Staffel 1

Mit dem Projekt Ikarus soll das neunte und letzte Chevron am Stargate aktiviert werden. Die Ikarus-Basis auf einem fremden Planeten wird von unbekannten Goa'uld-Truppen überrannt. In letzter Sekunde wählt Dr. Nicholas Rush eine Adresse mit allen neun Symbolen und das Personal des Stützpunktes wird durch das Stargate evakuiert. Die Überlebenden finden sich auf dem uralten, unbemannten Antiker-Raumschiff Destiny wieder, das mehrere Milliarden Lichtjahre von der Erde entfernt auf einem automatischen Kurs das Universum erkundet. Ihre unmittelbare Sorge ist es, das ausgefallene Lebenserhaltungssystem wieder in Gang zu bekommen und Lecks in der Hülle zu schließen, durch die Atemluft entweicht.

Mit dem Projekt Ikarus soll das neunte und letzte Chevron am Stargate aktiviert werden. Die Ikarus-Basis auf einem fremden Planeten wird von unbekannten Goa'uld-Truppen überrannt. In letzter Sekunde wählt Dr. Nicholas Rush eine Adresse mit allen neun Symbolen und das Personal des Stützpunktes wird durch das Stargate evakuiert. Die Überlebenden finden sich auf dem uralten, unbemannten Antiker-Raumschiff Destiny wieder, das mehrere Milliarden Lichtjahre von der Erde entfernt auf einem automatischen Kurs das Universum erkundet. Ihre unmittelbare Sorge ist es, das ausgefallene Lebenserhaltungssystem wieder in Gang zu bekommen und Lecks in der Hülle zu schließen, durch die Atemluft entweicht.

Die Destiny hat für 12 Stunden gestoppt. In diesem Zeitraum können naheliegende Stargates angewählt werden. Colonel Young und Chloe benutzen die Antiker-Kommunikationssteine, um Kontakt mit der Erde aufzunehmen. Währenddessen suchen Scott, Eli, Rush, Greer und drei weitere Crewmitglieder auf einem Wüstenplaneten nach Mineralien, die das Kohlenstoffdioxid aus der Luft filtern könnten. Nach einer gefährlichen Mission in der Wüste kehren sie schließlich erfolgreich auf die Destiny zurück und das Lebenserhaltungssystem kann wieder in Betrieb genommen werden.

Die Energiereserven der Destiny sind verbraucht und fast alle Systeme fallen aus - inkl. Antrieb. Colonel Telford gibt Colonel Young die Schuld dafür und will, dass er seines Kommandos enthoben wird. Währenddessen zeichnet Eli Abschiedsbotschaften der Crewmitglieder auf. Die Destiny treibt auf ein vom Raumschiff ausgewähltes Planetensystem zu, in dem sich mehrere erdähnliche Planeten befinden. Durch eine Atmosphärenbremsung in der Atmosphäre eines Gasplaneten verändert sich der Kurs des Raumschiffes anders, als gewollt, sodass die Destiny nun auf die Sonne des Systems zu treibt.

Als die Destiny unbeirrt auf Kollisionskurs mit einer Sonne ist, will die Crew auf einen nahe gelegenen Planeten flüchten. Da das einzige Rettungsshuttle nicht ausreichend Platz für alle bietet, will Col. Young (Louis Ferreira) das Los entscheiden lassen. Er und Rush enthalten sich des Losverfahrens. Als die Zurückgelassenen auf ihren sicheren Tod warten, geschieht das Unglaubliche: Das Schiff gewinnt wieder an Energie...

Auf mysteriöse Weise verschwinden große Mengen der Wasservorräte an Bord der Destiny. Die Crew setzt all ihre Hoffnung auf Col. Young (Louis Ferreira) und Lt. Scott (Brian J. Smith), die von einem nahe gelegenen Planeten Eis beschaffen sollen. Zwischenzeitlich findet Johansen (Alaina Huffman) heraus, dass Staubaliens, die sich an Bord geschmuggelte haben, Ursache für das schwindende Wasser sind...

Die Lage an Bord der Destiny ist kritisch: General Jack ONeill (Richard Dean Anderson) und das Homeworld Command befehlen Col. Young (Louis Ferreira), einen risikoreichen Plan auszuführen, durch den die Besatzung zur Erde zurückgebracht werden soll...

Die Crew hat einen neuen Dschungel Planeten entdeckt. Zu ihrer Überraschung finden sie in der Nähe des Gates eine Kameradrohne. Nach dem der Dateien entdeckt Eli (David Blue) ein Video des Teams, das anscheinend bereits bei einem früheren Besuch gedreht wurde. Doch als ein Teammitglied plötzlich erkrankt, ist die Herkunft des mysteriösen Videos nur noch nebensächlich. Da sie aufgrund der Infektionsgefahr nicht zur Destiny zurückkehren können, campiert das Team im Dschungel. Als es Nacht wird, stellt sich jedoch heraus, dass die Krankheit bald ihre kleinste Sorge sein wird...

Lieutenant Scott und Camile Wray machen ihre ersten privaten Besuche auf der Erde. Scott findet dabei heraus, dass er einen achtjährigen Sohn hat. Wray besucht ihre Lebensgefährtin. Colonel Young findet heraus, dass sich Colonel Telford seiner Frau annähert und schlägt ihn deshalb bei seinem nächsten Erdbesuch zusammen. Dr. Rush entdeckt ein neurales Interface, mit dem man wahrscheinlich der Entsperrung der Schiffssysteme näher kommen könnte, Young untersagt jedoch dessen Gebrauch, da es gefährlich sein könnte. Rush weckt bei der Crew mit einer Fehlinformation die Hoffnung, binnen eines Jahres nach Hause zu kommen, sein Betrug fliegt jedoch auf.

Sgt. Spencer wird durch einen Kopfschuss getötet aufgefunden; die Waffe fehlt am Tatort. In Colonel Youngs Quartier wird eine Waffe gefunden und Young wird dadurch zum Hauptverdächtigen. Er tritt vom Kommando zurück und übergibt es an Camile Wray, eine IOA-Repräsentantin. Diese gestattet es Dr. Rush, anders als Young zuvor, am neuralen Interface weiter zu forschen. Bei dessen Benutzung wird Dr. Franklin verletzt und fällt in einen komatösen Zustand. Eli findet gelöschte Aufnahmen, die beweisen, dass Spencer Suizid begangen hat. Auf einem Planeten wird ein verlassenes Raumschiff gefunden. Während dessen Untersuchung konfrontiert Young Rush mutmaßend mit den gelöschten Aufnahmen. Rush gibt daraufhin zu, dass er Young loswerden wollte. Young schlägt Rush zusammen, kehrt ohne ihn auf die Destiny zurück und übernimmt wieder das Kommando. Rush, dessen Fehlen Young auf einen Unfall schiebt, ist gestrandet.

Die Antikersteine verbinden plötzlich nicht mehr mit der Erde, sondern mit Außerirdischen auf einem Raumschiff. Kurz darauf greift eben jenes Raumschiff die Destiny an. Chloe wird von einem Entertrupp entführt. Young begibt sich erneut über die Antikersteine auf das Schiff. Dort entdeckt er Rush, den die Außerirdischen zuvor auf dem einsamen Planeten gefunden hatten. Young kehrt zurück und befiehlt die Zerstörung des gegnerischen Schiffes. Rush und Chloe können jedoch in den Wirren des Gefechts ein Shuttle stehlen und zurück zur Destiny fliegen, bevor die Außerirdischen fliehen. Um die Crew nicht noch weiter zu demoralisieren, verheimlicht Rush, dass Young ihn absichtlich zum Sterben zurückließ. Er spricht nur mit Camile Wray darüber, die ohnehin schon davon überzeugt war.

Dr. Nicholas Rush (Robert Carlyle) und Chloe (Elyse Levesque) werden von schlimmen Alpträumen heimgesucht. Diese Träume sind erstmals nach ihrer Gefangenschaft auf dem Raumschiff der Außerirdischen aufgetreten. Deshalb hegt Rush einen Verdacht: Möglicherweise ist irgendwo auf der Destiny ein Peilsender versteckt. Col. Young (Louis Ferreira) und Lt. Scott (Brian J. Smith) schenken dieser Theorie Glauben und lassen eine Suche im Schiffsrumpf durchführen. Schon bahnt sich die nächste Gefahr an: Eine Gruppe von Besatzungsmitgliedern droht mit Meuterei.

Zur Neige gehende Vorräte und ermüdende Routine untergraben die Moral der Crew immer stärker. Plötzlich wird die Destiny aus der Lichtgeschwindigkeit gerissen und strandet in einem unbekannten Sonnensystem mit nur einem Planeten. Dr. Rush kann es sich nicht erklären, dass das System auf keiner Karte eingezeichnet ist. Lt. Scott und ein kleines Team machen sich in einem Shuttle auf den Weg zu dem Planeten. Dort herrschen paradiesische Zustände. Die klare Luft und das saubere Wasser lassen die Crew glauben, die Entdeckung sei eine Vorsehung gewesen. Die Rückkehr auf die Destiny erscheint den Besatzungsmitgliedern nicht mehr sonderlich erstrebenswert ...

Entgegen der klaren Order versucht Dr. Rush, den geheimen Code der Destiny zu knacken, indem er sich über das neuronale Interface mit dem System des Schiffs verbindet. Er hofft, so an den Code zu kommen, der die Flugroute der Destiny kontrolliert. Colonel Young sieht sich vor vollendete Tatsachen gestellt und weiß nicht recht, wie er darauf reagieren soll. Derweil hat die Destiny den Lichtgeschwindigkeits-Modus verlassen und steuert auf einen Planeten zu, der die Überreste einer alten Zivilisation beherbergt. Lieutenant Scott, Eli, Chloe und Greer haben nur sechs Stunden Zeit, um die unterirdischen Ruinen zu untersuchen, bevor das Schiff erneut springt ...

Die Situation für Lt. Scott, Eli, Chloe und Greer ist düster, da sie es nach einer Erkundungsexkursion zu einer Ruine nicht mehr rechtzeitig zurück auf die Destiny geschafft haben, bevor diese automatisch mit Lichtgeschwindigkeit weiterflog. Sie fragen sich, ob sie auf dem Planeten auch so überleben könnten. Doch zuerst müssen sie einen Weg aus der Ruine finden, in der sie sich befinden. Derweil herrscht an Bord der Destiny rege Betriebsamkeit. Dr. Rush kann das Schiff jedoch nicht einfach stoppen und schon bald wird ihr Kurs sie in eine ganz andere Galaxie transportieren, und die Crew auf dem Planeten wird für immer dort gestrandet sein. Fieberhaft versucht Rush mit Colonel Young eine Lösung zu finden ...

Die Destiny jagt weiter auf ihrem Kurs in die nächste Galaxie. Doch während immer noch drei Besatzungsmitglieder auf einem Planeten ausharren, rechnet Dr. Rush aus, dass die gegenwärtige Antriebskraft nicht ausreihen könnte, um ihr nächstes Ziel zu erreichen. Mithilfe des Kommunikationssteines gelingt es jedoch, eine ausgewiesene Expertin auf dem Gebiet des Hyperantriebs an Bord zu holen. Die attraktive Wissenschaftlerin Amanda Perry ...

Auf der Destiny haben einige Besatzungsmitglieder schwere psychische Probleme: Sie erleben verstörend realistische Halluzinationen. Man befürchtet, dass die dauernde Stresssituation an Bord des Raumschiffs daran Schuld ist. Nachdem Dr. Tamara Johansen (Alaina Huffman) die Betroffenen abgeschottet hat, stellt sie eine eigene Theorie auf. Sie vermutet, dass eine Verbindung zwischen den Halluzinationen und dem letzen Planetenbesuch besteht. Als Johansen denkt, die Gefahr kontrollieren zu können, entdeckt sie, dass die Halluzinationen auch auf andere Besatzungsmitglieder übertragen wurden.

Dr. Rush (Robert Carlyle) hat einen aufwühlenden Traum: Er nimmt an einer Konferenz mit der Lucian Allianz teil und enthüllt geheime Informationen. Seltsamerweise begeht er diesen Verrat in der Gestalt von Col. Telford (Lou Diamond Phillips). Im Vertrauen erzählt er Col. Young (Louis Ferreira) von seinem verwirrenden Traum. Young vermutet, dass eine überlappende Erinnerung durch den Gedächtnisaustauch mit Telford hierfür die Ursache sein könnte. Dr. Rush verdächtigt nun Telford ein Spion der befeindeten Allianz zu sein.

Die Luzianer-Allianz zwingt Dr. Rush dazu, ihnen dabei behilflich zu sein, einen Angriff auf die Destiny zu organisieren.

Die Besatzung der Destiny muss um ihr Leben kämpfen, als Mitglieder der Luzianer-Allianz durch ein Stargate kommen und das Schiff entern wollen.