Eric, der von Calleigh angeschossen wurde, irrt verwundet durch die Everglades und wird bewusstlos von seinem Team gefunden. Während Eric mit dem Tode ringt, erinnern sich die Mitglieder des Teams daran, wie alles begann: 1997 war Eric als Abschleppwagenfahrer in den Glades unterwegs und stieß dort auf einen Wagen, in dem eine weibliche Leiche lag. Der damalige Partner Horatios, John Sullivan, verdächtigte den Ehemann Steve Bowers der Tat.
Jesse Cardoza, ein ehemaliger Kollege von Horatio Caine, will wieder zurück nach Miami. Als er sich beim CSI anmeldet, gerät er in eine Geiselnahme. Mathew Sloan nimmt Jesse Cardoza, die Rezeptionistin Danielle und zwei Techniker als Geisel und verschanzt sich im Gebäude des CSI. Er verlangt einhunderttausend Dollar und einen Hubschrauber. Mathew besteht darauf, nur mit Horatio Caine zu verhandeln. Er verlangt, dass das Lösegeld für die Geiseln von einer bestimmten Wechselstube beschafft wird.
Drei Volleyballspieler sterben auf mysteriöse Weise während eines Beach-Volleyball-Turniers. Die Todesursache ist schnell ermittelt: Stromschlag. Im Sand finden die Ermittler ein Kabel verbuddelt, das den Strom von einem nahe gelegenen improvisierten Blitzableiter auf einem Rettungsturm direkt bis unter die Füße der Spieler transportiert hat. Wer hat diese merkwürdige Gerätschaft konstruiert? Horatio und sein Team erkennen schnell, dass zwischen den jungen Volleyballern und den älteren Ladys auf der Tribüne eine sexuelle Beziehung bestanden haben muss.
Der Investor Howard Burgess ist Miamis meistgehasster Mann, da er viele Investoren um ihre Ersparnisse gebracht hat. Da verwundert es niemanden, als er tot in der Bordtoilette seines Flugzeugs gefunden wird. Anscheinend wollte Burgess sich mit Flugzeug und dem ergaunerten Geld aus dem Staub machen. Tom Loman, der neue Gerichtsmediziner, entdeckt typische Würgemale an Burgess' Hals, die darauf deuten, dass dieser mit einer Kette erwürgt worden ist. Eine Seilwinde im Hangar, in der sein Flugzeug steht, weist Blutspuren auf, damit ist die Mordwaffe schon gefunden. Walter Simmons' Entzücken kennt keine Grenzen, als er zusammen mit Jesse Cardoza den Inhalt des Abwassertanks des Flugzeugs untersuchen muss. Dort findet sich tatsächlich eine Kontaktlinse, die dem wahren Besitzer des Flugzeugs, Gary Archer, gehört und der zudem ein Motiv hat, Burgess den Tod zu wünschen.
Das junge Mädchen Lauren wird mit Vergiftungserscheinungen ins Krankenhaus eingeliefert. Alexx kann sie nicht mehr retten und gibt Horatio den Tipp, dass wahrscheinlich ihr Freund Ethan, der bei der Einlieferung dabei war, der Täter sein könnte. Als Ethan kurz darauf auch zusammenbricht, stehen die Ermittler vor einem Rätsel. Alexx findet heraus, dass Lauren an einer akuten Kolibakterienvergiftung gestorben ist. Da diese Krankheit ähnliche Symptome wie eine normale Grippe aufweist, wurde sie falsch behandelt. Bei Ethan liegt der Fall schlimmer. Er hat keine Anzeichen einer Kolibakterieninfektion, sondern ist an Botulismus erkrankt, die von einer Mutation eines Bakteriums hervorgerufen wird. Lauren hatte kurz vor ihrer Erkrankung in einem Restaurant einen Salat zu sich genommen, der mit diesen Kolibakterien verseucht war. Horatio folgt der Lieferantenkette bis zu Bixton Biofood und erkennt in dieser Firma den wahren Verursacher dieser Tragödie.
Kim Hewitt steht kurz vor ihrer Hochzeit. Doch die Braut wartet vor dem Altar vergeblich auf ihren Bräutigam. Dessen Trauzeugen werden bald gefunden. Die beiden befinden sich aneinandergefesselt in einem öffentlichen Brunnen, leiden aber unter einer Amnesie und können über den Verbleib des Bräutigams keine Angaben machen. Calleigh und Cardoza nehmen die Junggesellenparty genauer unter die Lupe, wo sich die Spuren des Vermissten erstmals verlieren.
[1. Teil des CSI:Miami/CSI:NY/CSI Crossover] Eine völlig aufgelöste Frau meldet ihre Tochter Ashley Tanner als vermisst. Ashleys Wagen wird gefunden, und alle Zeichen lassen eine gewaltsame Entführung vermuten. Das Team konzentriert sich auf jene Personen, die Ashley kurz vor deren Verschwinden getroffen hatten. Eine erste heiße Spur führt zu einem ähnlich gelagerten Fall nach Las Vegas. Dr. Ray Langston sagt seine Hilfe zu und nimmt den nächsten Flug nach Miami.
Horatio und sein Team untersuchen einen tödlichen Autounfall auf menschenleerer Straße. Victor Emparo, ein Jogger, leistete Erste Hilfe und rettet Greg Ballard aus dem Autowrack, für dessen Mutter kommt allerdings jede Hilfe zu spät. Jesse Cardoza wird bei der ersten Vernehmungen stutzig und sagt Victor auf den Kopf zu, dass er den zweiten Wagen gefahren ist. Doch kurz darauf stirbt Victor an den Folgen einer Gehirnverletzung. Bei der Rekonstruktion des Unfallherganges sind die Ermittler gezwungen, auf komplizierte Art und Weise die Sitzposition der einzelnen Familienmitglieder zu ermitteln um festzustellen, wer den Unfallwagen gefahren hat. Dadurch stellt sich heraus, dass Lily, die vierzehnjährige Tochter, den Unfallwagen gesteuert hat, weil ihre Mutter ihre Brille bei ihrem Geliebten hat liegen lassen. Bei der Untersuchung des Unfallwracks findet das CSI-Team heraus, dass ein Schlauch des Lenksystems mutwillig durchtrennt wurde und der schwere Wagen dadurch nicht mehr zu steuern war. Die Ermittler nehmen nun den gehörnten Ehemann, Andrew Ballard, als Hauptverdächtigen ins Visier ihrer Ermittlungen.
Jeff Lofton - eine Putzkraft bei 'Renovation Warehouse' - stürzt während der Party von der Galerie in ein Aquarium, das mit tödlich-giftigen Würfelquallen gefüllt ist. Jeff Lofton hatte eine Lebensversicherung abgeschlossen, die erstaunlicherweise nicht an seine Hinterbliebenen, sondern an die Firma ausgezahlt wird. Horatio nimmt deshalb den Geschäftsführer - Max Desalvo - unter die Lupe, der behauptet, dies wäre eine gängige Praxis, da er schließlich in die Ausbildung seiner Mitarbeiter investiert hätte. Garrett Yates, der Leiter der Versicherungsabteilung, überbringt dem CSI sämtliche Unterlagen. Es scheint als hätte die Firma nichts zu verbergen. Die Ermittler stellen fest, dass es jedes Jahr kurz vor Abschluss des Geschäftsjahres eine rätselhafte Serie von Todesfällen in der Firma gab, bei denen jedes Mal die Versicherungssumme an 'Renovation Warehouse' ausgezahlt wurde. Das kann kein Zufall sein. Als die Ermittler Caroline Berston - der Sekretärin von Desalvo - eröffnen, dass auch auf sie eine solche Lebensversicherung läuft, gibt diese zu, kurz vor der Tat Max Desalvo mit Jeff Lofton auf der Galerie gesehen zu haben.
Horatio und sein Team müssen den Mord an einem Volkszähler aufklären. Dieser wird tot im Kofferraum eines Wagens gefunden, den Jesse und Walter angehalten haben. Am Steuer sitzt Kevin Hensler, der behauptet, von einem Fremden gezwungen worden zu sein, den Toten in den Kofferraum zu laden. Der Tote hat einige rosa Fasern eines Isolationsmaterial am Pullover. Bei der näheren Untersuchung der letzten Arbeitsstätte des Volkszählers finden die Ermittler ein leeres Haus, in dem Fetzen des Isolationsmaterials von der Decke baumeln. Bei der näheren Untersuchung des Tatortes finden sie ein Drogenlabor. Dieses ist mit einer Sprengfalle gesichert, der Natalia und Ryan nur knapp entkommen können. Merkwürdigerweise gehört dieses Haus dem Vater von Kevin Hensler und dieser hat bis vor kurzem darin gewohnt. Kevin gibt nun zu, für einen gewissen Robert 'Tek' Sperling ein Drogenlabor zu betreiben. Doch Robert scheint vom Erdboden veschluckt zu sein ...
Eine junge Frau - Summer Davenport - wird erstochen und der scheinbare Täter - Zach Finley - auf frischer Tat ertappt. Zach scheint bei ihr eingebrochen zu sein, hat sie vergewaltigt und anschließend erstochen, um die Tat zu verschleiern. Zachs einzige Chance, seine mögliche Unschuld zu beweisen, ist Adrianna Villani, eine Star-Verteidigerin, die Eric engagiert hat und sich sicher ist, die Anschuldigungen gegen Zach entkräften zu können, um sich mit dem Erfolg zu schmücken. Evan Talbot, der zuständige Staatsanwalt, sieht sich allerdings auch schon auf der Gewinnerseite, da der Fall diesmal klar scheint. Zach allerdings gibt zu Protokoll, dass er als Obdachloser in Summer Davenports Haus eingebrochen ist, weil er dachte, diese wäre zu dieser Zeit verreist. Er wollte sich nur duschen und ausschlafen. Als er am Morgen aufwachte, flüchtete er vor den Polizeisirenen, rutschte in Summer Davenports Blut aus, befleckte sich so mit ihrem Blut und flüchtete. An Summer Davenport befinden sich Sperma-Spuren, die allerdings nicht von Zach Finley stammen, da dieser eine genetische Anomalie aufweist und ihm das nötige Werkzeug für die Tat fehlt. Eric, der in diesem Fall für Adrianna Villani arbeitet und Schwierigkeiten damit hat, auf der anderen Seite zu stehen, bewirbt sich bei der Staatsanwaltschaft als Forensik-Experte.
Als die Sängerin Phoenicks während eines Konzertes in Flammen aufgeht und an den Verbrennungen stirbt, muss das CSI-Team die dunklen Seiten der sonst so glamourösen Popwelt aufdecken. Dabei erlebt CSI-Teamleiter Horatio Caine eine grosse Überraschung: Bei der Toten handelte es sich um ein Double von Phoenicks. Wem galt nun der Anschlag wirklich?
Der Lehrer Russell Turner wird von einem Motorradfahrer mit einem Samurai-Schwert in zwei Stücke gehauen. Eine erste Spur führt die Ermittler zu einem völlig verstörten Knaben, der im Besitz der Mordwaffe ist. Das Team erhält im Rahmen der Ermittlungen Einblick in die Tiefen der japanischen Mafia, und Natalia und Ryan geraten in Lebensgefahr.
James Bradstone ist zum Tode verurteilt, weil er seine Frau und seine Tochter vor 15 Jahren umgebracht haben soll. Kurz vor seiner Hinrichtung widerruft die Hauptzeugin, Louise Russo, ihre Aussage. Dabei behauptet sie, der Staatsanwalt, habe sie damals zu dieser Falschaussage überredet. Der neue Staatsanwalt will es genau wissen und gibt CSI-Teamleiter Horatio Caine den Auftrag herauszufinden, ob James Bradstone unschuldig zum Tode verurteilt ist.
Eine Auto-Entführung endet auf eine ungewöhnliche Art und Weise. Während der Entführer eines Autos die Beifahrerin mit der Pistole bedroht und davonfahren will, fällt ein Toter mit grosser Wucht direkt auf die Windschutzscheibe. Der Entführer wird dabei verletzt und kann kurze Zeit später vom CSI-Team festgenommen werden.
CSI-Ermittler Jesse Cardoza wird von seiner Vergangenheit auf gefährliche Art und Weise eingeholt: An der Party eines berühmten Pornofilmproduzenten wird Leslie Stulz, eine berühmte Pornodarstellerin ermordet. Bei den CSI-Ermittlungen zeigt sich, dass ausgerechnet Jesse Cardoza in den Mord verwickelt zu sein scheint.
Wegen eines Feueralarms muss der Beginn einer Geburtstagsparty in einer Agentur verschoben werden. Als die Party mit Verspätung doch noch beginnt, entdeckt ein Mitarbeiter im Liftschacht eine Tote. Sie wurde mit einer Axt erschlagen. Die CSI-Ermittler - unter der Leitung von Horatio Caine - sind schnell zur Stelle. Aber einen Mörder finden sie vorerst nicht.
Kyle Hamon, der Sohn von CSI-Chef-Ermittler Horatio Caine, hat ein grosses Problem: Einer seiner besten Freunde aus der Army ist spurlos verschwunden und wird als Täter in einem Mordfall verdächtigt. Kyle bittet seinen Vater Horatio um Hilfe. Ob Horatio Caine dem Freund seines Sohnes helfen kann?
Junge Leute in Miami feiern mit einer grossen Party den Frühlinganfang. Als dabei drei Morde geschehen, steht das CSI-Team unter der Leitung von Horatio Caine vor einer schwierigen Aufgabe. Denn es fehlt ein Tatmotiv.
Calleigh riskiert ihr Leben beim Versuch, einen Knaben aus einem brennenden Haus zu retten. Es gelingt ihr, im letzten Moment, den Jungen aus dem Feuer zu zerren, doch kurz darauf stirbt er, denn er lag zu lange von Flammen umgeben im brennenden Haus und atmete giftige Gase ein. Wer hat den Brand gelegt, dem der Knabe zum Opfer fiel? Die CSI-Ermittler unter Führung von Horatio Caine tappen im Dunkeln.
Zwei Männer überfallen ein Juweliergeschäft. Dabei erschiessen sie einen Kunden, bloss weil dieser einen Diamanten in der Hand hielt, den er kaufen wollte. Anschliessend fliehen die Räuber auf zwei Rennmotorrädern und bleiben spurlos verschwunden.
Eine Mutter von zwei Kindern wird äusserst brutal ermordet: Mit einem Baseballschläger hat der unbekannte Täter ihr den Kopf zertrümmert. Was könnte das Tatmotiv sein? CSI-Miami-Teamleiter Horatio Caine tappt im Dunkeln.
Kurz bevor es dem CSI-Team gelingt, das - letzte - Verbrechen mit der ermordeten Mutter Laura aufzuklären, beobachtet CSI-Agentin Calleigh, wie sich ihr CSI-Kollege Delko mit seinem Auto gestresst von dannen macht. Spontan entschliesst sich Calleigh, ihrem Kollegen Eric Delko mit dem Auto unauffällig zu folgen, und erlebt bald eine grosse Überraschung. Ist Eric Delko ein Verräter, der als Spitzel das CSI-Team unterwandert?
Das CSI-Team öffnet einen Brief, der ohne Poststempel der CSI-Zentrale zugestellt worden ist. Darin enthalten ist ein Puzzle aus Kunststofffolien. Zusammengefügt ergibt sich aus den Puzzleteilen das Bild einer Frau, die im Fadenkreuz eines Gewehrs steht. Ist das die Ankündigung zur Ermordung dieser Frau?