In der Zukunft wütet ein neuer starker Feind. Um die Welt zu retten hat Bulma Energie gesammelt um Trunks erneut in die Vergangenheit zu schicken und dort seine Freunde um Hilfe zu bitten. Während auf der Erde der Gegenwart niemand etwas ahnt sind Vegeta und Son Goku wieder auf Beerus' Planeten und lassen sich von Whis für den nächsten Gegner trainieren.
Trunks versucht Black zu töten, kann jedoch nichts gegen ihn ausrichten und schafft es schließlich gerade so, sich schwer verletzt mit seiner Zeitmaschiene von der Zukuft in die Gegenwart zu retten. Mai wurde zuvor von Black getötet. Die Zeitmaschine landet vor dem Capsule-Corpooration-Gebäude, wo sie sofort von dem jungen Trunks und der Pilaw-Truppe entdeckt wird, die sich mit Trunks angefreundet haben und jetzt dort wohnen. Während Bulma Vegeta und Son Goku herbeiruft, spekulieren die vier, wer der mysteriöse Bewustlose sein könnte. Als der Trunks aus der Zukunft endlich im Beisein von Vegeta, Son Goku und auch Beerus und Whis, die interessehalber mitgekommen sind, aufwacht, geht er sofort wutentbrannt auf Son Goku los.
Trunks berichtet von dem mächtigen Gegner Black, vor dem er aus der Zukunft geflohen ist. Dieser nennt sich selbst Son Goku und sieht Son Goku auch zum verwechseln ähnlich. Trunks bittet Vegeta und Son Goku, ihn in die Zukunft zu begleiten, um Black, bzw. Goku Black, zu töten, da dieser dabei ist, die gesamte Menschheit auszulöschen. Zuvor muss Bulma jedoch erst die Funktionsweise der Zeitmaschine verstehen, um Treibstoff für eine weitere Reise herstellen zu können. In der Zwischenzeit testet Son Goku Trunks Stärke und stellt fest, dass dieser sich inzwischen in einen zweifachen Super Saiyajin verwandeln kann. In der Zukunft findet Black heraus, dass Trunks in die Vergangenheit gereist ist. Er reißt darauhin einen Riss in Raum und Zeit, um Trunks dorthin zu folgen.
Black taucht in der Gegenwart auf und wird umgehend von Son Goku in einen Kampf verwickelt. Bevor die beiden jedoch ernsthaft gegeneinander Kämpfen können wird Black durch den Riss wieder in die Zukunft gezogen. Jedoch nicht ohne zuvor noch Trunks’ Zeitmaschine zu zerstören. Bulma kramt jedoch prompt die alte Zeitmaschine hervor, in der damals Cell angekommen war, wodurch der Weg in die Zukunft erneut offen steht. Whis erklärt, dass er an Blacks Hand einen „Zeitring“ gesehen hat, der Black wohl selbstständig durch die von Tunks’ Zeitmaschine geschlagene Verwerfung in der Raumzeit gezogen hat. Als sich der Riss wieder schloss, wurde Black wieder in seine eigene Zeit gedrängt. Weiter erklärt Whis noch, dass Zeitringe eigentlich nur von Kaioshin getragen werden.
Bulma beginnt, Cells Zeitmaschine zu reparieren, damit Trunks, Vegeta und Son Goku in die Zukunft reisen können, um Black zu besiegen. Son Goku will in der Zwischenzeit trainieren, findet aber keinen passenden Ort und auch keinen Trainingspartner. Der Trunks aus der Zukunft bemerkt freudig die junge Mai, und erzählt ihr von ihrem zukünftigen Ich, das eine zentrale Rolle im Kampf gegen Black gespielt hat. Beerus bittet Whis, Nachforschungen zu Black anzustellen, da dieser ihm irgendwie bekannt vorgekommen ist, und ihm die Tatsache, dass Black einen Zeitring besitzt, komisch vorkommt.
Die Pilaw-Truppe unterstützt Bulma bei den Reparaturen der Zeitmaschine, die gut vorangehen. Trunks ist eifersüchtig auf sein Ich, das aus der Zukunft gekommen ist. Er gibt sich Mühe, genauso cool zu sein wie dieser, und versucht bei Mai Eindruck zu schinden. Die hat aber nur Augen für den älteren der Beiden. Der Trunks aus der Zukunft verbringt den Tag mit Son Gohan – der in seiner Zeitlinie sein Lehrmeister war – und dessen Familie. Trunks ist überrascht wie anders Son Gohan in dieser Zeitebene ist, freut sich aber, dass dieser ein glückliches Familienleben führen kann. Beerus und Whis machen sich zusammen mit Son Goku auf den Weg in das 10. Universum, um einer Spur über Blacks Identität nachzugehen.
Beerus, Whis und Son Goku treffen im 10. Universum ein, und inspizieren den Kaio Zamasu, der sich in der Ausbildung zum Kaioshin befindet. Sie stellen fest, dass Zamasus Ki sehr ähnlich zu dem von Black ist. Dies wird insbesondere bei einem Trainingskampf zwischen Zamasu und Son Goku klar, zu dem die Drei Zamasu mit Hilfe seines Ausbilders überreden können. Zamasu hat zuvor seine Abneigung gegen Sterbliche ausgedrückt, und infrage gestellt hat, ob Sterbliche es überhaupt Wert wären, von den Kaioshin beschützt zu werden, wo sie doch ständig böse Taten ausführen. Sein Ausbilder wollte ihm daher durch Son Gokus Stärke das Potential und den Wert der Sterblichen demonstrieren, erreicht jedoch damit eher das Gegenteil.
Son Goku und Co. berichten von ihrer Reise ins zehnte Universum, und ihrer Meinung, dass Zamasu und Black wohl verschiedene Personen seien. Trunks kommt zu der Erkenntnis, dass Vegeta und Son Goku beide mehr als stark genung sind, um Black zu besiegen, weswegen er selbst nicht mehr stärker werden müsse. Vegeta bringt ihn jedoch dazu, seine Meinung wieder zu ändern. Im zehnten Universum beobachten Zamasu und sein Ausbilder einen Planeten, auf dem sich gerade intelligentes Leben gebildet hat, das jedoch überaus gewalttätig ist. Sie reisen mit einem Zeitring 1000 Jahre in die Zukunft, um deren Entwicklung zu verfolgen, müssen aber feststellen, dass sich die Zivilisation kein Stück weiterentwickelt hat. Unterdessen wird Beerus von Zeno kontaktiert, der sich mit Son Goku treffen will.
Zusammen mit Whis und dem Kaioshin des siebten Universums begiebt sich Son Goku wie verlangt zu Zeno. Der will mit Son Goku befreundet sein, und Zeit mit ihm verbringen, da er Son Gokus natürliche, furchtlose Art mit ihm umzugehen erfrischend findet. Son Goku vertröstet Zeno auf später, da er zunächst Black besiegen muss. Für danach lädt er Zeno aber gleich auf die Erde ein und verspricht, ihm einen noch besseren Freund vorzustellen. Bevor er auf die Erde zurückkehrt, erhält er von Zeno einen Knopf, mit dem er Zeno jederzeit sofort herbeirufen kann. Im zehnten Universum tötet Zamasu einen bösartigen Sterblichen und distanziert sich zunehmends von den Lehren der Kaioshin. Bulma hat die Zeitmaschine repariert, weswegen Trunks, Vegeta und Son Goku in die Zukunft aufbrechen können.
In der Zukunft treffen Son-Goku, Vegeta und Trunks auf die Widerstandskämpfer, die gegen Black vorgehen. Die bringen sie zu ihrem geheimen Hauptquartier, wo die drei feststellen, dass Mai noch am Leben ist. Die drei machen Black auf sich aufmerksam, der prompt erscheint, um sie zu bekämpfen. Als erster kämpft Vegeta gegen Black, den er in seiner blauhaarigen Form stark dominiert, bis Black ebenfalls transformiert: In den rosahaarigen Super-Saiyajin-Rosé, als der er Vegeta mit Leichtigkeit besiegt. Auch Son-Goku kann er überwältigen. Als Black aber Son-Goku mit dem Kamehameha töten will, taucht überraschend Zamasu auf, und stoppt ihn. Er verkündet, dass er selbst Son-Goku töten wolle.
Trunks und Son Goku kämpfen in der Zukunft gegen Zamasu und Black, können aber nichts gegen die Beiden ausrichten. Insbesondere Zamasu kann nicht verwundet werden; er behauptet, unsterblich zu sein. Bevor Son Goku und Trunks von den beiden getötet werden, sorgt Vegeta mit letzter Kraft für eine Ablenkung, sodass die drei schwer Verwundeten von Mai und den Rebellen gerettet werden können. Mai setzt die Drei in die Zeitmaschine und schickt sie in die Gegenwart zurück. Sie selbst bleibt mit den Rebellen zurück. In der Gegenwart erfährt Zamasu von den Super-Dragonballs und macht sich auf, diese zu finden.
Zamasu sucht den allwissenden Zuno auf, um den Standort der Super-Dragonballs zu erfahren. Während Vegeta, Son Goku und Trunks sich von ihrem Kampf in der Zukunft erholen, erscheinen Beerus und Whis zusammen mit dem Kaioshin des siebten Universums, und berichtet ihnen von Zamasus Besuch bei Zuno. Als Trunks und Co. ihre Erlebnisse in der Zukunft geschildert haben, spekuliert Whis, das Zamasu wohl die Super-Dragonballs benutzt hat, um Unsterblichkeit zu erlangen, und um einen Kampfgefährten zu erschaffen, der es mit Son Goku aufnehmen kann – Black. Da sie jetzt wissen, dass Zamasu in der Zukunft böse werden wird, oder es bereits ist, machen sich Son Goku, Beerus, Whis und der Kaioshin ins zehnte Universum auf, um Zamasus Lehrmeister zu warnen.
Im zehnten Universum angekommen, spüren Beerus und Whis sofort, dass Zamasu vorhat, seinen Meister Gowasu zu töten. Um absolut sicher zu sein, legen sich die vier auf die Lauer und beobachten, wie Zamasu tatsächlich den Mord ausführt. Anschließend dreht Whis die Zeit zurück, um Gowasu zu retten. Sie konfrontieren Zamasu, der seinen Plan offenbahrt: Er wollte mit Gowasus Zeitring die Abkühlzeiten der Super-Dragonballs umgehen, und diese benutzen, um letztlich alle Sterblichen zu vernichten. Er will so Frieden in das Universum bringen. Nach dem Geständnis tötet ihn Beerus jedoch kurzerhand. Zurück im siebten Universum versichert Beerus Trunks, dass der Zamasu in dessen Zukunft nun ebenfalls tot sei, ebenso wie Black, da Beerus’ Taten als Gott auf alle Zeitlinien Einfluss hätten.
Son Goku, Vegeta und auch Bulma begleiten Trunks wieder zurück in seine Zukunft, da sie nicht so recht glauben können, dass sich diese verändert hat, nachdem Beerus Zamasu in der Gegenwart getötet hat. Auch wenn Beerus weiterhin darauf beharrt. Dort angekommen ist tatsächlich alles immer noch genauso wie sie es bei ihrer letzten Zeitreise zurückgelassen haben. Schnell treffen sie auch wieder auf Zamasu und Black. Als Son Goku Black vor dem Kampf als billige Kopie von ihm bezeichnet, erklärt Black, dass er keine Kopie ist. Tatsächlich ist Black eigentlich Zamasu, der mit den Super-Dragonballs den Körper mit Son Goku getauscht hat, und Son Goku dann getötet hat.
Black erklärt, dass er der Zamasu ist, der gegen Son Goku im Zweikampf verloren hat. Er hat seinen Meister getötet um dessen Zeitring zu stehlen, und hat dann mit den Super-Dragonballs mit Son Goku Körper getauscht. Anschließend ist er mit dem Zeitring in Trunks’ Zeitlinie gereist, da Beerus in dieser nicht mehr am Leben ist, und ihn somit niemand mehr aufhalten kann. Da er einen Zeitring trägt, macht es ihm auch nichts aus, dass Beerus ihn in einer anderen Vergangenheit getötet hat. Weiter hat Black sich mit dem Zamasu aus Trunks’ Zeitlinie zusammengetan, der sich mit den Super-Dragonballs Unsterblichkeit gewünscht hat, bevor er diese dann zerstört hat. Anschließend haben die beiden begonnen, alle Sterblichen zu töten, um eine „perfekte Welt“ zu erschaffen. Im Kampf gegen die Beiden wird Son Goku schwer verwundet, und auch Vegeta und Trunks sind klar unterlegen. Dann schafft es Trunks jedoch, vor Wut ungeahnte Kräfte zu mobilisieren.
Trunks schafft es, Zamasu und Black einigermaßen in Schach zu halten, sodass Bulma, Vegeta und Son Goku in die Vergangenheit zurückkehren können. Dort sollen sie sich eine Strategie überlegen, wie man Zamasu und Black besiegen könnte. In ihrer eigenen Zeit zurück, stoßen auch Krillin, Piccolo, Chi Chi, Son Gohan, Son Goten und der junge Trunks zu den Dreien, und überlegen ebenfalls. Schließlich hat Piccolo den Einfall, den unsterblichen Zamasu mit dem Mafuba zu versiegeln. Son Goku macht sich sogleich zum Herrn der Schildkröten auf, um sich diese Kampftechnik beibringen zu lassen. Beerus und Whis reisen unterdessen wieder in das zehnte Universum zu Zamasus altem Meister, wo sie beratschlagen, was mit dem Zamasu in der Zukunft zu tun ist.
Nachdem Son Goku das Mafuba gemeistert hat, und Vegeta von seinem Training im Raum von Geist und Zeit zurück ist, kehren die beiden zusammen mit Bulma in die Zukunft zurück. Dort ist Trunks gerade von Zamasu und Black geschlagen worden. Sofort nach ihrer Ankunft zerstört Black die Zeitmaschine, sodass Goku und Vegeta sich nicht erneut zurückziehen können. Das wäre aber ohnehin nicht nötig gewesen, da sowohl Vegeta in seinem Kampf gegen Black, als auch Son Goku in seinem Kampf gegen Zamasu stark dominieren. Bulma versucht unterdessen, die Zeitmaschine wieder zu reparieren, und der Kaioshin des siebten Universums kommt mit Gowasu in der Zukunft an, um den Kampf zu verfolgen.
Black erkennt, dass man durch Wut seine Kraft extrem steigern kann, und erlernt die Fähigkeit, Duplikate von sich selbst zu erzeugen. Mit diesen kann er Son Goku und Vegeta in Schach halten, während Zamasu sich aufmacht, Bulma, Mai und Trunks zu töten. Trunks gelingt es aber, Zamasu aufzuhalten und mit dem Mafuba in einer Urne zu versiegeln. Dem gelingt es aber relativ schnell, sich wieder zu befreien. Erschüttert von diesen ungeahnten Kräften der Sterblichen benutzen Zamasu und Black ihre Potara-Ohrringe, um sich in einen noch stärkeren Kämpfer zu fusionieren, der Vegeta, Son Goku und Trunks besiegen soll.
Der fusionierte Zamasu ist nun sowohl unsterblich, als auch im Besitz grenzenloser Macht. Dennoch gelingt es Son Goku, Vegeta und Trunks irgendwie, ihm mit vereinten Kräften Paroli zu bieten, während Bulma, Mai und die übrigen überlebenden Menschen versuchen, vor ihm zu fliehen. Mehrmals gelingt es ihnen, Zamasus Attacken mit stärkeren Attacken ihrerseits abzublocken, und auf diesen zurückzuschleudern, was aber letztlich keinen Effekt hat, außer diesen wütend zu machen.
Zamasu bemerkt, dass eine Hälfte seines Körpers nicht unsterblich ist, da auch Black vor der Fusion mit dem unsterblichen Zamasu einen sterblichen Körper hatte. Da seine Emotionen während des Kampfes mehr und mehr aus dem Gleichgewicht geraten, geschieht dasselbe auch mit seinem Körper, der zunehmend missgestaltet wird. Vegeta und Son Goku wollen ihm nun den Rest geben, und benutzen die Potara-Ohringe des Kaioshin um sich zu Vegetto zu fusionieren. Der schafft es, Zamasu stark zu schwächen, aber bevor er ihn töten kann trennt sich die Fusion wieder, da eine Potara-Fusion zwischen sterblichen nicht von Dauer ist. Trunks setzt den Kampf anstelle der beiden fort, und schafft es schließlich – mithilfe der Energie aller sterblichen, die ihr Vertrauen in ihn setzen – Zamasu in zwei Teile zu zerhacken.
Zamasu verwandelt sich in ein körperloses Wesen, das die gesamte Erde einhüllt und alles Leben darauf zerstört. Nur Vegeta, Son Goku, Trunks, Bulma, Mai und die beiden Kaioshins leben noch. Son Goku erinnert sich an den Knopf, den er von Zeno erhalten hat, und benutzt diesen, um Zeno herbeizurufen. Der fackelt nicht lange und löscht Zamasu aus, mitsamt allem anderen in dieser alternativen Zukunft. Son Goku und Co. schaffen es jedoch, zuvor mit der Zeitmaschine in ihre eigene Zeit zurückzukehren. Trunks und Mai wiederum benutzen schließlich die Zeitmaschine, um in ihre eigene Welt zurückzukehren, zu einen Zeitpunkt an dem Zamasu und Zeno diese noch nicht zerstört haben. Beerus und Whis begleiten sie, um sicherzugehen, dass eine neue alternative Zeitlinie entsteht, in der die beiden in Frieden leben können, indem sie Zamasu und Black schnell besiegen, bevor sie sich fusionieren können.
Son Goku beschließt, endlich Meister Kaio wiederzubeleben, für dessen Tod er vor Jahren verantwortlich war. Als er die sieben Dragonballs jedoch alle beisammen und Shenlong beschworen hat, tauchen C 18, der Herr der Schildkröten, Oolong, Pilaw, Trunks, Son Goten, Son Gohan und Bulma auf, die sich ebenfalls etwas von Shenlong wünschen wollen. Durch das lange hin und her diskutieren, welcher Wunsch nun erfüllt werden soll, verschwindet Shenlong schließlich, ohne einen der Wünsche erfüllt zu haben, wodurch Meister Kaio auch weiterhin tot bleibt. Beerus bemerkt, dass Bulma versucht, wie ihr zukünftiges Selbst eine Zeitmaschine zu bauen; Da Zeitreisen streng verboten ist zerstört er die halb fertige Maschine kurzerhand.
Bulma, Vegeta und Trunks sind bei einer Preisverleihung, bei der herausragende Erfindungen geehrt werden, da Bulma für den Preis nominiert ist. Der Gewinner ist dann aber Dr. Slump, der eine Maschine erfunden hat, die Dinge aus dem Nichts erzeugen kann, wenn man sie sich stark wünscht. Der Geist von Dr. Mashirito, Dr. Slumps Erzfeind, gefällt das gar nicht, und verursacht deswegen auf der Preisverleihung Chaos, indem er dem von Dr. Slump gebauten Robotermädchen Arale ein Mittel gibt, das sie um ein vielfaches aufgedrehter macht, als sie es ohnehin schon ist. Vegeta und Son Goku bemühen sich, Arale unter Kontrolle zu bringen, was sich allerdings als sehr schwierig erweist, da Arale als Gag-Manga-Figur deutlich stärker als die beiden ist.
Champa schlägt Beerus vor, gegeneinander Baseball zu spielen. Für Beerus spielen Son Goku, Son Gohan, Trunks, Krillin, Piccolo und Yamchu; An Champas Seite sind Vegeta, Son Goten, Cabba, Magetta und Botamo. Da eigentlich nur Yamchu wirklich weiß, wie man Baseball spielt, werden ständig unbeabsichtigt Regeln verletzt und das Spielfeld zerstört. Letztlich kann Yamchu aber das Spiel mit letzter Kraft für Beerus’ Team entscheiden.
Son Goku benimmt sich merkwürdig; Er ist angespannt und versucht ständig, jemandes Energie aufzuspüren. Als Son Gohan und Son Goten ihn schließlich darauf ansprechen, erklärt er, dass Hit ihm nach dem Leben trachte. Als es dann zur Konfrontation zwischen den beiden kommt, wird schnell offenbar, dass Hit seit ihrem letzten Kampf nochmal um einiges stärker geworden ist. Mit einer mysteriösen Spezial-Attacke gelingt es ihm ohne große Mühe, Son Goku tatsächlich zu töten.
Kurz vor seinem Tod hat Son Goku einen Energiestrahl senkrecht nach oben geschossen. Als dieser zurück zur Erde fällt, und genau die Brust des toten Son Gokus trifft, wird dieser durch den Aufprall reanimiert. Der Kampf zwischen Son Goku und Hit wird umgehend fortgesetzt, verläuft diesmal aber wesentlich ausgeglichener, da Son Goku nach und nach Hits geheime Spezialattacken durchschaut. Schließlich endet der Kampf in einem Unentschieden. Es stellt sich zudem heraus, dass es tatsächlich Son Goku selbst war, der den Assassinen Hit angeheuert hat, ihn zu töten, da er gegen Hit bei voller Stärke kämpfen wollte.
Ein bösartiges Alien, das Jaco vor kurzem verhaftet hat, kann diesem entkommen. Auf seiner Flucht landet es auf der Erde, wo gerade ein Großer-Saiyaman-Film gedreht wird. Als Mr. Satan, der eine Hauptrolle in dem Film hat, Son Gohan und Videl eine Tour auf dem Film-Set gibt, wird Son Gohan spontan als Stunt-Double für die Rolle des Großen Saiyamans eingestellt. Dies inspiriert ihn, auch in Wirklichkeit wieder in diese Rolle zu schlüpfen, und Verbrechen zu vereiteln. So trifft er auf das entflohene Alien, dass von anderen Besitz ergreifen kann, wobei der besessene Körper um ein vielfaches stärker wird. Son Gohan besiegt das Alien, aber es kann entkommen. Inzwischen ist Jaco auf der Erde angekommen und überzeugt davon, dass der Große Saiyaman von dem Alien besessen ist, weswegen er Son Gohan angreift.
Gohan überzeugt Jaco, ihn nicht anzugreifen. Der berichtet ihm von dem entflohenen Alien und erklärt, dass die Personen, von denen es Besitz ergreift umso stärker werden, je mehr Dunkelheit sie in ihrem Herzen tragen. Das Alien ergreift unterdessen Besitz von Barry Kahn, dem Schauspieler der den Großen Saiyaman verkörpert. Dessen Wut und Eifersucht gegenüber Son Gohan, der ihm das Rampenlicht stiehlt, sorgen dafür, dass er sich in ein riesiges, mächtiges Monster verwandelt. Mit Mühe gelingt es Son Gohan aber letztlich, ihn zu besiegen. Aufnahmen dieses Kampfes werden dann für das fulminante Finale des Großen-Saiyaman-Filmes verwendet, der ein großer Erfolg wird.
Son Goku ist frustriert, weil niemand Zeit hat, mit ihm zu trainieren. Dann kommt er aber auf die Idee, wieder mit Krilin beim Herrn der Schildkröten zu trainieren. Krilin lässt sich schnell dazu überreden, da seine Frau und seine Tochter ihn darauf hinweisen, dass er in den letzten Jahren ziemlich schwach geworden ist. Der Herr der Schildkröten gibt den beiden dann als Training den Auftrag, eine seltene Pflanze zu besorgen, die sein Leben verlängert und ihm Kraft gibt. Die Suche nach der Pflanze führt die Beiden in eine seltsamen Höhle, in der plötzlich viele ihrer alten Feinde auftauchen, darunter auch Tamburin, der damals Krilin getötet hatte.
Son Goku und Krilin schlagen ihre Feinde wieder und wieder zurück, aber diese erscheinen einfach wieder von neuem, und jedes Mal stärker als zuvor. Im Laufe des Kampfes werden Son Goku und Krilin getrennt. Krilin verliert seinen Mut und möchte fliehen, schafft es aber dann, seine Angst zu überwinden. Schließlich erkennen er und Son Goku, dass die Gegner durch die Energie angetrieben werden, die die beiden ausstoßen. Als sich die beiden ruhig und gelassen verhalten, verschwinden die Gegner, und an ihrer Stelle erscheint die Pflanze, die sie dem Herrn der Schildkröten bringen sollten. Krilin ist nach diesem Training entschlossen, wieder ein Kampfsportler zu werden.