Polizei-Inspektorin Akane Tsunemori und ihr Team machen Jagd auf einen Mann, der aus Frust über das autoritäre Sybel-System mehrere Bombenanschläge verübt hat.
Der festgenommene Bombenleger ist den Ermittlern ein Rätsel. Sein Psychopass verhält sich äußerst ungewöhnlich und er redet irgendetwas von einer unsichtbaren Frau.
In Akanes Wohnung hat jemand die rätselhaften Buchstaben „WC ?“ an die Wand gekritzelt. Sie selbst hat das nicht getan, aber außer ihr war keine andere Person in Ihrer Wohnung gewesen.
Eine ominöse Person namens Kamui bringt das Sybel-System an den Rand des Kollapses. Die Einheiten des Amtes für Öffentliche Sicherheit sind nicht mehr Herr der Lage.
Akane macht Jagd auf die unsichtbare Kamui. Derweil zieht Akanes Chefin – die Direktorin des Amtes für Öffentliche Sicherheit - im Hintergrund undurchsichtige Fäden.
Mit perfider Raffinesse verschafft sich Kamui Zugang zu den Waffen (Dominatoren) mehrerer Inspektoren des AÖS. Akane geht auf volles Risiko und kommt Kamui gefährlich nahe.
Nach dem ersten Zusammentreffen mit Kamui setzen sich in den Ermittlungen von Akane und ihren Kollegen immer mehr Puzzleteile zusammen. Doch offenbar wurde das AÖS selbst vom Feind unterwandert.
Während der Rest des Teams weiter nach Kamui sucht, ermittelt Inspektorin Shimotsuki auf eigene Faust und stößt dabei auf ein dunkles Geheimnis.
Die Jagd auf Kamui und ihr Wissen über die Wahrheit des Sybil-Systems wird für die beiden Inspektorinnen Tsunemori und Shimotsuki immer gefährlicher und fordert weitere Opfer.
Kirito Kamui richtet ein Massaker in einem Zug an. Offenbar betreibt Kamui einen Rachefeldzug gegen die Direktorin des Amtes für Öffentliche Sicherheit Misako Togane.
Das Sybel-System ist am Ende.