Sarah Manning, 27, Vollwaise und Gelegenheitsdrogendealerin, kehrt nach fast einem Jahr zurück in ihre Heimatstadt. Ihrem Ex-Freund Vic hat sie Kokain gestohlen, das sie jetzt mit Hilfe ihres Ziehbruders Felix, einem Stricher, verkaufen möchte. Sarah träumt davon, ihre Tochter Kira von der Pflegemutter wegzuholen, und mit Felix ein neues Leben zu beginnen. Nach ihrer Ankunft begegnet ihr auf dem Bahnsteig eine Frau, Beth Childs, die ihr zum Verwechseln ähnlich sieht. Kurz darauf wirft Beth sich vor den Zug. Sarah stiehlt deren Handtasche und beschließt, die Identität der Toten anzunehmen. Felix identifiziert die Leiche im Leichenschauraum als Sarah Manning. Doch mit der neuen Identität steht Sarah auch vor neuen Problemen: Auf dem Handy von Beth Childs gehen ständig SMS-Nachrichten eines unbekannten Anrufers ein. Die Tote war Polizistin und ist offenbar Gegenstand einer polizeiinternen Ermittlung, weil sie eine Frau erschossen hat. Beths Freund Paul scheint misstrauisch zu sein und Beths Partner Detective Art kann Sarah schwer einschätzen. Während Felix und Sarah endlich das ersehnte Geld der Toten in der Tasche haben, begegnet Sarah Katja Obinger, deren Geburtsurkunde Beth in einem Schließfach aufbewahrte und die Sarah ebenfalls ähnelt.
Sarahs Freunde halten bei Felix eine Gedenkfeier für sie ab. Als Sarah bei ihm auftaucht, läuft sie Vic fast in die Arme. Das hätte ihr gerade noch gefehlt, denn sie hat jetzt noch mehr Probleme als vorher: Als Beth wird sie von ihrem Kollegen Detective Art gezwungen, schnell wieder dienstfähig zu werden, weil er nur dann das gestohlene Geld wieder herausrückt. Dazu muss sie noch eine Sitzung bei Dr. Bowers absolvieren, um eine Tauglichkeitsbescheinigung zu bekommen. Danach folgt die erneute Anhörung vor dem Ermittlungsausschuss, die sie – dank guter Vorbereitung – auch besteht. Währenddessen klingelt unaufhörlich das Handy, auf dem eine geheimnisvolle Anruferin Sarah erst dazu anleitet, Katja Obingers Leiche verschwinden zu lassen und sich danach ihren Aktenkoffer aus dem Hotel zu beschaffen. Als sie ihn knackt, findet sie Blut- und Haarproben sowie verschiedene europäische Ausweisdokumente. Danach trifft Sarah auf eine Frau namens Alison, die in der Vorstadt wohnt und Mutter zweier Kinder ist. Sie versucht mit Alison zu reden, wird von ihr aber weggeschickt. Alison möchte um jeden Preis verhindern, dass ihre Kinder Sarah zu Gesicht bekommen, denn Alison sieht ebenfalls aus wie Sarah. Als die beiden Frauen sich abends treffen, kommt Felix als Beschützer mit. Er wartet vor dem Haus, während Sarah eine bestürzende Entdeckung macht: Es gibt noch weitere Frauen, die so aussehen wie sie. Sie alle sind Klone.
Katja Obingers Leiche wird zerstückelt in einer Sandgrube gefunden. Beth wird wieder in Dienst gestellt, ist aber aus Arts Sicht für die Ermittlungsarbeit ungeeignet und soll Bürodienst machen. Leider ist das nicht so einfach, wenn man die polizeiinternen Abläufe nicht kennt. Sarah gewinnt den Informatiker Raj als Verbündeten, der ihr am PC unter die Arme greift. Dennoch muss sie die Ergebnisse des Fingerabdruck-Vergleichs verschwinden lassen, denn Cosima befürchtet, die Ergebnisse könnten zu den Klonen führen. Eine weitere Schwierigkeit ist, dass Art einen Termin auf dem Schießstand ausgemacht hat, Sarah aber keine Ahnung vom Schießen hat. Damit Alison ihr den Schusswaffengebrauch beibringen kann, muss Felix den Babysitter geben, was überraschende Folgen hat. Als Art und Sarah in ihrer Rolle als Beth einem Hinweis auf ein gestohlenes Motorrad nachgehen, dass nach Arts Vermutung vom Mörder der unbekannten Leiche gefahren worden ist, geht alles schief. Auf Art und Sarah wird geschossen, Sarah nimmt widerwillig die Verfolgung auf, in einem Hof kommt es zu einer Begegnung mit einem weiteren Klon. Diese Frau allerdings scheint es auf Beths Leben abgesehen zu haben. Sarah hat sich in eine fast aussichtslose Lage gebracht.
Es wird für Sarah immer schwieriger, die polizeilichen Ermittlungen so zu steuern, dass die Klone unentdeckt bleiben. Helena, der neue Klon mit ausländischem Akzent, scheint in einem religiösen Wahn gefangen zu sein, andererseits verhält sie sich überaus klug und sehr berechnend. Sie sorgt dafür, dass die Polizei eins ihrer Verstecke findet und sich ein Bild machen kann, weil sie glaubt, es gäbe eine geistige Verbindung zwischen Sarah und ihr. Dazu wirft das Messer, das Sarah Helena abgenommen hat, viele Fragen auf. Wegen all dieser Ermittlungen und der drohenden Enttarnung, muss Sarahs lang ersehnter Besuch bei Kira von Alison wahrgenommen werden. Aber Kira lässt sich nicht täuschen: Die Frau, die sie besucht, ist ganz sicher nicht ihre Mutter. Alison sieht sich gezwungen, Kira in das Geheimnis einzuweihen.
Sarah hatte die Hoffnung, ihre vorläufige Entlassung aus dem Polizeidienst – und damit aus ihrer Doppelrolle als Beth – würde die Situation entspannen, doch da mehren sich die Anzeichen dafür, dass die Waisen tatsächlich Teil eines groß angelegten geheimnisvollen Experiments sind. Sarah verdächtigt zunehmend Beths Freund Paul, etwas zu verbergen. Ihre misstrauischen Fragen veranlassen jedoch wiederum Paul, Nachforschungen anzustellen, die ihn der Wahrheit bedrohlich nahe bringen. Inzwischen läuft Alison zufällig Sarahs Ex-Freund Vic in die Arme, der nun endgültig davon überzeugt ist, dass Sarah noch am Leben ist. Der Katastrophe nahe, gerät Sarah in eine direkte Konfrontation mit Paul, bei der herauskommen könnte, wer sie wirklich ist.
Sarah muss ihre Nachforschungen durch einem Ausflug in die Vorstadt unterbrechen, denn Alisons Paranoia hat Ausmaße angenommen, die alle Waisen in Gefahr bringt. Während Sarahs, Alisons und Beths Welten aufeinanderprallen, muss sich Sarah gut überlegen, wem sie ihr Geheimnis anvertrauen kann.
Sarah kann Paul nicht ausfindig machen und muss sich dem Gedanken endgültig stellen, dass eine riesige Verschwörung im Gange ist. Währenddessen erfährt Paul, dass Sarah ihm entscheidende Informationen vorenthalten hat, wodurch das ohnehin schon fragile Vertrauensverhältnis auf eine harte Probe gestellt wird. Derweil kommt Cosima der attraktiven Delphine und dem gefährlich-faszinierenden Dr. Leekie immer näher.
Sarah plant die nächsten Schritte, aber ihr Vorgehen bringt die Waisen gegeneinander auf. Während Paul verzweifelt versucht, Sarahs wahre Existenz aufzudecken, übt Alison Rache an ihrem so genannten „Monitor“, der Person, von der sie glaubt überwacht zu werden. Dabei setzt sie alles aufs Spiel, was ihr im Leben wichtig ist.
Als Kiras Leben in Gefahr gerät, zieht Sarah auf den Kriegspfad, doch Dr. Leekie warnt sie, sich genau zu überlegen, was sie tut. Inzwischen erfährt Cosima die Wahrheit über Delphine und sieht sich gezwungen, Position zu beziehen. Jetzt ist es an Sarah zu entscheiden, was mit dem Mörder geschehen soll, doch die Wahrheit über ihre Herkunft wirft ein völlig neues Licht auf alles.
Sarahs letzte Chance ihre Erzfeindin zur Vernunft zu bringen wird durch Arts Eingreifen zerstört, der auf seine Weise versucht, Antworten zu finden. Derweil müssen die Waisen entscheiden, ob sie bereit sind, mit ihren Schöpfern Frieden zu schließen, denn Sarah gerät in eine tödliche Konfrontation.