Penny und Leonard wiederholen ihre Hochzeitszeremonie, diesmal mit ihren Freunden sowie Pennys und Leonards Eltern. Sheldons Mutter Mary und Leonards Vater Alfred haben den Abend zuvor gemeinsam im Hotel verbracht, was für eine merkwürdige Spannung unter allen Beteiligten sorgt. Ein Repräsentant der Air Force steht unterdessen auf der Matte, auf der Suche nach dem ohnehin schon von Paranoia geplagten Howard.
Sheldon, Leonard und Howard sagen ihre Mitarbeit an dem Gyroskop-Projekt für die Regierung zu. Als Colonel Williams erzählt, dass die Wissenschaftler am MIT das Projekt in vier Monaten abschließen könnten, fühlt sich Sheldon in seiner Ehre verletzt und schlägt übermütig vor, nur zwei Monate zu benötigen. Bernadettes Arbeitskollegen finden heraus, dass sie schwanger ist. Eigentlich wollte Bernadette ihre Schwangerschaft verschweigen, um ihre Mitarbeit in einem Forschungsprojekt nicht zu verlieren. Wer hat es ausgeplaudert?
Die Jungs sind vollkommen überfordet mit dem engen Zeitrahmen für das Regierungsprojekt. Sheldon (Jim Parsons) versucht es deshalb mit einem Energy Drink – mit unangenehmen Nebenwirkungen ... Penny (Kaley Cuoco) begleitet Amy (Mayim Bialik) zu einer Party, die der Geologe Bert (Brian Posehn) bei sich zu Hause schmeißt. Da die beiden die einzigen teilnehmenden Gäste sind, unterhalten sie sich ausführlich mit dem Gastgeber. Dabei kommt überraschend heraus, dass Amy und Sheldon die populärsten Wissenschaftler auf dem Campus sind ... Bernadette (Melissa Rauch) vertraut sich Raj (Kunal Nayyar) an und gesteht ihm ihre wahren Gefühle über das Baby.
Amys Wohnung ist wegen eines Rohrbruchs zur Zeit unbewohnbar. Unter Vorwand eines Experiments kann der skeptische Sheldon überzeugt werden, mit Amy für die kommenden fünf Wochen in Pennys Wohnung einzuziehen, während Penny in der Nerd-WG unterkommt. Für Sheldon und Amy bedeutet das: Sie müssen sich gemeinsam ein Bett teilen. Die erste Nacht verläuft jedoch alles andere als romantisch ... Raj begleitet Howard und Bernadette zum Frauenarzt. Während die beiden werdenden Eltern sich überraschen lassen wollen, ob sie einen Jungen oder ein Mädchen bekommen werden, erhascht Raj einen Blick in die Unterlagen. Howard und Bernadette sind hin- und hergerissen, ob sie das Geschlecht des Babys nun auch wissen wollen.
Howard und Bernadette haben sich kurzfristig entschieden, doch nicht in den Urlaub zu fahren. Stattdessen bleiben sie zu Hause, ohne ihren Freunden davon zu erzählen. Am ersten Abend hören sie merkwürdige Geräusche – und müssen erfahren, dass ihr Whirlpool ungefragt benutzt wird ... Sheldon möchte seinen Badezimmernutzplan durchsetzen. Da Amy sich jedoch weigert, droht Sheldon damit, ihre gemeinsame Beziehung zu beenden. Penny und Leonard versuchen, die Wogen zu glätten ...
Penny wird für ihre Rolle im Film „Serial Ape-ist“ als Gast zur Van Nuys Comic Con eingeladen, wo sie an der Signierstunde teilnehmen soll. Leonard begleitet sie und zieht die Aufmerksamkeit ungewollt auf sich ... Amy und Sheldon veranstalten währenddessen einen Probebrunch und Bernadette ist von Howards teurer Anschaffung wenig begeistert.
Eigentlich ist der Wasserschaden in Amys Appartment längst behoben und die Wohnung wieder bezugsbereit, doch um weiter mit Sheldon in einer Wg zu leben, lügt sie ihn über den Status der Renovierungsarbeiten an. Leonard kommt unterdessen Penny auf die Schliche: Nach und nach lässt sie sämtliches Merchandising aus seinem Zimmer verschwinden, ohne dass er es merkt ...
Nach einem geglückten wissenschaftlichen Experiment ist Sheldon überzeugt: Amys und seine DNA passen perfekt zueinander. Daher bleibt ihnen nur eines: Sie müssen sich sofort fortpflanzen und ein Super-Baby zur Welt bringen. Raj ist es unterdessen zu peinlich, Howard, Penny und Leonard den Beruf seines Dates zu verraten ...
Der Geologe Bert wird mit dem MacArthur Genius Stipendium ausgezeichnet – was Sheldon vollkommen ungerechtfertigt findet. Doch als er Berts Arbeit durchliest, muss auch er den Verdienst anerkennen. Sheldons Versuch, seinem Ärger Luft machen, geht daraufhin aber gehörig schief. Howard kramt eine alte Erfindung hervor, die er vor einigen Jahren gebastelt hat: Eine ferngesteuerte Miniaturfigur von Stephen Hawking. Doch nicht alle sind davon so begeistert wie er. Was würde wohl Stephen Hawking dazu sagen ... ?
Sheldon und Leonard können sich nicht einigen, welche der gemeinsamen Dinge wem zustehen. Gezwungenermaßen möchte der Comicbuchhändler Stuart wieder bei Howard und Bernadette einziehen. Im Gegenzug bietet er seine Hilfe an, Bernadette während ihrer Schwangerschaft zu entlasten. Das passt dem eifersüchtigen Raj gar nicht. Ein Wettstreit um Bernadettes Gunst beginnt ...
Die Wehen setzen ein! Howard, Raj und Stuart bringen Bernadette ins Krankenhaus. Doch die Aufregung ist umsonst: Fehlalarm. Am nächsten Tag dokumentiert Raj den Tag mit der Kamera und verplappert sich hinsichtlich des Geschlechts des Kindes. Bernadette und Howard sind enttäuscht – sie wollten das Geschlecht eigentlich erst bei der Geburt erfahren. Pünktlich um Mitternacht soll Amy ihr Geschenk von Sheldon bekommen: Den jährlichen Koitus! Da sie jedoch gestört werden, müssen sie ihn auf später verschieben. Als es sich für Sheldon nicht mehr natürlich, sondern gezwungen anfühlt, hat Amy eine Idee. Doch das geht vollkommen nach hinten los ... Dann ist es tatsächlich soweit: Das Baby kommt!
Sheldon und Amy kehren von ihrem Weihnachtsbesuch bei Sheldons Mutter Mary aus Texas zurück und erzählen Leonard und Penny von ihrem Erlebnis. Entgegen seiner Befürchtungen ist Mary erleichtert, dass er endlich fest mit einer Frau zusammen ist. Marys Vorwurf, die Zuneigung einer Frau zu ihm käme einem Wunder gleich, lässt ihn jedoch durchdrehen ... Außerdem: Leonard und Penny besorgen eine Weihnachtsbaum auf die komplizierte Art und Bernadette ist fertig mit den Nerven – das Baby schreit unentwegt.
Penny ist gefrustet: Seit sie mit Leonard verheiratet ist, lässt er sich komplett gehen und sorgt für keinerlei Romantik mehr. Also fährt sie mit Amy in ein Spa, um ein wenig Abstand zu gewinnen. Leonard macht sich Gedanken, wie es mit ihrer Beziehung weitergehen kann ... Howard und Raj haben eine Idee, wie sie das Problem mit dem quietschenden Parkettboden im Babyzimmer lösen können ...
Raj hat einfach kein Glück bei den Frauen. Auch seine neueste Bekanntschaft hat ihm wieder den Laufpass gegeben. Doch was macht er falsch? Um das herauszufinden, lädt er all seine Ex-Freundinnen zu sich nach Hause ein. Howard kann nicht widerstehen, sich das Spektakel anzusehen ... Sheldon fällt es immer noch schwer, die Emotionen anderer Leute richtig zu deuten. Da kommt die Erfindung von Wissenschaftlern des MIT gerade richtig: Ein tragbarer Emotionendetektor analysiert die Gesichtszüge von Personen und schickt die Emotion in Form eines Emojis aufs Sheldons Smartphone. Das führt zu einem Streit zwischen Penny und Leonard ...
Weil Sheldon die beiden von ihrer Arbeit für das Militär abhält, greifen Leonard und Howard zu ungewöhnlichen Mitteln. Doch auch in seiner Abwesenheit beschert Sheldon ihnen zusätzlichen Aufwand … Penny und Amy wollen Bernadette für einen Abend ausführen, um auf andere Gedanken zu kommen. Währenddessen kümmern sich Raj und Stuart um Halley – natürlich nicht ohne Konflikte.
Amy ist schockiert, als sie erfährt, dass Sheldon seinen Freunden und Arbeitskollegen intime Details ihrer Beziehung offenbart hat. Auch Raj ist schockiert, als ihm klar wird, wie verwöhnt und abhängig er vom finanziellen Segen seines Vaters ist: Dieser bezahlt sein Auto, seine Miete, seine Kreditkarten, die Lebensmittel … Raj möchte dies ändern, auch wenn er dafür Einschnitte hinnehmen muss.
Ohne die finanzielle Unterstützung seines Vaters kann Raj sich keinen Luxus mehr erlauben – also auch keine Fahrt zur anstehenden Comic-Con! Also beauftragt er Sheldon, sich um seine Finanzen zu kümmern, während er sich nach einer Verdienstmöglichkeit umsieht. Wie gut, dass Stuart noch eine Aushilfe für seinen Comicladen sucht … Um Leonard einen Gefallen zu tun, möchte Penny die Jungs zur Comic-Con begleiten. Dieser ist aber alles andere erfreut und versucht sie unterschwellig, von diesem Plan abzubringen.
Raj ist noch immer auf der Suche nach einer neuen Bleibe. Leonard und Penny bieten ihm an, übergangsweise bei ihnen einziehen zu können. Howard und Bernadette würden ihm die Garage zur Verfügung stellen. Nachdem sich Raj zunächst für Sheldons altes Zimmer entschieden hatte, schleicht er sich nachts aus dem Haus, um Howards Angebot anzunehmen – und sorgt für einen Riesenschock.
Raj ist bei Leonard und Penny eingezogen – und fühlt sich hier pudelwohl. Wenn es nach Leonard geht, verstehen sich Raj und Penny fast zu gut … Sheldon beginnt sich für Amys Forschung zu interessieren. Plötzlich merken sie, dass sie sich gegenseitig zu neuen Höchstleistungen pushen können …
Sheldon muss an mehreren Baustellen gleichzeitig arbeiten: Gemeinsam mit Leonard und Howard am Projekt für die Regierung und mit Amy am gemeinsamen Forschungsprojekt. Das wirft ihn gesundheitlich vollkommen aus der Bahn …
Bert hat eine Freundin! Nicht nur Sheldon und Co. sind von dieser ungewöhnlichen Nachricht überrascht. Beim gemeinsam Pärchenabend kommt heraus, wie sich Rebecca und der Geologe kennengelernt haben: Über eine Datingseite im Internet. Auch Bert selber konnte sein Glück zunächst nicht fassen: Jahrelang wurde er ignoriert. Nachdem er sein Profil jedoch geupdatet und um einen Hinweis über sein hochdotiertes MacArthur Genius Stipendium ergänzt hat, flogen die Frauen förmlich auf ihn. Hat Rebecca es nur auf Berts Geld abgesehen? Bernadette und Howard stehen kurz davor, Halley zum ersten Mal in der Kindertagesstätte abzugeben. Doch der Abschied fällt alles andere als leicht …
Zwischen Leonard und Penny kriselt es noch immer. Zu allem Unglück trifft Penny während eines Mädelsabends mit Bernadette und Amy auf ihren Ex-Freund Zack, der ihr ein Job-Angebot macht. Leonard ist davon alles andere als begeistert … Sheldon muss erschrocken feststellen, dass seine kognitiven Fähigkeiten nachlassen – und die Zeitspanne, einen Nobelpreis zu gewinnen, somit immer enger wird. Howard zeigt ihm einige Tricks, mit denen er seine Fähigkeiten vermeintlich stärken kann …
Geschafft! Sheldon, Leonard und Howard haben die erste Phase ihres Regierungsprojekts für die Air Force abgeschlossen. Doch als sie mit Phase 2 beginnen wollen, erleben sie eine böse Überraschung: Die Air Force hat sämtliche Entwicklungen und Prototypen entwendet und führt das Projekt von nun an alleine fort … Amy hat für den Sommer eine Stelle als Gastforscherin an der Princeton University angeboten bekommen. Allerdings plagt sie das schlechte Gewissen: Kann sie Sheldon alleine lassen, ohne dass ihre Beziehung zerbricht?
Während Amy ihren Forschungsaufenthalt in Princeton beginnt, kehrt die attraktive Ramona Nowitzki von ihrem Forschungseinsatz im CERN in der Schweiz zurück und wirft sich gleich an Sheldon heran. Dieser erkennt die wahren Absichten jedoch nicht und hält sie für eine normale Kollegin, mit der er auf einer Wellenlänge liegt. Penny, Leonard und Co. versuchen, ihm die Augen zu öffnen – und die sich anbahnende Gefahr Amy gegenüber zu verschweigen. Erst als Ramona ihn küsst, beginnt Sheldon zu verstehen – und zu handeln …