Ein junger Mann namens Jake Green kehrt nach mehreren Jahren in seine Heimatstadt Jericho zurück, da sein Großvater gestorben ist. Dort wird er von seiner Mutter überglücklich empfangen, sein Vater, der gleichzeitig Bürgermeister der Kleinstadt ist, zweifelt jedoch immer noch an Jakes Fähigkeiten. Deshalb will Jake das Städtchen auch so bald wie möglich wieder verlassen. Auf der Rückreise aber geschieht Unfassbares: Im nahegelegenen Denver detoniert eine Atombombe und Jericho ist vorerst ohne Verbindung zur Außenwelt. Jake wird in einem Unfall verwickelt, bei dem er aber leicht verletzt überlebt. Er findet einen alten Schulbus, in dem etliche Kinder mit ihrer Lehrerin, Heather Lisinski, auf einem Ausflug unterwegs waren. Eines der Kinder hat sich so schwer verletzt, dass es droht zu sterben… Derweil droht die Stadt im Chaos zu versinken, da niemand Bescheid weiß, was wirklich passiert ist. Bürgermeister Johnston Green und sein Sohn Eric versuchen die Lage zu beruhigen. Johnstons Konkurrent Michael Gaston ist dabei nicht wirklich hilfreich…
Die Stadt ist immer noch in Aufruhr, da noch niemand weiß, was genau vor sich geht und wer oder was hinter der Atomexplosion steckt. Da ein Gewitter von Denver in Richtung Jericho zieht und somit mit radioaktivem Regen gerechnet werde muss, versuchen Bürgermeister Green und seine Söhne Jake und Eric, die Menschen in Sicherheit zu bringen. Leider hat der Luftschutzbunker im Rathaus nicht genügend Platz für alle, so dass der Rest in einer alten Mine untergebracht werden soll. Diese aber muss dann mit Dynamit von außen verschlossen werden… Währenddessen befindet sich Emily Sullivan immer noch irgendwo vor den Toren Jerichos. Leider ist ihr das Benzin ausgegangen, so dass sie versucht, ein Polizeiauto anzuhalten, in der Hoffnung, dass ihr geholfen wird. Doch als sie bemerkt, dass die vermeintlichen Polizisten gar keine sind, ist es schon zu spät… Dale Turner hört eine Nachricht von seiner Mutter auf dem Anrufbeantworter. Sie befindet sich in Atlanta und der Nachricht zu urteilen, ist dort auch eine Atombombe detoniert.
Der Regen prasselt über Jericho nieder, doch Gott sei Dank konnten sich alle in Sicherheit bringen – bis auf Stanlay Richmond, dem Bruder der gehörlosen Shoshanna und langjähriger Freund von Jake. Ungefähr 20 Minuten war er dem Regen ausgesetzt bevor er Zuflucht im Bunker seiner Ranch bei Emily, Jake, Bonnie und zwei Polizisten findet. Dort angekommen, berichtet er, dass er einige Panzer gesehen hat. In der alten Mine, in der sich hunderte Bürger Jerichos befinden, bricht so langsam aber sicher Unruhe aus, da die Mine von außen verschlossen wurde. Der klaustrophobische Reinys dreht durch und wird von einigen Männern in einen anderen Raum gebracht. Dort stirbt er an einem Herzinfarkt. Doch war es wirklich ein natürlicher Tod? Jake will die nähere Umgebung Jerichos erkunden, wobei ihm drei andere Männer helfen wollen. Jake findet einige abgestürzte Flugzeuge und kann so eine Black Box sicherstellen, von der er sich erhofft, näheres über die Katastrophe zu erfahren. Robert Hawkins scheint mehr über die Explosionen zu wissen als alle anderen. Hat er womöglich sogar etwas mit den Anschlägen zu tun?
Jake und Heather finden in der Apotheke einen Strahlenkranken, der kaum noch am Leben ist und bringen ihn ins Krankenhaus. Nun rätselt man, wer der Mann ist und wieso er nach Jericho gekommen ist. Außerdem muss Jake auch noch Benzin auftreiben, da die Generatoren des Krankenhauses drohen auszugehen, was extreme Folgen für die Patienten hätte. Mit Hilfe von Heather und Stanley will Jake deshalb die Reserven einer Tankstelle abpumpen… Der Strahlenkranke berichtet etwas von 20 Menschen, die von Denver her unterwegs sind, um in Jericho Zuflucht zu suchen. Doch als Jake und die Anderen die Flüchtlinge finden, ist es bereits zu spät. Der dunkelhäutige Robert Hawkins benimmt sich weiterhin sehr merkwürdig. Sogar seine Familie muss darunter leiden. Augenscheinlich haben sie eine andere Identität angenommen, was allerdings niemand erfahren soll…
Die Kinder aus Jericho kehren wieder an ihre Schulen zurück. Dort gibt es einen Unfall bei dem Emily verletzt wird und die Schule in Flammen aufgeht. Jakes Mutter möchte, dass dieser endlich seinem Vater die Wahrheit erzählt. Es gibt wieder Strom in Jericho. Kurz darauf bekommen die Einwohner einen Anruf von "Homeland Security".
Die EMP-Bomben, die über Jericho detonierten, sorgen dafür, dass das gesamte Stromnetz der Kleinstadt ausfällt. Die Bevölkerung wird immer ungeduldiger und Tumulte breiten sich aus. Jake trifft einen alten Bekannten, Mitch, mit dem er vor einigen Jahren in eine gefährliche Situation geraten ist, bei der Mitch anschließend im Gefängnis landete. Er ist deshalb sauer auf Jake und schwört Rache. Das Stehlen von mehreren Pferden der Familie Green, was eine Verletzung Gails mit sich zieht, ist dabei nur der Anfang. Derweil hat Stanley mit einer Ungezieferplage zu kämpfen, die seine gesamte Maisernte bedrohen. Das hätte für die gesamte Bevölkerung fatale Folgen. Stanley will die Plage deshalb mit Pestiziden bekämpfen, allerdings will Gracie die nicht so einfach hergeben.
Sichtlich angeschlagen kehrt Gray Anderson von seiner Erkundungstour zurück. Dabei hat er schreckliches zu berichten: Washington D.C. existiert nicht mehr… Der Kriminelle Jonah Prowse will die Kaution für den Gefangenen Mitchell bezahlen. Jake will sich auf einen Deal mit ihm einlassen: Im Tausch gegen die gestohlenen Lebensmittel soll Mitchell freigelassen werden. Dann allerdings müssen Prowse und seine Männer Jericho für immer den Rücken zukehren. Gray Anderson und Jakes Bruder Eric sprechen sich allerdings gegen den Deal aus. Die Situation scheint aus den Fugen zu geraten… Der Bürgermeister Johnston Green plagt sich immer noch mit seiner Krankheit herum. Als er nur sehr knapp dem Tode entgehen kann, müssen Jake und Eric handeln, denn ihr Vater braucht ein wichtiges Medikament, sonst wird er innerhalb von 24 Stunden sterben…
Der Zustand von Bürgermeister Johnston Green verschlechtert sich rapide, doch seine Söhne Jake und Eric sind schon auf dem Weg nach Rogue River, um dort Medikamente zu besorgen. Dort angekommen finden sie eine menschenleere Stadt vor und die Patienten im Krankenhaus sind alle umgebracht worden. Als dann auch noch auf die beiden geschossen wird, müssen sie versuchen, sich selbst zu verteidigen und an die Medikamente zu gelangen… Derweil versucht Erics Ehefrau April, das Leben von Johnston zu retten. Als die Lage immer bedrohlicher wird, erinnert sich Heather an eine Möglichkeit, Eis aus Wasser und Dünger herzustellen um so das Fieber von Johnston etwas zu senken… Gray Anderson und Jimmy Tailor begeben sich zum Haus von Robert Hawkins, um diesem und seiner Familie nach deren Vergangenheit auszufragen und sich im Haus umzusehen. Als Jimmy das Haus nach verdächtigen Gegenständen durchsucht, macht er eine interessante Entdeckung…
Da Eric seinen Geldbeutel in Rogue River verloren hat, sind die skruppelosen Ravenwoods auf dem Weg nach Jericho. Die Stadt bereitet sich auf einen Angriff vor und Gray Anderson und Jake wollen die Brücke sprengen, damit die Söldner nicht in die Stadt kommen. Bürgermeister Johnston und sein Sohn Eric wollen das aber verhindern. Eric verlässt die Stadt über die Brücke und so steht Jake vor einer Entscheidung: Sprengt er die Brücke, ist sein Bruder möglicherweise für immer verloren, tut er es aber nicht, drohen die Ravenwoods, die immer näher kommen… Emily hat ständig Träume über ihren Verlobten Roger. Am Tag, als die Hochzeit eigentlich stattfinden sollte, ist sie aufgrund dessen deprimiert. Deshalb versucht Heather sie aufzumuntern und beschäftigt sie den ganzen Tag über… Als April ihrem Mann Eric mitteilen will, dass sie ein Kind von ihm erwartet, trennt er sich von ihr, bevor er von der Neuigkeit überhaupt erfahren hat. Seine Mutter Gail Green ist deshalb sauer auf ihn…
Unbekannte Flugzeuge werfen Hilfsgüter über der Stadt ab. Als sich herausstellt, dass es sich um Lebensmittel und Medikamente aus China handelt, will Bürgermeister Green zuerst testen, ob die Waren vergiftet sind oder nicht. Sein Wiedersacher Gray Anderson sieht seine Chance, den Bürgermeister zu diffamieren und verlangt die sofortige Herausgabe der Waren… Emilys Vater Jonah taucht auf der Richmond-Ranch auf und klaut zwei der Hilfscontainer, darunter ein Stromgenerator, den die Stadt sehr gut gebrauchen könnte. Als Jake und die anderen sich die Container wieder beschaffen wollen, versucht Emily sie daran zu hindern… Eric erfährt von seinem Vater, dass er bald selbst ein Kind bekommen wird. Johnston legt ihm Nahe, die Trennung von April aufgrund des Kindes noch einmal zu bedenken, doch Eric ist sich seiner Sache sicher und will endgültig einen Schlussstrich ziehen…
In Jericho steht die Bürgermeisterwahl an und Gray Anderson versucht, die Leute auf seine Seite zu ziehen. Deshalb fordert er dazu auf, den Mörder von Gracie zu finden. Schnell ist Jonah als Täter ausgemacht und die Jagd auf ihn beginnt. Doch hat er sie wirklich getötet? Jonah kann schwerverletzt zu seiner Tochter Emily flüchten, die ihn bei sich aufnimmt. Mit ihr und Jakes Hilfe will er beweisen, dass er unschuldig ist... Derweil erbt der junge Dale das Geschäft von Gracie. Als Mitch in den Laden kommt und Schutzgeld von ihm fordert, sieht Dale in ihm den wahren Mörder von Gracie… Als Jake und Emily sich näher kommen, treffen in Jericho einige Flüchtlinge ein, die die Hilfe der Bewohner benötigen. Einer von ihnen ist Emilys Verlobter…
Die letzten 36 Stunden, bevor die Atombomben in die Luft gehen… Der mysteriöse Robert Hawkins bereitet sich auf seine Reise nach Jericho vor. Er zwingt seine Frau Darcy und ihre Kinder dazu, mit ihm mitzukommen. In Jericho angekommen bereitet er alles für die anstehenden Detonationen vor… Jake kehrt vom Krieg zurück und soll nach dem Willen eines Freundes gleich wieder eingezogen werden. Doch Jake will Abstand gewinnen und die schrecklichen Erfahrungen des Krieges so schnell wie möglich vergessen… Zurück in der Gegenwart: Unter den Flüchtlingen befindet sich neben Emilys Verlobten Roger auch eine Frau namens Sarah. Diese hat, wie sich in den Rückblicken herausstellt, eine Beziehung mit Robert Hawkins gehabt…
Die Stadt macht sich bereit für den nahenden kalten Winter. Doch leider gehen die Treibstoffvorräte zu Neige. Heather schlägt vor, Windräder zu bauen, um damit Strom zu erzeugen. Da dafür noch einige wichtige Bauteile gebraucht werden, machen sich Johnston, Dale, Heather und Jake auf den Weg nach Black Jack, um dort ein Teil gegen eine Ladung Salz einzutauschen… Derweil spricht sich Gail mit der Freundin ihres Sohnes, Mary Bailey aus. Zwar macht Gail der jungen Frau klar, dass sie ihr nie verzeihen wird, doch Mary findet schließlich einen handgeschriebenen Zettel von Gail… Robert Hawkins nimmt Sarah bei sich auf und bespricht mit ihr, wie sie weiter vorgehen sollen. Dabei wird klar, dass in der Vergangenheit nicht alles nach Plan lief…
Der Winter hat die Stadt erreicht und die Menschen kämpfen gegen die Kälte. Desweiteren werden auch die Lebensmittelvorräte immer knapper. Die Männer versuchen zwar zu jagen, doch leider ist weit und breit kein Wild zu sehen. Deshalb machen sich Stanley, Mimi und Jake auf den Weg zu einem weit entfernten Jagdgebiet. Dabei werden sie allerdings von einem Geländewagen von der Straße abgetrieben… Robert und Sarah wollen den „alten Mann“ ausfindig machen, der Robert und seine Familie beschattet und ihn eliminieren. Als sie dort ankommen, wird Robert klar, dass er und seine Familie nicht sicher sind und beschließt, mit ihr zu fliehen… Emily und ihr Verlobter Roger kümmern sich währenddessen um die Flüchtlinge und versorgen sie mit Kleidung. Dabei merkt Emily, wie sehr sie ihn vermisst hat…
Plötzlich tauchen die Marines mit einem Panzer in Jericho auf. Sie erzählen, dass der Krieg gewonnen sei und der Regierungssitz nun in Columbus, Ohio liege. Gray Anderson will sich mit den Soldaten gutstellen, damit Jericho eine höhere Priorität, was die Versorgung angeht, bekommt...
Gray Anderson und Johnston Green kaufen für Jericho eine Windmühle. Um mehr Strom erzeugen zu können, wollen sie weitere Mühlen aufstellen. Doch die Verkäufer stellen hohe Forderungen. Die schwangere April wird bewusstlos ins Krankenhaus eingeliefert...
Als die Vorräte in Jericho knapp werden und gerade noch für die Einwohner der Stadt reichen, eröffnet Gray Anderson den "Gästen", dass diese nicht weiter versorgt werden können. Die Situation eskaliert. Hawkins gibt sich als Sarah aus, um die Käufer zu treffen...
Jimmy alarmiert Jake, weil er das Gefühl hat, dass mit Hawkins etwas nicht stimmt. Zusammen durchstöbern die beiden Hawkins' Haus und finden verdächtige Dinge wie verschiedene Regierungs-Ausweise. Jake konfrontiert Hawkins...
Die Männer sind mit den Windmühlen zurückgekehrt, allerdings ist Eric nicht mit dabei. Jake macht sich Sorgen und bittet Roger, ihn nach New Bern zu begleiten. Dort kommen sie zwar bis zum Bürgermeister, doch der hat offensichtlich was zu verbergen...
Beim Salzbergwerk kommt es zu einer Schiesserei mit einigen Verletzten. Jake und Eric sind in New Bern im Gefängnis. Johnston Green macht sich dorthin auf, um seine Jungs nach Hause zu holen, doch beim Bürgermeister stösst er nicht gerade auf Kooperation...
Nach Johnston Greens Befreiungsaktion fordert der Bürgermeister von New Bern von Gray Anderson den Großteil des Grundbesitzes von Jericho - oder er greift die Stadt an. Als Gray nicht schnell genug auf seine Forderungen eingeht, kommt es in Jericho zu einer Reihe von Explosionen...
Jericho bereitet sich auf einen Angriff aus New Bern. Dank des Panzers können sie Constantinos Männer zunächst in die Flucht schlagen. Allerdings wird Johnston schwer verletzt. Heather wacht in einem Militärlager in Nebraska auf...