Dr. Pierce lebt nun mit Miranda in Paris. Dort sucht ihn das FBI auf, da seine Hilfe bei einem internationalen Fall gebraucht wird. Eine Delegation chinesischer Wissenschaftler wird an die Pariser Universität kommen, wo Pierce einen Vortrag halten soll. Danach wird der Chinese Dr. Soong bei einer Buchsignierung mit einem bestimmten Stift auf Pierce zukommen, welchen er unauffällig an sich nehmen soll. Dr. Soong hat eine Super-Pille entwickelt, welche die Gedächtnisleistung verbessert. Diese wird in dem Stift geschmuggelt. Pierce tut wie ihm geheißen und versteckt den Stift unter einem losen Stein auf dem Platz vor der Notre Dame.
Dr. Pierce ist wieder zurück in Chicago und schon wartet ein neuer Fall auf ihn. Diesmal braucht Donnie seine Hilfe. Der Sexualstraftäter Cyrus Dunham soll belangt werden, doch nur ein Opfer traut sich, gegen ihn auszusagen. Donnie vermutet, dass die anderen Mädchen von dem Stockholm Syndrom betroffen sind und Pierce soll das Gericht über dieses Phänomen belehren. Während des Verfahrens bricht plötzlich die Anwältin Linda Mullane zusammen und stirbt. Sie wurde angeschossen, doch niemand bemerkte den Schuss. Daniel schlussfolgert, dass Linda schon mit der Verletzung in das Gerichtsgebäude kam. Scheinbar litt sie unter einer seltenen Krankheit, wodurch sie keinen Schmerz verspürt.
Bei einem Banküberfall wird ein Junge, Dillon, als Geisel genommen, kurze Zeit später wird er jedoch frei gelassen. Da Dillon an einer Entwicklungsstörung leidet, ist er besonders naiv und sieht nur das Gute in einer Person. Pierce soll ihn befragen und findet heraus, dass zwei Männer an dem Raubüberfall beteiligt waren und einer von ihnen scheint ebenfalls krank zu sein. Moretti verdächtigt einen Bankmitarbeiter, der schon seit zwei Monaten krankgeschrieben ist. Sie nehmen den Bankkassierer Shane fest, der denkt, schon bald sterben zu müssen. Doch Pierce erkennt, dass die Symptome auch zu einer anderen, weniger gefährlichen Krankheit passen.
Moretti arbeitet an einem bisher ungelösten Mordfall. Sie besucht die Familie des getöteten Mädchens, Silvie Pavel, und erfährt dort von einem Video, welches die Lösung sein könnte. Darauf ist Elena Douglas zu sehen - mit ihr arbeitete Silvie zusammen für eine Wohltätigkeitsorganisation. Auf dem Video behauptet Elena, vom Teufel besessen zu sein und Silvie umgebracht zu haben. Als Pierce und Moretti die Frau befragen wollen, platzen sie mitten in eine Teufelsaustreibung. Doch Pierce geht viel mehr von einem Tumor in ihrem Kopf aus. Elena kann geheilt werden, doch sie behauptet noch immer, Silvie getötet zu haben, da die Stimmen es ihr befahlen. Aber Pierce ist skeptisch.
Kate und Pierce sollen den Mord an dem berühmten Neurowissenschaftler Landon Jennings aufklären, einem Pionier auf dem Gebiet der künstlichen Intelligenz. Der Fall stellt sie vor Rätsel, weil Jennings zu Hause in seinem hermetisch verschlossenen Arbeitszimmer ermordet wurde. Sein Computer war mit seiner Firma vernetzt, die daran arbeitete, menschliches Bewusstsein für die Ewigkeit zu erhalten. In der Firma macht der Projektleiter Dr. Esper Kate und Pierce mit L-Dub bekannt, einem Hologramm, das nach Jennings’ Abbild gebaut worden war. Von dessen angeblicher Intelligenz lässt sich Pierce nicht beeindrucken. Er glaubt vielmehr, dass das Hologramm vom Mörder dazu programmiert wurde, aus der Klimaanlage in Jennings’ Arbeitszimmer ein Gas ausströmen zu lassen, an dem der Wissenschaftler erstickte. Doch wer war dann der Programmierer?
Kate Moretti soll eine Kindesentführung aufklären. Doch dann stellt sich heraus, dass es sich bei der vermeintlichen Entführung bloß um eine Spielzeugpuppe handelte. Donnie will die „Puppenmutter“ Lucy anklagen, doch Daniel Pierce ahnt, dass mehr dahinter steckt und Lucy die Puppe tatsächlich für ihr Baby hält. Die Situation wird noch komplizierter, als herauskommt, dass die Entführerin Betsy die Tat nur begangen hat, weil die Puppe ihrem verstorbenen Sohn Cody ähnelte. Als Lucy dann tot aufgefunden wird, muss Pierce herausfinden, wer im Verborgenen in diesem Theater ‚die Puppen tanzen lässt‘.
Auf einer Vernissage lernt Dr. Daniel Pierce die geheimnisvolle Josephine kennen, die als Jugendliche Modell für ein inzwischen sehr wertvolles Triptychon stand. Als der Galeriebesitzer infolge eines epileptischen Anfalls, den eine Video-Installation auslöst, stirbt, tippt Pierce sofort auf Mord. Zusammen mit Kate weist er nach, dass der Künstler Kaos das Video manipuliert hat. Es sollte für ein Ablenkungsmanöver sorgen, damit ein Dieb unbemerkt das mittlere der drei Bilder stehlen und durch eine Fälschung ersetzen konnte. Auf der Suche nach dem echten Bild gibt es für Pierce ein Wiedersehen mit der schönen Josephine, mit der er die Nacht verbringt. Als Kaos ebenfalls ermordet wird, wollen Pierce und Kate den Fälscher des Bildes ermitteln und so den Mörder ausfindig machen.
Daniel Pierce wird mit der Vergangenheit konfrontiert, als die verweste Leiche von FBI Agentin Anne-Marie Bishop entdeckt wird. Damals hatte er mit ihr in einem Fall ermittelt, in dem ein Serienmörder psychisch Kranke mit Heroin umgebracht hat und es wie eine Überdosis aussehen ließ. Agentin Bishop wurde daraufhin selbst entführt und Pierce erlitt einen psychotischen Schub und landete ein halbes Jahr in der Klinik des Psychiaters Dr. Josiah Rosenthal. Entgegen aller Warnungen lässt Pierce sich darauf ein, Kate bei den Ermittlungen zu helfen. Ein Opfer, das überlebt hat, Tasha Ogden, bringt sie auf die Spur eines gewissen Duxbury, dessen Tochter einst von einem Verrückten ermordet worden war, den er in Selbstjustiz umbringen wollte. Doch Pierce ist davon überzeugt, dass der wahre Mörder sie auf Duxburys Spur gesetzt hat. Und schließlich bekommt der Wahnsinn auch ein Gesicht.
Ein Scharfschütze nimmt die Lobby des Regierungebäudes, und damit auch Donnie und Moretti ins Visier. Pierce findet heraus, dass der Schütze niedrigfrequente Radiowellen fürchtet. Eine charmante Frau bringt Donnie dazu, für eine Stelle zu kandidieren.
Pierce hilft Donnie aus einer brennzligen Situation, in der sich die Beweise gegen ihn häufen. Der Vater von Pierce greift jemanden in einer Einrichtung für betreutes Wohnen an.
Pierce wird schwer verletzt und benötigt wohl einen sehr risikoreichen operativen Eingriff, um auf lange Sicht keine Schmerzen mehr zu haben. Gleichzeitig taucht er in einen neuen Mordfall ein, der einige Fragen aufwirft.
Moretti geht auf eine Undercover-Mission, um einen brutalen Mordfall aufzuklären. Pierce spielt unterdessen mit dem Gedanken, eine persönliches Geständnis gegenüber Moretti abzulegen.
Ein internationaler Skandal macht die Runde, als Pierce und Moretti sich den Morden an einem Diplomaten und einem Reporter widmen. Moretti ist darüber hinaus damit beschäftigt, ihre Hochzeit mit Donnie zu planen.
Eine Studentin wird ermordet aufgefunden und ihr psychisch labiler Freund wird beschuldigt, die Tat begangen zu haben. Doch Dr. Daniel Pierce hat seine Zweifel daran und nimmt den jungen Mann in Schutz. Während Kate und Donnie tief in ihren Hochzeitsvorbereitungen stecken, muss Pierce sich seinen Gefühlen stellen.
Am Tag ihrer Hochzeit, kurz bevor der Trauung, verschwindet Kate und kurze Zeit später erhält Daniel Pierce einen Anruf ihres Entführers. Die Forderung: Der zum Tode verurteilte Serienmörder Dr. Josiah Rosenthal soll im Austausch mit Kate freigelassen werden. Mithilfe eines Tricks - der Donnie und Pierce selbst hinter Gitter bringen könnte - gelingt es den beiden, Rosenthal von den anderen Beamten abzuschirmen und so die Geisel-Gefangenen-Übergabe einzuleiten. Diese gelingt zwar und Kate ist in Sicherheit, doch auch ein Serienmörder ist nun wieder auf freiem Fuß.