Staffel 2

Mit Michaels Hilfe gelingt es Nikita die Zerstörung des Freiheitsliga-Verstecks zu überleben. Seit diesem Zeitpunkt ist sie auf der Flucht vor Sektion Eins. Während sie einige Monate später in Frankreich als Bedienung arbeitet wird sie von der Freiheitsliga geschnappt und als Köder benutzt, damit diese doch noch ihre Rache an Sektion Eins bekommen. Sektion Eins führt auch tatsächlich einen Überfall durch, bei dem Nikita zum Glück entkommen und sich bei Michael für seine Lebensrettung revanchieren kann. Die beiden verstecken sich auf einem Schiffswrack und verbringen die Nacht gemeinsam. Doch Michael und Nikitas Lüge über ihren wirklichen Verbleib während der letzten sechs Monate steht in Gefahr, aufgedeckt zu werden...

Nikita wird ein neuer Trainer namens Jurgen zugeordnet, der sie nach ihrer Gefangenschaft bei der Freiheitsliega wieder auf ihre Arbeit bei Sektion Eins umschulen soll. Als Sektion Eins von Kudrin, einem Freiheitskämpfer, der Nikitas Geschichte bestätigen kann, kontaktiert wird, setztes sie alles daran, ihn in ihre Finger zu bekommen. Da Michael verhindern will, daß Kudrin die Wahrheit erzählt, versucht er ihn absichtlich während der Gefangennahme zu töten. Doch Kudrin überlebt und Madeline und Jurgen beginnen langsam, Michael und Nikitas Lüge zu durchschauen...

Birkoff entdeckt, dass eine Reihe anscheinend unzusammenhängender Anschläge von einer sechsköpfigen Söldnertruppe durchgeführt werden, die Sektion Eins auf den Namen "Helix" tauft. Jurgen hilft Nikita als Vorbereitung auf den Angriff gegen Helix wieder zu ihrer alten Form zurück, wobei Michael es jedoch gar nicht gerne sieht, wie nah sich die beiden dabei kommen. Überzeugt davon, dass Jurgen Nikita nur manipuliert, um sie letztendlich bloszustellen, stellt Michael ihn zur Rede, die schließlich mit einer Prügelei endet...

Jurgens Freiheit innerhalb von Sektion Eins fasziniert Nikita und sie verbringt trotz Michaels Mißbilligung immer mehr Zeit mit ihm. Michael warnt sie davor, dass Jurgen nicht der sei, der er vorgibt zu sein, was Nikita jedoch ignoriert. Unglücklicherweise ist Nikita unwissentlich zur Spielfigur im Machtkampf zwischen Jurgen und Sektion Eins geworden, der durchaus tödlich für ihn und auch für sie enden könnte... Die Trägerrakete eines militärischen Nachrichten-Satelliten explodiert kurz nach dem Start über der Nordsee. Michaels Team macht sich auf den Weg, doch sie finden nur noch Trümmerteile. Wer in den Besitz des Bordcomputers kommt, kann das Pentagon wochenlang lahm legen, bis ein neuer Code gefunden wurde. Die Sektion vermutet, dass sich die Organisation Der Fünfte Orden des Computers bemächtigt hat. Nikita und Jurgen kommen sich näher, wobei sich Nikita wundert, dass ihr Kollege innerhalb der Sektion so viele Freiheiten geniest. Schließlich stellt sich heraus, dass Jürgen belastendes Material über Führungskräfte der Sektion gesammelt hat. Bei dem Einsatz zur Rettung des Computers aus dem Stützpunkt des Fünften Ordens kommt es dann zu einem dramatischen Zwischenfall, den Jurgen mit seinem Leben bezahlt.

Ein Sektion Mitarbeiter dreht durch und schießt Operations während einer Besprechung nieder. Während Operations auf der Intensivstation um sein Leben kämpft, übernimmt Egran Petrosian die Leitung und befördert Nikita zu seiner Stellvertreterin. Trotz Madelines Warnung glaubt Nikita, dass Petrosian wegen seiner Aufrichtigkeit besser für die Leitung von Sektion Eins geeignet ist. Doch als Petrosian Nikita auffordert Operations zu töten, ist die Zukunft von Sektion Eins plötzlich völlig offen...

Als Michael ausgesandt wird, um einen Waffenhändler zu ermorden, sickert dieser Auftrag nach außen durch und Michael kommt in die Situation der "vorgeschriebenen Verweigerung" - eine Situation, in der er den Kontakt zur Sektion abbrechen und seine Mission unter allen Umständen beenden muss. Unglücklichrweise gelingt es dem Waffenhändler Madeline zu entführen, weshalb Operations glaubt, der einzige Weg sie zu beschützen bestände darin, Michael falls nötig zu töten. Doch Nikita hat schon einen anderen Plan...

Sektion Eins versucht ein Bombenattentat auf eine Schule zu verhindern, wobei Nikita bemerkt, dass Michael mehr über die Beschaffenheit der Bombe weiß, als er eigentlich sollte. Als Nikita ihn darauf anspricht, redet er sich heraus, was sie aber nur darin bestätigt, daß er etwas verheimlicht. Am nächsten Tag verfolgt sie ihn zu einem Treffen mit dem Bombenleger. Wie sich herausstellt, waren Michael und Rene in den 1980ern zusammen bei einer Studentenbewegung gegen Terroranschäge und sind sich später auch noch einmal begegnet. Doch als Operations Michael dazu auffordert, seinen Freund zu verraten, ist Michaels Loyalität gespalten. Rene hatte nämlich Michaels Schwester versorgt, nachdem Michael verhaftet und zum Tode verurteilt wurde (aber dann ja bei der Sektion landete...).

Nikita und Michael werden in ein Land auf dem Balkan geschickt, um Radovan Luka, einen Waffenhändler, der Rebellen versorgt, die eine Kampagne der ethnischen Säuberung durchführen, zu ermorden. Als die beiden in dem Land ankommen, treffen sie zwei heimatlose Kinder und Nikita zwingt Michael dazu, die beiden zu beschützen. Doch die Sicherheit der Kinder lenkt Nikita dabei ab, eine Schußmöglichkeit gegen Luka zu nutzen und es bleibt ihnen nichts anderes übrig, als ihr eigenes Leben aufs Spiel zu setzen, indem sie ein Gefangenenlager infilitrieren, um Luka doch noch zu erwischen... Auch Birkoff hat Probleme, denn eine seiner Computerspezialistinnen, mit der er ausgerechnet auch noch ein sexulles Verhältnis hat, klaut per Computerprogramm Geld von überwachten Konten. Trotz Bedenken meldet er dies dann an Madeline, mit der Bitte, sie aber nicht zu "streichen". Als dann alles ganz anders kommt, erfährt ein überraschter Birkoff die ganze Wahrheit...

Die Rote Zelle hat eine menschliche Zeitbombe entwickelt. Um diese menschliche Bombe und sein Opfer zu finden, muss Nikita ein Mitglied der Roten Zelle entführen, welches zur Zeit wegen Drogenbesitz im Ausland im Gefängnis sitzt. Nikita wird in das Land geschickt, um festgenommen und ins selbe Gefängnis gesteckt zu werden. Dort muss sie nicht nur das Vertrauen von Jenna, dem Roten Zellen Mitglied, erringen, sondern es auch wieder verraten, indem sie mit ihr durch Untergrundtunnel flieht, um sie direkt in die Hände von Sektion Eins zu locken...

Da es Sektion Eins gerade an Einsatzkräften mangelt wird Nikita drei Jahre vor dem geplanten Zeitpunkt zur Teamleiterin befördert. Sie ist nun für alle Aspekte der einzelnen Missionen verantwortlich: Auswahl der Teammitglieder, Planung und erfolgreiche Durchführung. Ihr erster Auftrag besteht darin, einen Händler zu fangen, der mit abgebrannten Kernelementen handelt, doch da sie vorab kaum Informationen sammeln können, erweist sich der Auftrag als ungewöhnlich gefährlich. Erschwerend kommt noch hinzu, dass ein Mitglied ihres Teams, Vincenzo, sich als ungehorsam und schwer zu bändigen erweist. Nikita muss herausfinden, wie sie ihn unter Kontrolle bringt, oder es besteht die Gefahr, dass gleich ihre erste Mission zum Mißerfolg wird. Vincenzo ist rebellisch, vorallem gegen Nikita, da sie selber auch in Michael verliebt ist. Als für die Mission dann jemand "entberliches" gesucht wird, schlägt Michael Vincenzo vor ...

Sektion Eins glaubt, dass der im Gefängnis sitzende Anführer einer terroristischen Gruppe Befehle für einen bevorstehenden Angriff durch seinen Anwalt Armel weiterleitet. Nikita und Michael geben sich als ein durchschnittliches Ehepaar aus, um Armel davon zu überzeugen, dass Nikita ein nicht mehr praktizierende Medium ist. Armel läßt sich überzeugen und entführt sie, damit sie Kontakt zu seinem Sohn aufnimmt, der bei einem Verkehrsunfall ums Leben kam. Überraschend findet Nikita heraus, dass sein Sohn durchaus noch am Leben ist und von Sektion Eins gefangengehalten wird, damit diese Informationen bekommen kann. Mit diesen Informationen ausgerüstet kann Nikita dann Armel davon überzeugen, dass sie Kontakt zu seinem verstorbenen Sohn im Jenseits hergestellt hat. Dafür muss sie aber in dessem Kinderzimmer sein, und alle elektrischen Störfelder müssen abgeschaltet werden, inclusive der Alarmanlage des Hauses. So kann dann Michael ungestört ins Gebäude gelangen, und die nötigen Daten zur Verhinderung des nächsten Anschlages aus dem Computer laden. Madeline hat ein persönliches Anliegen an Operations, sie würde gerne ihr todkranke Mutter nochmal sehen. Nach anfänglicher Ansage gestattet er es ihr doch. Außerdem erwähnt Operations eine Besprechung mit "Sektion 4" ...

Nikita freundet sich mit Terry an, einer langgjährigen Mitarbeiterin der Sektion, die während ihrer letzten Mission einen Fehler machte. Sie gesteht Nikita, dass dies dadurch zustande kam, da sie schwanger ist. Doch als Terry, Michael und Nikita gemeinsam den abtrünnigen NSA Agenten Sullivan fangen sollen, verrät sie die Mission, um Sektion entkommen und ihr Kind außerhalb bekommen zu können. Jetzt steht Nikita vor der Wahl, Terry und ihr Baby zu beschützen, oder im Sinne von Sektion Eins zu handeln...

Bei einem Clubbesuch wird Michael angegriffen, entführt und vom Verhörspezialisten der Roten Zelle, Orlando Perez, verhört. Nikita bekommt den Auftrag, ihn zu befreien und Perez selbst zu entführen. Doch als sie Michael erreicht, kann er sich nicht mehr daran erinnern, wer er ist, oder was er mit Sektion Eins zu tun hat. Nikita nimmt ihn in ihre Obhut, da sie weiß, dass er beseitigt werden würde, falls Operations davon erfährt. Nikitas Aufgabe wird auch noch dadurch erschwert, dass Michael ihr im Gegensatz zu seinem sonstigen Verhalten seine wahren Gefühle gesteht...

Letztes Jahr gelang es Michael und Nikita den Attentäter David Fanning mit der unfreiwilligen Hilfe seiner Ehefrau Lisa zu schnappen, indem Micheal mit ihr ein Verhältnis einging. Nun benutzt Sektion Eins Fanning dazu, einen noch mächtigeren Terroristen zu beseitigen und eine rumänische Sondereinheit auszuhebeln. Michael und Nikita müssen gezwungenermaßen mit Fanning zusammenarbeiten. Die Mission wird zur Nebensache, als Fanning Nikita zur Geisel nimmt und von Michael verlangt, dass er ihm Lisa zurückbringt. Nun muss Michael innerhalb von 48 Stunden die Frau finden, der er für Sektion Eins benutzt und betrogen hat, oder Nikita wird sterben...

Birkoff entdeckt, dass eine Terroristengruppe einen Code benutzt, um sich in einen Satelliten des Verteidigungsministerium einzuschalten, den sie zur Durchführung eines anscheinend unzusammenhängenden Anschlages benutzen wollen. Der Code muss entschlüsselt werden, um weitere Angriffe verhindern zu können, doch der NSA und sogar Birkoff gelingt es nicht. Sektion Eins entführt daraufhin einen brillianten, aber eingebildeten jungendlichen Mathematiker, der das Problem lösen soll, doch seine unkontrollierbaren Charaktereigenschaften gefährden die Mission, Sektion Eins und schließlich sein eigenes Leben...

Sektion Eins muss einer Terrorgruppe aus dem Mittleren Osten, Bright Star, daran hindern, weitere Kamikazeanschläge durchzuführen. Da die Bomben aus Landminen zusammengesetzt werden, ist es schwer das Versteck der Gruppe aufzuspüren. Nikita bekommt den Auftrag Informationen aus Formitz, der für die gefälschten Dokumente der Gruppe zuständig ist, herauszulocken. Doch als sie erfährt, dass Formitz ein Serienkiller ist, der sich auf die brutale Ermordung Prostituierter spezialisiert hat, könnte ihr Wunsch, ihn ins Gefängnis zu bringen, das Leben vieler gefährden...

Sektion Eins entsendet ein Team, um ein mögliches Munitionsversteck der Roten Zelle in Schottland zu neutralisieren, doch als dieses dort ankommt, ist der Ort schon ausgeräumt. Michael und Nikita überwachen das Versteck, während Mowen, ein Sektion Eins Mitarbeiter, mit einer Probe zur Zentrale zurückkehrt. Wenig später erkrankt Mowen an einer mysteriösen Krankheit. Operations erkennt, dass die ganze Aktion eine Falle war, um einen tödlichen Virus freizusetzen, der sich schnell innerhalb der Sektion verbreitet. Nun müssen sich Michael und Nikita entscheiden, ob sie sich auf die Suche nach einem Gegenmittel machen um Sektion Eins zu retten, oder ob sie die Chance auf Freiheit nutzen sollen...

Die junge, arrogante Missionsplanerin Andrea wird zu Sektion Eins versetzt. Nach einem von ihr entworfenen Einsatzplan, der Schief ging, soll sie mit auf die nächste Mission, was Michael gar nicht passt. Aber sie auch diese Aufgabe perfekt. Michael macht sich schließlich erfolgreich an sie ran, und schläft mit ihr. Doch als Andrea schließlich erfährt, dass Michaels Annäherungsversuche nur dazu dienen sollten, um sie für Sektion Eins zu überprüfen, schwört sie sich zu rächen. Da Nikita sich weigert ihr zu helfen, gerät sowohl sie als auch Michael bei der nächsten Mission in einem tödlichen Labor in Gefahr. Sie sollen das Labor sprengen, in dem Designer-Viren entworfen werden, die nur bestimmte Volksgruppen infizieren. Andrea aktiviert eine Sicherheitstür, nachdem Michael im Labor ist, und schließt ihn dadurch ein - nur dank Nikitas Befreiung kann er vor der Explosion entkommen... Aber auch Operations hat Probleme, denn es steht eine taktische Überprüfung ins Haus, und Ops bittet Walter zu lügen, aber dieser ist noch immer wegen der Todesmission seiner Ehefrau Belinda sauer !

Als Sektion Eins in verschiedensten Gebieten der Erde die Sicherheitsvorkehrungen zurückfährt, führt kurz darauf eine Terrororganisation einen erfolgreichen Anschlag in einem der Gebiete durch. Aus Sorge, dass der Anschlag von einem Insider geplant wurde, befiehlt Operations einen Überfall an, bei dem der Anführer BRUTUS festgenommen werden soll. Dabei finden sie heraus, dass "er" nichts anderes als ein Computer ist. Da man mit ihm kommunizieren kann, wird er von Madeline verhört, die jedoch glaubt, dass er nur pure Logik versteht und nicht intuitiv handeln kann. Doch als Madeline und Operations Sektion Eins gemeinsam verlassen, um ihre Beziehung wieder aufflammen zu lassen, hat der Computer andere Pläne und Michael muss Sektion Eins während ihrer Abwesenheit leiten. Nikita hat ganz andere Probleme, denn sie wird von einem Albanischen Dieb festgehalten, da er sie für eine Polizistin hält, und als dann auch noch Michael anruft und sie "Josephine" nennt, soll sie getötet werden.

Als Sektion Eins erfährt, dass ein reicher Terrorist geplante Angriffe auf Zivilisten finanzieren will, geben sich Michael und Nikita als Geldwäscher aus, um ihn aufzuhalten. Doch sein Assistent Giraldi behauptet, ein Sektion Mitarbeiter zu sein, der seit neun Jahren im Außeneinsatz arbeitet und nun wieder zurückgebracht werden will. Als Nikita Operations darüber informiert, befiehlt er ihr den Wunsch zu ignorieren, doch als Madeline davon erfährt, verlangt sie von Nikita, ihn zurückzubringen. Nun steckt Nikita in der Klemme und das Leben eines Mannes ist in der Schwebe. Wie sie erfährt, ist Giraldi niemand geringer als Madelines tod geglaubter Ehemann ! Doch Operations wusste die ganzen Jahre, das er noch lebt, und verscheierte es. Auf Nikita wartet noch eine Überraschung : Ihr Freundin und ehemalige Nachbarin Carla taucht wieder auf, aber sie ist nicht die, für die Nikita sie immer hielt... ..

Nikitas Welt wurde auf den Kopf gestellt. Ihre Nachbarin Carla arbeitet für Adrian, der im Exil lebenden Grüderin von Sektion Eins. Carlas "Freund" ist der Mann, der sie das ganze Jahr beobachtet hat. Die beiden kidnappen Nikita und bringen sie zu Adrian, die sie davor warnt, dass Operations die Sektion nur dazu benutzt, um politische Macht zu erlangen und die Regierungen der Erde unter seine persönliche Kontrolle zu bringen. Adrian glaubt Sektion Eins nicht ohne Nikitas Mithilfe zerstören zu können, doch Nikita bleibt skeptisch. Doch als Nikita wenig später erkennt, dass eine Mission, bei der ein Regierungschef beschützt werden soll, nur davon ablenken soll, dass Operations sie, genau wie Adrian vorhergesagt hat, ermorden lassen will, beschließt Nikita sich gegen Sektion Eins zu stellen...

Mit Adrians Hilfe gelingt es Nikita in die sensibelste Abteilung von Sektion Eins einzudringen, um eine Datei mit Codename "Gemstone" zu kopieren. Diese enthält Beweise mit denen Operations gestürzt und Sektion Eins zerstört werden kann. Doch während einer allgemeinen Befragung zwingt Operations Michael dazu, den Mitarbeiter preiszugeben, der am wahrscheinlichsten mit Adrian zusammenarbeiten würde - Nikita. Später stellt Michael sie zur Rede um einen Weg sie zu beschützen zu finden, doch sie streitet alles ab. Nun muss Michael sie und Adrian kidnappen und zur Sektion zurückbringen, wobei er weiß, dass die beiden daraufhin ausgeschaltet werden sollen, und die belastende Gemstone-Datei wird unwiederbringbar gelöscht...