Callen findet Akten, in denen von einem Kind als Testperson 17 die Rede ist. Er denkt, er wäre dieses Kind und stellt Hetty zur Rede. Aber viel gibt sie nicht preis. Inzwischen hat Joelle Zasha entführt und sie dann russischen Söldnern überlassen. Sie will rauskriegen, wo Katya ist. Da Zasha als Doppelagentin für Callen tätig ist, setzt dieser mit dem Team alles daran, sie zu befreien. Die Aktion gelingt und Joelle ist wieder einmal mächtig sauer auf Callen. Dieser setzt Zasha erneut ein. Sie soll Hetty nach Syrien folgen und observieren.
Lieutenant Tanaka, ein 73 Jahre alter Veteran, wird feige von hinten niedergeschlagen. Sein Sohn Jack, der Polizist ist, nutzt seine Kontakte, um die beiden Angreifer zur Strecke zu bringen. Das Team kann aber einschreiten, bevor Schlimmeres passiert. Gegenüber Kilbride äussert Jack, dass es der richtige Weg war, auch wenn seine Karriere dafür beendet ist. Um der Welt zu zeigen, was für Feiglinge die beiden Angreifer sind, hat Jack sie, an Stühle gefesselt, gefilmt und das Video ins Internet gestellt, bevor das Team das Handy beschlagnahmen konnte. Damit will er der Welt zeigen, dass er und seine Leute nicht alles mit sich machen lassen.
Eine Gruppe ATF-Agents versucht, ein paar deutsche Waffenschmuggler, allen voran den ehemaligen KSM-Soldaten Lukas Meyer, auffliegen zu lassen. Der Deal geht schief und mehrere Agents sterben. Das NCIS-Team ermittelt und stösst auf den ehemaligen Army General Collins, welcher eine Milizgruppe mit den Waffen beliefern wollte. Kilbride kennt den Mann lange und Sam kriegt das Gefühl, dass Kilbride die Ermittlungen behindert. Kensi soll inzwischen über die Ex-Freundin von Lukas Meyer, Mia Hahn, versuchen, mehr zu erfahren. Diese befindet sich in einer Entzugsklinik. Kensi schleust sich verdeckt dort ein und kann sich mit ihr anfreunden. Mia ist von Lukas so misshandelt worden, dass Kensi ihr vorschlägt, Lukas für sie zu töten. So erhofft Kensi, an Lukas’ Adresse zu kommen.
Während Callen weiter Katya verfolgt und dabei eine neue Spur findet, versucht der Rest des Teams, eine gestohlene Wagenladung Waffen zu finden. Der Verdächtige wird jedoch tot aufgefunden. Und vor allem Deeks bekommt es mit einer Frau zu tun, die bereit ist, über Leichen zu gehen.
Das Team soll Laura Song beschützen, welche für die Navy arbeitet. Der Auftrag geht aber schief und Song stirbt. Ein Sonderermittler verhört das Team, um rauszufinden, was passiert ist. Das Bild wird erst klar, als Kilbride verhört wird. Dieser musste bei seinem Eintreffen im Safe House feststellen, dass Laura Song nicht getötet, sondern herausgeholt werden sollte. Seit Jahren arbeitet sie für die Chinesen und Kilbride musste leider feststellen, dass er auf sie hereingefallen war. Da nichts Negatives nach aussen dringen darf, geben Kilbride und der SecNav dem Ermittler zu verstehen, dass der Fall zu den Akten gelegt werden soll und Laura Song als Heldin dargestellt wird.
Ein Mann nimmt in einem Bus mehrere Menschen als Geiseln und fordert, dass der Tod seiner Tochter genauer untersucht wird. Die Soldatin hat nach einer unehrenhaften Entlassung aus der Armee Suizid begangen – eine Geschichte, die ihren Vater nicht überzeugt. Während Sam und Devin in Verhandlungen mit dem Entführer treten, untersucht der Rest des Teams den Tod der Frau. Dabei decken sie Schockierendes auf.
Das Team versucht, den Selbstmord eines Petty Officers aufzuklären. Dieser litt unter PTBS und wurde von der Ärztin Evelyn Bernhard betreut. Es stellt sich aber heraus, dass diese ihm so sehr helfen wollte, dass sie die Dosierung auf eigene Faust sehr hoch und heimlich verabreichte. Während Kensi wegen eines Auftrags nicht in der Stadt ist, versucht Deeks, den Garten zu erneuern. Fatima hingegen hadert mit ihrer Rückkehr in den Dienst, da sie meint, noch nicht fit zu sein.
Kensi ist undercover mit einer Gruppe Migranten unterwegs. Als die Gruppe von einer militanten Miliz angegriffen wird, flieht Kensi zusammen mit der jungen Rosa. Aber es dauert nicht lange und die beiden geraten in die Hände der selbsternannten Grenzschützer. In letzter Sekunde schaffen es Deeks und Sam, die beiden Frauen zu befreien. Unterstützung erhält das Team diesmal von Aliyah. Sie ist die Tochter eines alten Freundes von Sam.
Die junge Internet-Influencerin Gia wird entführt. Das Team ermittelt und stösst dabei auf eine Gruppe junger Männer, die von Frauen enttäuscht wurden und sich ins Internet flüchten. Geschützt durch die Anonymität trauen sie sich dort, ihren Fantasien freien Lauf zu lassen. Das Team kann Gia vor dem jungen Curtis retten. Allerdings ist es für alle schwer zu verstehen, was das Internet für eine merkwürdige Parallelwelt ist, die ihre eigenen oberflächlichen Gesetze hat.
Das Team sucht den Mörder einer Wissenschaftlerin, die mit den US-Marines zusammengearbeitet hat. Der Täter hat zudem eine neuartige Radartechnologie gestohlen und muss dringend aufgehalten werden.
Kensi und Deeks suchen nach der Mutter, als auf einem Schiff der Navy wird ein Neugeborenes ausgesetzt wird. Nate trifft sich unterdessen mit Kilbride und erfährt von einem interessanten CIA-Projekt.
Das NCIS-Team untersucht ein Flugzeug, dass in den US-Luftraum eingedrungen und mit einem Navy-Flugzeug zusammengestoßen ist. Deeks und Kensi bereiten sich außerdem auf die Pflegefamilien-Prüfung vor.
Sam schlüpft in seine frühere Undercover-Figur „Switch“, um den Mord am Partner eines DOJ-Agents zu untersuchen. Seine Kollegen kümmern sich währenddessen um einen Dieb geheimer Navy-Informationen.
Ein hochwertig bestücktes Kunstlager meldet einen großen Raubüberfall. Mitglieder des NCIS tarnen sich als Käufer bei einer exklusiven Kunstauktion, um den Kunstdieben auf die Schliche zu kommen.
Der NCIS untersucht den Tod eines Navy-Fotografen, der den Bau einer Waffenstation dokumentieren sollte. Roundtree und seine Schwester werden bei einer Kontrolle zu Opfern rassistischen Profilings.
Der NCIS versucht, den entführten Diensthund Master Sergeant Boomer aufzuspüren. Sam möchte sein Boot verkaufen, damit er sich um seinen an Alzheimer erkrankten Vater kümmern kann.
Nachrichtendienstoffizier Akhil Ali kann sich bei der Suche nach einem Kollegen auf die Hilfe des NCIS-Teams verlassen. Ist ein ausländischer Agent für das Verschwinden des Recruiters verantwortlich?
Das NCIS-Team untersucht den Mord an einer Frau, die am Raketenabwehrprogramm der Navy mitgewirkt hat. Eine entwendete Technologie liefert erste Hinweise. Indes überlegt Sam, sein Boot zu verkaufen.
Vor seiner Aussage gegen zwielichtige Waffenhersteller verschwindet ein Informant spurlos. Das NCIS-Team nimmt sich dem Vermisstenfall an und bekommt Unterstützung von Agentin Talia Del Campo.
Zwei Männer jagen sich bei einem Einbruchsversuch in einen Militärstützpunkt selbst in die Luft. Das Navy CIS-Team ermittelt. Unterdessen will Callen mit Freundin Anna den nächsten Schritt wagen.
Das NCIS-Team steht gehörig unter Zeitdruck, um Callen ausfindig zu machen. Der Special Agent wollte mit Hilfe von Sams Deepfake einen Waffendeal einfädeln und ging dabei Spionin Katya in die Falle.
Das Navy CIS-Team fahndet nach einer Einbrecherbande, die ein Kasino in Los Angeles mit militärischen Waffen ausraubte. Währenddessen haben Kensi und Deeks erfreuliche Neuigkeiten zu vermelden.