XIII (Stuart Townsend) wird nun von der Regierung gejagt ebenso wie von dem mysteriösen Agenten, der ihn gefoltert hat. Außerdem will sich der Konzern Synequanon für den auf ihn verübten Anschlag rächen. XIII sucht verzweifelt nach Hinweisen für die gewaltige globale Verschwörung, der er langsam auf die Schliche kommt.
