Staffel 2

Die Crew findet ein altes Artefakt von der Erde im All. Die Spur führt zu einem Planeten. Nach atmosphärischen Störungen ist die Voyager dazu gezwungen, auf dem Planeten zu landen. Captain Janeway führt ein Außenteam an, um die Quelle des SOS-Signals zu finden. Sie entdecken ein altes Flugzeug der Erde und eine massive Kammer, die 8 eingefrorene Terraner beherbergt.

Chakotay wird in einem Shuttle von einem jungen Kazon namens Kar angegriffen, kann sich aber erfolgreich zur Wehr setzen und den Jungen an Bord beamen, bevor dessen Shuttle explodiert. Anstatt dankbar zu sein, ist Kar jedoch außer sich, da Chakotay es ihm durch seine Hilfsaktion unmöglich gemacht hat, sich um einen Kriegernamen verdient zu machen. Als sein Shuttle vom Traktorstrahl eines Kazon-Schiffes erfasst wird, scheint nicht nur Kars Leben dem Ende entgegen zu gehen...

Böse Überraschung für den Doktor: Durch einen roten Alarm aktiviert, findet er die Voyager verlassen vor. Lediglich B Elanna und Captain Janeway blieben nach einem Angriff der Kazon verletzt zurück. Da taucht plötzlich Lieutenant Barclay auf der Krankenstation auf und behauptet Unglaubliches: Angeblich sei das bisherige Leben des Doktors nur eine Simulation auf dem Holodeck gewesen.

Die Besatzung der Voyager untersucht einen sonderbaren Schwarm mysteriöser Lebensformen. Plötzlich wird das Schiff in den Schwarm gezogen, der ihm sämtliche Energie entzieht. Unterdessen tritt Kes völlig unerwartet in die Phase des Elogiums ein. Dies ist die einzige Zeit in der Angehörige ihrer Spezies Kinder bekommen können. Doch für Kes kommt dieser Zeitpunkt viel zu früh.

Harry Kim findet sich plötzlich auf der Erde wieder und stellt fest, dass er eine Karriere bei Starfleet begonnen hat, aber offenbar nicht auf die Voyager versetzt wurde. Da er weiß, dass etwas nicht stimmt, begibt er sich auf die suche nach Tom Paris, der ebenfalls nicht auf die Voyager gekommen ist. Da der Verbindungen zum Maquis hatte, macht sich Kim zusätzlich zu seinem merkwürdigen verhalten noch verdächtiger, so dass ihm Starfleet schon bald auf den Fersen ist, während Kim versucht, wieder in den richtigen Zeitverlauf zurückzugelangen...

Eine Verzerrung unbekannter Herkunft beginnt, die Struktur der Voyager völlig umzubauen. Die Crew unternimmt alles um auf die Brücke zu kommen um etwas gegen diese Verzerrung zu unternehmen, landet aber immer wieder auf dem Holodeck. Nachdem sämtliche Versuche fehlgeschlagen sind, bleibt der Crew nichts anderes übrig, als abzuwarten und zuzusehen was geschieht....

Paris und Neelix wollen auf einem Planeten mit Hautreizendem Gasgemisch nach Lebensmitteln zu suchen, sind aber gezwungen, sich in eine Höhle zurückzuziehen, nachdem ihr Shuttle abgestürzt ist. Nachdem sie die Höhle versiegelt haben, um nicht der Atmosphäre ausgesetzt zu sein, bemerken sie, dass in einem Nest im Inneren der Höhle ein flugsaurierähnliches Lebewesen geschlüpft ist. Die bis zu diesem Zeitpunkt zerstrittenen Paris und Neelix müssen nun zusammenarbeiten, um das Jungtier am Leben zu erhalten...

Kurz vor dem ersten zusammentreffen mit den Bothanern gerät die Crew der Voyager in den Bann von Halluzinationen. So werden Figuren aus Janeways Holoprogramm plötzlich lebendig. Tom Paris sieht seinen Vater, der sich in seiner üblichen geringschätzigen Weise über ihn äußert. Sobald sich ein Betroffener auf die Halluzination einlässt, verliert er die Kontrolle über seine Handlungen. nur Kes und der Doktor können noch etwas unternehmen, um die Voyager zu retten ....

Auf einem Mond stößt Chakotay auf ein Volk, das indianischem Ursprungs zu seien scheint. Er fühlt sich an seine Jugendzeit erinnert, als sein Vater mit ihm in den Urwald ging, um ein Naturvolk aufzusuchen. Chakotay erkennt die Parallelen zwischen der damaligen Erfahrung und der augenblicklichen Situation und es gelingt ihm, mit den Bewohnern dieses Mondes in Kontakt zu treten und sie von den friedlichen absichten der Voyager zu überzeugen...

Die Voyager folgte einer Spur, die Gefährtin des Fürsorgers zu führen scheint und stößt dabei auf eine Gruppe Ocampa, die weitaus älter sind als alle bekannten Ocampa. Einer aus der Gruppe, Tanis, versucht, Kes davon zu überzeugen, sich ihnen anzuschließen, während Suspiria - die Fürsorgerin - die Voyager vernichten will, da sie ihr die Schuld am Tod ihres Gefährten gibt...

Nachdem die Kazon von der Voyager ein Modul des Transporters gestohlen haben stellt sich heraus, dass die Verräterin Seska dahinter steckt. Der in seiner Ehre gekränkte Chakotay macht sich daraufhin ohne Wissen des Captains auf den Weg, um das Modul zurück zu hohlen. Seine Bemühungen werden aber schnell zunichte gemacht, da die Kazon ihn gefangen nehmen. Für Janeway stellt sich nun Problem, dass sie nicht nur das Modul zurückholen sondern auch Chakotay befreien muss...

Nachdem Tuvok und B'Elanna von den Morka gefangen genommen worden sind, muss Janeway Undercover versuchen, ihren Standort ausfindig zu machen. Einen untypischen Verbündeten findet sie in einem alten Mann namens Caylem, der Janeway für seine verlorene Tochter hält. Obwohl er auf den ersten Blick eher ein Klotz am Bein zu sein scheint, erweist er sich für den Captain als unschätzbare Hilfe...

Die Voyager Crew beamt einen im All treibenden, humanoid aussehenden Roboter aufs Schiff. Nachdem B'Elanna ihn repariert hat, aktiviert er sich und erklärt, er sei die Einheit 3947 und Vertreter einer vom Aussterben bedrohten Art. B'Elanna soll einen Prototypen bauen, der zur Produktion einer neuen Einheit führen kann. Sie verweist auf die Oberste Direktive und erklärt, dass sie seinem Wunsch nicht nachkommen kann. Daraufhin wird sie von Einheit 3947 entführt und erfährt, dass die Roboter ursprünglich als Waffe gedacht waren, die ihren eigenen Erbauer ausgelöscht haben...

Janeway beschließt, den ständigen Angriffen der Kazon ein Ende zu setzen und stattdessen eine Allianz unter ihnen und mit der Voyager einzugehen. Sie nimmt mit dem Führer der Trabe Kontakt auf, jener Spezies, die viele Jahre lang die Kazon unterdrückt haben. Der ist vom Gedanken einer Allianz angetan und vereinbart ein Treffen, das er aber in Wahrheit nur benutzt, um die Kazon-Führer an einen Tisch zu bekommen, damit er sie vernichten kann...

Lt. Paris schreibt Raumfahrtgeschichte, als es ihm als ersten gelingt, die bis dahin für unmöglich gehaltene Geschwindigkeit von Warp 10 zu erreichen. Alles spricht dafür, dass die Voyager auf diese Weise in kürzester Zeit in den Alpha-Quadranten zurückkehren kann, als sich plötzlich bei Paris eine Veränderung bemerkbar macht. Auf unerklärliche Weise entwickelt er sich binnen kürzester Zeit zu einer Art Amphibienwesen, ein Schicksal das der gesamten Crew drohen könnte, wenn die Voyager auf Warp 10 geht...

Tuvok untersucht einen Mord an einem Crewmitglied der Voyager und macht als Täter den Betazoiden Ensign Suder aus. Während Suder "einfach so" getötet hat, kann und will Tuvok das nicht akzeptieren. Er ist beharrlich auf der Suche nach einem Motiv und beschließt, mit Suder eine Gedankenverschmelzung einzugehen. Dabei springt aber der Funke des Unberechenbaren von Suder auf Tuvok über und der Vulkanier beginnt sich zunehmend aggressiv zu verhalten...

Die Voyager stößt auf einen cardassianischen Marschflugkörper, der seiner Zeit vom Marquis abgefangen und von B'Elanna umprogrammiert wurde, um gegen die Cardassianer eingesetzt zu werden. Der Marschflugkörper - Dreadnought - ist vom Fürsorger in den Delta-Quadranten gerissen worden und bedroht nun einen stark bevölkerten Planeten. B'Elanna ist die einzige, die eine Chance hat, die von ihr selbst mit allen erdenklichen Sicherheitsbarrieren ausgerüstete Dreadnought zu deaktivieren, während die Zeit immer knapper wird...

Die Voyager befreit einen Q aus einem Gefängnis der sich umbringen wollte, da ihn die Existenz als allmächtiges Wesen langweilt. Q folgt ihm auf die Voyager und warnt Janeway, dass sie das Q-Kontinuum ins Chaos stürzen wird, wenn sie dem anderen Q erlaubt sich das leben zu nehmen! Sie verfügt eine Anhörung, in der sich alle Beteiligten ihre Ansichten vortragen können, um dann zu entscheiden, ob der zweite Q mit Q ins Kontinuum zurückkehren muss oder nicht...

Die Voyager beamt eine todkranke Vidiianerin an Bord, Dr. Danara Pel. Der Doktor versucht ihr Leben zu retten , obwohl die Phage bereits sehr weit fortgeschritten ist. Während er ihren Körper in Stasis versetzt, lässt er vom Bordcomputer ein holograhisches Abbild der gesunden Dr. Pel erschaffen, um so deutlicher wird ihm, dass seine Programmierung einen unerwarteten Weg eingeschlagen hat und er sich so in sie verlieben konnte...

Tom Paris verlässt überraschend die Voyager, um sich einem talaxianischen Konvoi anzuschließen, da er mit seinem Posten an Bord des Föderationsschiffs unzufrieden ist. Während die Kazon kurz darauf Paris in ihre Gewalt bekommen, begibt sich Neelix auf die Suche nach einem Verräter an Bord der Voyager. Er kommt ihm auf die Spur und gerät dabei selbst in Lebensgefahr...

Als die Voyager sich vor den Vidiianern in eine Plasmawolke zurückzieht, kommt es zu einer Verdopplung des Schiffs, die eine der beiden Voyager-Versionen zu zerstören droht. Während die Vidiianer eins der beiden Schiffe stürmen und die Crew dezimieren, um sich deren Organe anzueignen, tritt Janeway ihrem Ebenbild gegenüber, um sich darüber zu beraten, welches der beiden Schiffe geopfert werden soll, um die Crew zu retten und die Vidiianer zu schlagen...

Tuvok stürzt mit einem Shuttle auf einen Planeten ab, der von den Drayanern als heilig bezeichnet wird. Dort trifft er auf eine Gruppe Kinder, die ihn um Hilfe bitten, da sie ausgesetzt worden sind, um von einem Monster getötet zu werden. Tuvok versucht ihnen zu helfen, doch ein Kind nach dem anderen verschwindet spurlos. Er ahnt nicht, dass es sich bei den Kindern eigentlich um alte Drayaner handelt, die lediglich rückwärts altern und auf den Planeten kommen, weil für sie die Zeit zum sterben gekommen ist...

Die Voyager stößt auf Überlebende der Kohl-Siedlung, die in einer Simulation gefangen sind. Als sich B'Elanna und Kim in diese Simulation begeben, treffen sie auf einen Clown, der tatsächlich die personifizierte Angst der in der Simulation Befindlichen ist. Wenn sie nicht machen, was er will, erschreckt er sie zu Tode, was dazu führt, dass der Betroffene stirbt. Mit einigen Mühen kann Janeway den Clown dazu bewegen, sie gegen ihre Besatzungsmitglieder auszutauschen, immerhin ist sie für ihn eine viel interessantere Gegnerin...

Nach einem Transporterunfall materialisieren Neelix und Tuvok als eine Person auf der Transporterplattform der Voyager. Während die Crew verbissen daran arbeitet, einen Weg zu finden, um die Verschmelzung rückgängig zu machen, beginnt sich "Tuvix" an sein neues Leben zu gewöhnen. Das führt so weit, dass Tuvix schließlich nicht in seine zwei ursprünglichen Personen gespalten werden möchte, da er nicht sterben will...

Nachdem Janeway und Chakotay durch einen Insektenstich mit einem Virus infiziert worden sind, der sich für sie tödlich auswirkt, sobald sie die heimische Umgebung des Insekts verlassen, müssen beide schweren Herzens auf dem Planeten zurückbleiben. Während die Voyager weiterreist und entgegen einem ausdrücklichen Befehl mit den Vidiianern Kontakt aufnimmt, beginnt sich Chakotay in seine neue Existenz einzuleben. Janeway dagegen ist besessen von dem Gedanken, das Gegenmittel zu finden. Anders als Chakotay ist sie nicht zum aufgeben bereit...

Als Seska Chakotay mitteilt, dass ihr Sohn in Gefahr ist, kann Chakotay das nicht ignorieren, obwohl es nach einer Falle aussieht. Janeway ist nicht bereit ihn alleine ziehen zu lassen, und weist die Crew an, dass die Voyager Chakotays Kind zu Hilfe eilt. Wie erwartet gerät das Schiff in eine Falle, jedoch wird die Crew so überrumpelt, das die Kazon die Kontrolle erlangen und die gesamte Crew auf einem steinzeitlichen Planeten aussetzt...