Der Doktor, Amy und Rory werden von den Daleks entführt und vor das "Dalek-Parlament" gebracht. Wie sich herausstellt, benötigen die Daleks die Hilfe ihres alten Erzfeindes: Der Doktor soll den Schutzschild eines Planeten zerstören, den die Daleks als "Irrenanstalt" benutzen. Vor Ort entdeckt das Trio, dass der Schild bereits durch den Absturz eines Raumschiffs in Mitleidenschaft gezogen wurde. Die Pilotin, die junge Oswin Oswald, hat überlebt und versorgt den Doktor und seine Begleiter über Funk mit Informationen. Es dauert nicht lange, bis das Trio auf die wahnsinnigen Daleks trifft...
Der Doktor empfängt einen Notruf aus dem Jahr 2367: Ein gigantisches Raumschiff droht auf die Erde zu stürzen. Um das zu verhindern, schart der Doktor ein buntes Häuflein von Getreuen um, sich - darunter die altägyptische Königin Nefertiti und der britische Großwildjäger John Riddell. An Bord stellen die Zeitreisenden erstaunt fest, dass das Raumschiff von Dinosauriern nur so wimmelt...
Versehentlich landet der Doktor in einem kleinen Städtchen im "Wilden Westen" der 1870er Jahre - und entdeckt, dass es sich beim örtlichen Arzt um einen Außerirdischen namens Jex handelt, der von einem Cyborg verfolgt wird ...
Für Amy und Rory stellt sich nach zahlreichen Abenteuern mit dem Doktor die Frage, ob sie weiter mit ihm reisen sollen. Oder ist es an der Zeit, Abschied zu nehmen und wieder ein "normales" Leben auf der Erde zu führen? Während die beiden noch grübeln, erscheinen plötzlich rund um die Welt Milliarden kleiner schwarzer Würfel. Selbst der Doktor kann Sinn und Zweck der offenbar harmlosen Artefakte nicht ergründen. Ein ganzes Jahr geht ins Land, bevor die Würfel plötzlich eine ungeahnte Aktivität entfalten. Der Doktor hat die Gefahr, die von ihnen ausgeht, dramatisch unterschätzt...
Der Doktor legt mit Amy und Rory einen Zwischenstopp im New Yorker Central Park ein. Was als idyllischer Ausflug beginnt, endet für Rory im blanken Horror: Er begegnet einem der "Weinenden Engel", der ihn prompt durch die Zeit ins Jahr 1938 zurückschleudert. Er trifft River Song und erfährt, dass die Weinenden Engel in New York ein altes Hotel übernommen haben. Hier halten sie ihre Opfer gefangen, um immer eine Quelle der Zeitenergie zur Verfügung zu haben. River gelingt es, den Doktor und Amy in die Vergangenheit zu holen - doch dieses Mal scheinen die Freunde der Übermacht der Engel nicht gewachsen zu sein...
Der Doktor ist ins gegenwärtige London gereist, um die verschwundene Clara zu suchen. Nachdem er sie gefunden hat, wartet auf ihn und seine neue Begleiterin gleich die nächste Mission - im Wi-Fi-Netzwerk der Stadt lauert eine Bedrohung. Etwas Böses versucht, über das Netzwerk Seelen aufzusaugen. Auch Clara wird fast zum Opfer, der Doktor kann sie gerade noch retten. Als die Betreiber des Alien-Netzwerkes davon erfahren, planen sie, die beiden auszuschalten...
Der Doktor und Clara reisen zum ersten Mal mit der TARDIS auf einen fernen Planeten. Dort lernt Clara Merry kennen, die Königin der Jahre. Das Mädchen hat große Angst davor, einen rituellen Gesang zu Ehren einer gefürchteten Gottheit nicht richtig ausführen zu können. Nachdem Clara ihr Mut gemacht hat, stellt sich Merry ihrer Aufgabe. Es kommt, wie es kommen muss. Einer der Sänger trifft tatsächlich einen Ton des Schlafliedes nicht und die Gottheit erwacht aus ihrem ewigen Schlaf....
Bei dem Versuch nach Las Vegas zu reisen, kommen der Doktor und Clara mit der TARDIS vom Kurs ab. So verschlägt es sie ins Jahr 1983, in dem der Kalte Krieg zwischen den Großmächten noch in vollem Gange ist. Auf einem sowjetischen Atom-U-Boot kommt es gerade in dem Augenblick zu einem Störfall, als sich die TARDIS dort materialisiert. Doch der Doktor und Clara sind nicht die einzigen Besucher an Bord des U-Bootes. Die Besatzung hat eine Kreatur aus dem ewigen Eis geborgen und an Bord genommen. Der Wissenschaftler hält sie für ein eingefrorenes Mammut. Doch in den Tiefen des Eisblocks wartet ein Besucher aus dem All darauf, aufgetaut zu werden.
Der Doctor und Clara kommen 1974 zu einem verlassenen Anwesen im Moor, dem Caliburn House. Dort suchen Professor Alec Palmer und Emma Grayling nach der sogenannten Brunnenhexe. Der Geist dieser Frau soll das Anwesen seit Jahrhunderten. Emma vermutet, dass die Frau sehr einsam sein muss, doch der Doctor und Clara entdecken etwas ganz anderes: Bei der Erscheinung handelt es sich um eine Zeitreisende, die in einer Dimension festsitzt, in der die Zeit nur sehr langsam vergeht.
Clara und der Doctor finden sich an Bord eines intergalaktischen Raumfrachters wieder, der die TARDIS geborgen hat. Eine Abwrackmannschaft soll sie jetzt in ihre Einzelteile zerlegen, damit sie verkauft werden kann. Was niemand bemerkt: Es gibt ein Leck in der Zeit, und die TARDIS verliert nach und nach die jüngere Vergangenheit. Während Clara orientierungslos in den Tiefen des Raumschiffs herumirrt, hat der Doctor gerade noch 30 Minuten Zeit, um seine Begleiterin zu finden und die Selbstzerstörung der TARDIS zu verhindern.
Im Jahr 1893 ist Sweetville ein Ort voller Widersprüche. Einerseits sind die Häuser und Straßen von einer fast unwirklichen, makellosen Sauberkeit und die menschlichen Bewohner ausnahmslos schön, andererseits geschieht dort Grausiges: Am Flussufer werden Leichen angespült, deren Haut wächsern und rot gefärbt ist. Handelt es sich dabei um das Phänomen des Purpurnen Schreckens? Ist Mr. Thursdays Bruder, ein Reporter, an dieser Krankheit gestorben? Oder hat sein Tod etwas mit den Machenschaften der Streichholzfabrikbesitzerin Mrs. Gillyflower zu tun? Nachdem der Doctor und Clara plötzlich verschwinden, treten Madame Vastra und Jenny auf.
Der Doctor und Clara reisen mit ihrem Anhang an einen Ort, der früher als der beste Vergnügungspark der ganzen Galaxie galt: Hedgewick's World of Wonder. Doch von der ruhmreichen Vergangenheit der Anlage ist heute nicht mehr viel zu sehen. Inzwischen hausen dort nur eine versprengte militärische Spezialeinheit, ein Schach spielender Zwerg und ein Schausteller, der seine besten Tage längst hinter sich hat. Ausgerechnet an diesem Ort wird der Doctor wieder einmal von seinen ältesten Feinden heimgesucht: den Cybermen!
Im Zuge eines äußerst merkwürdigen Konferenzgesprächs, zu dem man Clara gebeten hatte, bekommt sie die Information, dass die Whisper Men hinter Vastra, Jenny und Strax her sind. Doch die Flüstermänner haben verborgene Absichten. In der berechtigten Hoffnung, dass der Doctor seine Freunde suchen wird, wollen sie ihn an einen ganz bestimmten Punkt in Raum und Zeit locken, den er niemals hätte aufsuchen sollen. Wenn er in diese Falle tappt, gefährdet er das Raum-Zeit-Kontinuum und damit seine Vergangenheit, seine Gegenwart und seine Zukunft.