Während Ninjago wieder aufgebaut wird, erscheint Faith mit einer dringlichen Warnung: die Oni sind zurückgekehrt und überfallen die Welten, eine nach der anderen. Ninjago muss sich wappnen und Lloyd muss die Möglichkeit in Betracht ziehen, dass er sich mit einem anderen Feind verbünden muss, um diesen Feind zu besiegen
Lord Garmadon ist zusammen mit den Ninja an Bord des Flugschiffs, sehr zur Frustration der Helden. Lloyd findet heraus, dass sein Vater keine emotionale Bindung mehr zu ihm hat und sich auch nicht mehr an die Beziehung, die sie aufgebaut hatten, erinnern kann. Lord Garmadon behauptet, dass die Oni den Weltenkristall, der sich im Borg Turm befindet, als Mittel benutzen, um Ninjago zu betreten und dass dieser daher zerstört werden muss.
Lloyd und Garmadon verteidigen sich gegen den Omega Oni. Lloyd zerschmettert den Weltenkristall, aber es ist zu spät – die Oni haben es bereits in die Welt Ninjagos geschafft. Währenddessen, retten die Ninja Leute aus dem Ninjago News Center, aber wegen eines Fehlers von Nya, verschwindet Cole inder Wolke der Dunkelheit.
Im Spinjitzu Kloster bereiten sich alle auf die Ankunft der Oni vor. Kai schmiedet die vier Goldenen Waffen – ihre letzte Hoffnung, die Oni zu besiegen. Cole schafft es zum Kloster und zusammen bemühen sich die Ninja die Waffen richtig einzusetzen. Lloyd schlägt vor den Tornado der Schöpfung heraufzubeschwören. Seite an Seite, schließen sich alle zusammen, inklusive Lord Garmadon, um den Spinjitzu Tornado zu entfesseln.