Ryan, Marissa, Seth und Summer beginnen ihr letztes Jahr an der Harbor High School. Doch bevor sie die letzten Tage der Ferien feiern können, hängt eine dunkle Wolke über den vier Freunden. Ryans Bruder Trey liegt, zwei Monate nachdem Marissa ihn in Notwehr niedergeschossen hat, immer noch im Koma und die Polizei will wissen, wer auf ihn geschossen hat. Wird Ryan die Schuld Marissa zuliebe auf sich nehmen? Julie und Jimmy geben in der Zwischenzeit alles, um ihre Tochter Marissa zu schützen. Sandy, Seth und Ryan versuchen unterdessen, bei sich zu Hause mit dem Vorfall klar zu kommen, während Kirsten sich in der Klinik mit der Patientin Charlotte (Gaststar Jeri Ryan) anfreundet. Doch Charlotte ist nicht die, die sie zu sein scheint...
Marissa wird wegen der Schießerei von der Harbor School verwiesen und alle Mühe, an der Entscheidung zu rütteln, scheinen vergebens. Kirsten darf die Klinik verlassen, lässt sich allerdings aus Angst vor einem Rückfall von Charlotte, die so etwas bereits erlebt hat, überreden, zunächst zu ihr zu ziehen. Sandy ist wenig begeistert. Der alljährliche Schuljahrmarkt steht an und Marissa sollte ihn wie in jedem Jahr organisieren. Da sie nun aber nicht mehr auf die Schule geht, hat ihre Rivalin Taylor die Leitung des Komitees übernommen, was Summer ganz und gar nicht passt. Sie will ihr den Posten streitig machen, um Marissas Andenken zu wahren... Jimmy hat unterdessen wieder einmal Geldprobleme, von denen Julie nichts ahnt.
Jimmy steht wieder einmal vor der schwierigen Entscheidung, Newport zu verlassen oder bei seiner Familie zu bleiben. Marissa und Ryan sind endlich wieder glücklich miteinander, aber werden von ihren Eltern dazu gedrängt, sich voneinander fern zu halten. In der Zwischenzeit drängt der Dekan Hess Seth und Summer dazu, aktiv für die Schule zu sein, doch letztlich planen die Beiden, wie sie Ryan und Marissa zusammenbringen können. Ihr Plan wirkt und Marissa und Ryan verbringen eine unvergessliche Nacht miteinander. Schließlich wird Calebs Testament verlesen, was Julie fassungslos macht.
Marissa beginnt ihr letztes Schuljahr an der Newport Union, einer öffentlichen High School. Sie hofft auf einen Neuanfang, doch schon bald bemerkt sie, dass dies nicht so einfach wird. Als sie neue Freunde kennen lernt, fühlt Ryan sich vernachlässigt. Summer wird unterdessen die Leitung des Schülerkomitees von Taylor streitig gemacht. Kirsten beschließt, die verschuldete Newport Group zu verkaufen. Julie hat Geldsorgen und muss aus ihrem Haus ausziehen.
Ryan beschließt, die Schule abzubrechen und Newport für einige Zeit zu verlassen, nachdem Dekan Hess nichts unversucht lässt, ihm seine Zukunft zu ruinieren. Doch was ist mit Marissa? Seth und Summer hecken einen Plan aus, Ryan zurück an die Harbor High School zu bringen.
Summer ist beunruhigt wegen Marissas neuen Freunden an der öffentlichen Schule und sie bittet Ryan deswegen um Hilfe. Sandy arbeitet in der Zwischenzeit an einem Plan für die Newport Group und bildet eine neue Partnerschaft. Charlotte überzeugt Julie und Kirsten, sich wieder mehr in die Newporter Gesellschaft zu integrieren und Taylor organisiert eine Veranstaltung an der Harbor High School und stellt sich zwischen Seth und Summer.
Die Freunde schauen sich ein Konzert der Band "The Subways" im Bait Shop an und Taylor bringt Ärger zwischen Seth und Summer. Marissa, fest entschlossen es nicht zur Eskalation zwischen Ryan und Volchok kommen zu lassen, tut alles um Ryan im Auge zu behalten. Sandy hat unterdessen einen neuen Geschäftspartner in der Newport Group: Matt.
Die Schüler der Abschlussklasse an der Harbor School und Newport Union bereiten ihre College-Bewerbungen vor, doch Ryan, Seth, Summer und Marissa müssen sich entscheiden, was sie tun sollen. Werden sie aufs College gehen? Und wohin? Marissa ist nicht in der Lage, eine Entscheidung zu treffen und geht zu Johnnys Surfwettbewerb, anstatt die Bewerbung fertig zu stellen. Julie ist in der Zwischenzeit gezwungen, zu ihren Wurzeln zurückzukehren und Kirsten, die sich voller Eifer in ihre Arbeit stürzen möchte, bittet Julie um Hilfe. Sandy lädt einen alten Freund des Berkeley College zum Abendessen mit Ryan und Seth ein.
Ryan macht ein Praktikum bei Sandy und Matt in der Newport Group, was letztlich darin endet, dass er hart arbeitet, um Matts Ruf zu retten. Summer und Seth haben sich Beide vorgenommen, an der Brown Universität angenommen zu werden und tun nun alles dafür, sich von den anderen Schülern an der Harbor High School abzuheben. Johnny gesteht Marissa endlich seine wahren Gefühle. Als Ryan und Marissa sich treffen, erzählen sie sich gegenseitig die Wahrheit.
Seths "Weihnukkah" steht vor der Tür, doch nicht alle können sich auf Weihnachten freuen. Johnny kann seine Knieoperation nicht bezahlen und die Freunde beschließen, ihm zu helfen, kurz bevor er eine Dummheit begeht.
Was wäre das letzte Schuljahr an der Harbor High School, ohne dass die vier Freunde zusammen sind? Summer, Seth und Ryan tun alles, um Marissa zurück an ihre alte Schule zu bekommen, während Johnny versucht, zwischen dem Glück von Marissa und seinen eigenen Gefühlen abzuwiegen. Sandy muß in der Zwischenzeit eine Entscheidung treffen, die Marissas Schicksal ändern könnte, und Julie und Dr. Roberts bereuen die Lügen, die sie ihren Töchtern erzählt haben.
Kaitlin Cooper ist zurück - sie kehrt aus ihrem Internat nach Newport zurück und ist ein Teenager geworden. Bereits nach ihrer Ankunft sorgt sie für einigen Ärger. Veronica Townsend hat unterdessen Interesse an Summers Vater Dr. Roberts, und erpresst Kirsten, ihr ein Date mit ihm zu verschaffen - andernfalls würde Marissa erneute Schwierigkeiten an der Harbor High bekommen.
Marissa tut alles, um ihre Schwester Kaitlin besser kennen zu lernen, doch Kaitlin sorgt für Ärger, als sie ihren Geburtstag vorbereitet. Sandy ermuntert Seth, auf's College zu gehen, doch Seth findet eine bessere Alternative. Sandy und Matt arbeiten gemeinsam an einem Vertrag für ein neues Krankenhaus und Julie versucht weiterhin, ihre Familie wieder zusammen zu bringen.
Summer findet die Wahrheit über Seth heraus, während Sandy und Matt mit einem Hindernis bei ihrem Krankenhausprojekt konfrontiert werden. In der Zwischenzeit führen Kirsten und Julie den Job mit ihrer Vermittlungsagentur ein wenig zu weit, was Julie dazu bringt, sich zu verstecken. Marissa sagt Johnny endlich, was sie wirklich fühlt und Kaitlin fragt sich, welche Cooper-Schwester Johnny wohl mag. Und schließlich kommt es zu einem tragischen Unfall...
Tragische Neuigkeiten zwingen die Freunde, ihre eigenen Probleme beiseite zu schieben und sich der Realität zu stellen. Nachdem Sadie in Newport ankommt, hilft Ryan ihr beim Umzug und dabei, Volchok loszuwerden, was dazu führt, dass er seine Beziehung zu Marissa in Frage stellt. Unterdessen sind Kaitlins Winterferien zuende - gerade als sie dabei ist, ihrer Familie nahe zu kommen, muss sie sich erneut verabschieden. Wird sie jemals nach Orange County zurück kehren? Und Julie und Kirsten organisieren eine Valentinstag Party.
Sadie und Ryan unternehmen einen Road Trip, um einen von Johnnys Verwandten zu treffen, und obwohl Ryan in eine alte "Chino-Art" zurückfällt, bringt der Ausflug ihn und Sadie näher zusammen. Könnte das das Ende der Beziehung zwischen Ryan und Marissa bedeuteten? In der Zwischenzeit findet sich Marissa in Johnnys Tod verwickelt wieder und Seth und Summer finden Julies und Neil Roberts Geheimnis heraus.
Ryan steht vor der Entscheidung, ob er Marissa zu seiner Geburtstagsparty einladen soll oder nicht, und Sandy will einen von Ryans Angehörigen in die Feier involvieren. Julie und Dr. Roberts sagen Summer und Marissa endlich die Wahrheit. Unterdessen kommen sich die beiden neuen Paare Ryan und Sadie sowie Marissa und Volchok näher.
Ein altes Gesicht kehrt nach Newport zurück und Ryan bietet seine Hilfe an, was zu einem Streit zwischen ihm und Sadie führt. Seth und Summer stehen vor einem neuen Problem, das Taylor zu lösen versucht. In der Zwischenzeit steht Marissa ganz alleine da und hat niemandem, der für sie da ist, und Sandy muss mit einer Menge Druck im Beruf zurechtkommen.
Julie und Dr. Roberts verkünden ihre Verlobung und Julie und Marissa ziehen bei den Roberts ein. In der Zwischenzeit entfernt sich Marissa immer weiter von ihren alten Freunden und vor allem Summer, als sie bei Volchok und seinen Kumpels nach Trost sucht. Ryan versucht, in seiner Beziehung mit Sadie den nächsten Schritt zu machen, doch Seths Sorgen um Marissa kommen ihm dazwischen. In der Newport Group hat Sandy weiterhin Probleme mit Matt und Kirsten nimmt Seth mit auf ein Treffen der Anonymen Alkoholiker.
Die Freunde erhalten Post von den Unis: Absagen und Zusagen, die sie dazu zwingen, einige lebensändernde Entscheidungen zu treffen. Ryan und Sadie versuchen sich zu entscheiden, was sie nach der High School machen und ihre Entscheidung geht auch Sandy und Kirsten an. Taylor veranstaltet eine "College Sweatshirt Party" in der Harbor High School und Marissa und Summer flicken ihre Freundschaft. In der Zwischenzeit haben die Geschehnisse in Sandys Job Auswirkungen auf sein Privatleben.
Ryan verlässt Newport und macht sich auf den Weg, seine Mutter zu besuchen. Doch vor dem Treffen hat er eine hitzige Begegnung mit einer Kollegin seiner Mutter. Zurück in Newport hat Seth immer noch Geheimnisse und Taylor und Summer hecken einen Plan aus, um herauszufinden, was mit Seth los ist. Der Plan geht nach hinten los und Summer ist verzweifelt. Julie stattet Volchok einen überraschenden Besuch ab und gibt ihm einen ernsten Rat. Marissa hilft unterdessen einem Mädchen aus einer gefährlichen Situation auf einer Party, die dort an Volchoks Freunde geraten ist. In der Zwischenzeit macht Sandy der Situation mit Matt endlich ein Ende - doch lässt Kirsten dabei allein zu Hause zurück.
In wenigen Wochen werden die Freunde die High School abschließen und Ryan, Seth, Summer und Marissa verlassen Newport, um die Studienanfänger-Orientierung in Berkeley und Brown zu besuchen. Als Kirsten die Jungs zum Flughafen bringt, ist sie überrascht, als sie auf Theresa trifft - und auf einen ihr bekannt vorkommenden kleinen Jungen. Während Seth die Brown-Universität besichtigt, trifft er überraschend auf Anna und die beiden haben sofort wieder einen Draht zueinander. Könnte dies das Ende von Summer und Seth sein? Kirsten und Sandy besuchen unterdessen eine Wohltätigkeitsveranstaltung im Krankenhaus, in der Kirsten ihren Frust endlich rauslässt und in alte Verhaltensweisen zurückfällt.
Der Abschlussball der Harbor High School bringt aus allen sowohl das Beste als auch das Schlechteste hervor... Für Taylor ist der Ball ein voller Erfolg, während Summers überraschendes Date ein Flop wird. Seth und Anna gehen gemeinsam zum Ball und haben einen Plan, mit dem Seth Summer zurückgewinnen will. Marissa überredet Volchok, sie zu begleiten, und Ryan bringt seine Ex-Freundin Theresa zur Feier. Als eines der Mädchen zur Ballkönigin gekrönt wird, wird es wirklich zu einem Abend, den sie niemals vergessen werden... Später, als Taylors Kasse gestohlen wird, kehrt Ryan zu seinen alten Verhaltensweisen zurück und der Abend endet brutal...
Ryan muss sich den Folgen des Abschlussballs stellen und sich auf einen gefährlichen Deal mit Volchok einlassen. Sandy wird zum "Mann des Jahres" gewählt, doch die Ermittlungen gegen ihn wegen des Krankenhaus-Geschäfts gehen weiter. Nachdem Marissa einen Anruf von Kaitlin erhalten hat, sie sie um Hilfe bat, besucht sie ihre Schwester im Internat. Und Ryans Verhalten bringt Theresa dazu, endgültig eine schwierige Entscheidung zu treffen. Seths macht unterdessen einen schwerwiegenden Fehler, der Konsequenzen nach sich zieht...
Das Ende des letzten Schuljahres ist gekommen, und damit die Aufregung vor dem Abschluss, sowie die Erwartungen an das neue Leben auf dem College. Doch für Seth, Ryan, Marissa und Summer ist es ebenfalls eine Zeit der Erinnerung. Seth muss sich entweder seiner Tat stellen oder dem Zorn von Sandy - und der Polizei. Ryans stolze Mutter kommt mit einer Überraschung für ihn nach Newport. Marissa erhält ein erstaunliches Angebot, das ihre Pläne komplett ändern könnte und Summer muss sich der Möglichkeit, ohne Seth wegzugehen, stellen. Aber neben den vielen Ansprachen und Tischreden ist nichts einfach in Newport: Sandy schockt Kirsten mit einer großen Entscheidung, nachdem er sein altes Pflichtverteidiger-Büro besucht hat. Marissas Schwester Kaitlin (Gaststar Willa Holland) kehrt zurück und zieht bei Julie ein, und gelobt, dass sie die nächste Cooper wird, die an der Harbor High bestimmen wird. Und zu Taylors Freude werden die "eingeschworenen Vier" zu den "fabelhaften Fünf". Aber obwohl die Kids bereit dafür sein mögen, ihre vielversprechende Zukunft anzutreten, könnten ungelöste Probleme aus ihrer Vergangenheit alles ändern.