einem Café arbeitet. Deshalb möchte sie mit den Angestellten sprechen, die gestern gearbeitet hat. Neben der Aushilfe Kaori Kosuda und dem Besitzer Jiro Kirima kommt auch die Angestellte Masako Moka in Frage. Da Masako heute noch nicht zur Arbeit erschienen ist und auch nicht ans Telefon geht, gerät sie immer mehr unter Verdacht.
Aufgrund einer Sightseeing-Tour sind die Detective Boys zusammen mit Ran und Kogoro nach Kumamoto, das auch als Land des Feuers bezeichnet wird, gefahren. Während sie mit der Bahn die Landschaft von Kumamoto betrachten, fahren sie unter anderem am Kumamoto Shintoshin-Platz und am Vulkan Aso vorbei. Anschließend besuchen sie das Vulkan-Museum. Allerdings wollen die Kinder ausschließlich den Nakadake besuchen. Im Museum begegnet Ran einen Jungen namens Justin Takamori. Daraufhin erscheint seine Mutter Jessica Takamori, die nach Justin gesucht hat. Nachdem sich Justin von Ran verabschiedet hat, fahren Ran, Kogoro und die Detective Boys mit der Seilbahn zum Krater des Nakadake. Danach gehen sie zur Aso-Knuddelecke, wo sie den Souvenir-Shop und den Streichelzoo besuchen.
Nachdem Justin Takamori zusammen mit seinem Kumamon-Plüschtier von einem Dieb entführt wurde, verbringen Kogoro, Ran, die Detective Boys uns Justins Mutter Jessica Takamori die Nacht in einem Hotel. Am nächsten Morgen hat der Entführer eine weitere Nachricht an die Polizei geschickt. Anschließend besucht Nanie Kajiyama die Gruppe und erzählt ihnen von der Nachricht des Täters. Dieser hat Kumada Monkichi angerufen und will 100.000 Yen Lösegeld haben. Währenddessen belauscht Ai ein Telefongespräch zwischen Justins Mutter und einer unbekannten Person. Dabei erzählt Justins Mutter, dass in der Nähe viele Polizisten sind und lässt eine Visitenkarte ihres Mannes Naoto Takamori fallen. Diese hebt Ai auf und gibt sie ihr zurück. Später erzählt Ai Conan von ihrer Beobachtung und dass sich das Unternehmenslogo von Higo Foodsauf der Karte befand. In der Zwischenzeit befindet sich Justin mit dem Entführer in einem Ramen-Restaurant. Kurz darauf erscheinen Ayumi, Mitsuhiko und Genta, die Justin suchen gehen wollen. Als Mitsuo Inoue von den Plänen der Detective Boys erfährt, bietet er ihnen seine Hilfe an.
Conan spielt mit Genta, Mitsuhiko, Ayumi und Ai Fußball. Das Spiel wird durch eine Katze unterbrochen, die Conan aus der Nachbarschaft kennt und Taii heißt. Da sie eine streunende Katze ist, wird sie oft von Azusa aus dem Café Poirot gefüttert. Dies ist auch der Grund für ihren Namen, denn ein Freund des Detektivs Hercule Poirot hieß Kapitän Hastings und „Taii” steht für das Wort „Kapitän”. Als die Katze aus Ais Armen springt, bleibt sie mit ihrer Kralle an ihrem Pullover hängen und zieht einen Faden von diesem mit. Daraufhin folgen die Kinder Taii.
Conan und die Detective Boys spielen zusammen Fußball. Das Spiel wird von der Katze Taii unterbrochen, die Conan aus der Nachbarschaft kennt. Als das Tier wegläuft, folgen die Kinder ihm und gelangen in einen Lieferwagen. Sie werden von den Lieferanten nicht bemerkt und daraufhin eingeschlossen. Während der Fahrt entdecken sie in einem Paket eine Leiche und es stellt sich heraus, dass einer der Fahrer den Mann getötet hat. Da sie niemanden anrufen können, müssen sie über einen anderen Weg Hilfe holen. Conan will die verschiedenen Gegenstände, die sie bei sich tragen, nutzen, um Taii eine verschlüsselte Nachricht umzuhängen, sodass die Katze zum Café Poirot rennen kann und Azusa den Hinweis entdeckt.