Es stellt sich sich heraus, dass Sumaru von Akahoshi entführt wurde. Während Sumaru im Koma liegt, kämpft Akahoshi gegen Natsuhi und will im Gegenzug für ihren Sohn den Stern, den sie geklaut hat. Schließlich tauchen auch Naruto und Neji am Schlachtort auf und versuchen, Akahoshi zu helfen, da sie glauben, dass Sumarus Mutter der Bösewicht ist. Naruto gelingt es, Natsuhi aufzuahlten und Akahoshi stürzt die beiden aus dem Hinterhalt in die Schlucht mit den giftigen Gasen.
Neji bekommt von Akahoshi den Befehl, die Mission zu beenden und ihm den Rest zu überlassen. Währenddessen wacht Naruto in einem dunklen Raum auf, Natsuhi ist bei ihm. Sie erzählt ihm, dass sie die Mutter von Sumaru ist und ihre früherer Geschichte. Akahoshi und seine Männer gelangen zum Versteck, in dem Naruto und Natsuhi sich aufhalten. Als sie hinein wollen, springt ihnen Naruto entgegen und bekämpft zusammen mit Natsuhi Akahoshi und seine Männer.
Natsuhi ist immer noch im Kampf gegen Akahoshi und es scheint als ob Natsuhi`s Kräfte langsam schwinden doch sie gibt nicht auf. Doch plötzlich taucht Sumaru auf mit den anderen aus dem Dorf und den Konoha Ninjas. Natsuhi ist ganz überrascht und versinkt in Erinnerungen. Akahoshi sieht wie besorgt Natsuhi um Sumaru ist und greift ihn mit seinem Raubtier an und hält Sumaru gefangen. Neji bemerkt eine Riesenmenge Chakra und meint dass Sumaru ferngesteuert wird. Akahoshi stellt Natsuhi vor eine Schwierige Entscheidung: Entweder gibt sie ihm den Stern oder Sumaru wird sich selbst verletzen. Ihr bleibt keine andere Wahl und sie gibt ihm den Stern noch bevor Sumaru sich verletzt. Ein letztes Mal greift Akahoshi sie an und verletzt sie sehr stark. Sumaru fällt bewusstlos zu Boden. Die anderen Ninjas gehen zurück mit Akahoshi ins Dorf doch Hokuto bleibt und Lässt Sumaru nicht im Stich. In Natsuhis Höhle liegen die beiden und erzählen sich gegenseitig was wirklich passiert ist und schweben in Erinnerungen. Als Naruto später fragt wo seine Mutter hingegangen sei wusste er von nichts und sie machten sich auf die Suche. Im Trainingsraum des Sterns erwischte Akahoshi sie tötlich und Sumaru merkt es sofort als seine Kette zersplitterte. Akahoshi war nun Hoshikage und Sumaru lernte aus Wut "Jutsu des Pfaues: Flügel". Er schwört daraufhin Rache für seine Mutter.
Natsuhi hat versucht, den Stern zu entfernen uns ist dabei von Akahoshi erwischt worden. Bei einer Versammlung der Dorfbewohner wendet sich das Blatt weiter, denn plötzlich stellen sich viele gegen Akahoshi, nicht zuletzt deshalb, weil Mizura auftaucht und ihnen die schweren Verletzungen zeigt, die das Sterntrainng verursacht. Plötzlich begreifen auch alle, dass Akahoshi der Mörder des dritten Hoshikage ist und somit hat er verspielt...
Vor einiger Zeit war ein Fremder in das Dorf Konoha eingedrungen, der ein spezielles, ansteckendes Jutsu angewendet hatte, bevor man ihn überführen konnte. Tsunade befürchtet, dass der Hund Akamaru sich möglicherweise angesteckt hat und bittet Naruto, ihn im Auge zu behalten – was Kiba argwöhnisch macht. Er hat Angst, dass Akamaru eingeschläfert wird, wenn sich rausstellt, dass er infiziert ist und flieht mit ihm...
Naruto ist im Wald und trainiert, als plötzlich ein Adler über ihn hinweg fliegt und etwas fallen lässt. Es stellt sich bald heraus, dass es offensichtlich ein Onbaa Baby war - und das erkennt denjenigen, den es nach seiner Geburt als erstes sieht, als Vater oder Mutter an. Es klammert sich an dessen Rücken fest und bleibt dort, bis es erwachsen ist. Als Tsunade davon erfährt, bekommt sie es mit der Angst zu tun, denn ein Onbaa ist ein höchst gefährliches, bärenartiges Tier und wer möchte so etwas schon im Dorf haben. Sie gibt Naruto also eine Mission, die ihn möglichst weit weg führt, in der Hoffnung, dass sich das Onbaa Problem damit allein löst. Naruto hat sich inzwischen so sehr an den Kleinen gewöhnt, dass er ihn behalten möchte, doch dann taucht im Wald plötzlich der Onbaa Vater auf und will sein Junges zurückhaben...
Naruto ist mit Shino auf einer Mission. Er muss in das Dorf Motoyoshi gehen, um dort an einer Beerdigungszeremonie teilzunehmen. Der „Verstorbene“ hat ein merkwürdiges Testament hinterlassen. Sein ältester Sohn Fuuta erbt alles, wenn er bei der Trauerfeier nicht lacht. Tut er es doch, erbt er nichts und alles wird unter den anderen Verwandten aufgeteilt. Klar, dass die Verwandten alles daran setzen werden, Fuuta zum lachen zu bringen, doch der hat die Möglichkeit, einen Stellvertreter zur Zeremonie zu schicken. Das soll Shino sein, der noch nie gelacht hat. Doch dem wird etwas ins Essen gemischt und fortan schüttet der arme Shino sich vor Lachen aus. Also muss Naruto ran, der sich aber bekanntermaßen über jeden Blödsinn amüsieren kann und somit für die Aufgabe keine gute Wahl ist...
Naruto ist ganz verrückt darauf, endlich eine neue Mission zu bekommen und da im Moment nichts anderes im Angebot ist, schickt Tsunade ihn, Hinata und Choji los, um ein paar Kaufleuten Geleitschutz zu geben. Nicht besonders spannend, aber immerhin. Naruto fällt allerdings auf, dass einer der Kaufleute, Shun, eher unfreundlich ist, und als Naruto sich einmal von der Truppe entfernt, wird er prompt überfallen – irgendetwas seltsames hat es auf sich mit diesen Kaufleuten aus dem Grünen Land, in dem es angeblich immer so friedlich zugeht...
Naruto, Choji und Hinata müssen ein paar Kaufleuten Geleitschutz zu geben. Doch die Gefahren, die auf dem Weg lauern, scheinen übermäßig hoch zu sein... Naruto dämmert es langsam, dass diese Kaufleute etwas zu verbergen haben. Und tatsächlich, einer von ihnen, Shun, ist in Wahrheit Prinzessin Haruna, einzige Tochter des Feudalherren des Grünen Landes. Er will sie fortschaffen, weil das Land von den Ja-Nin bedroht wird, drei Brüdern, die es übernehmen wollen und auch gute Chancen dazu haben, denn sie haben bereits mehr als die Hälfte der Beamten bestochen. Naruto und Co. fassen den Plan, die Wagenkolonne zu teilen, so dass die Kaufleute in Sicherheit sind...
Naruto und Choji gelingt es, Ruiga außer Gefecht zu setzen, doch Yurinojou wird dabei verletzt. Also bleibt Choji bei ihm, während Naruto sich auf die Suche nach Hinata macht, die den Auftrag hat, Prinzessin Haruna in Sicherheit zu bringen. Doch Haruna legt Hinata rein und verschwindet. Derweil begegnet Naruto dem zweiten der Ja-Nin-Brüder, Jiga. Der lockt ihn in eine Art Felsenarena und wartet mit der Überraschung auf, dass sein Jutsu etwas mit Magnetismus zu tun hat. Da die Felsen von Eisen durchzogen sind, stellt das Naruto vor ein größeres Problem...
Naruto gelingt es nicht seinen Feind zu besiegen, jeder Versuch an ihn heranzukommen ist vergeblich und er verliert den Kampf. Schließlich stellt sich Hinata dem Feind. Naruto versucht sie davon abzuhalten, jedoch ohne Erfolg. Hinata attackiert den Feind mit Juuken, doch dieser trägt nicht einen einzigen Kratzer davon. Hinata führt den Gegner fort von Naruto und versucht es ein letztes Mal ihn zu treffen, was auch gelingt. Jedoch fliegen beide einen Berg hinunter.
Naruto versucht um jeden Preis, die Prinzessin vor Renga zu beschützen, doch gelingt es ihm nicht an diesen heranzukommen, da er sich ständig mit seinem Eis verteidigt. Renga bündelt mit seinem Eis plötzlich das Licht der Sonne, wodurch ein riesiger und tödlicher Lichtstrahl entsteht den er auf Naruto und die Prinzessin lenkt. Renga feuert immer wieder mit seinem Strahl auf Naruto, plötzlich lenkt dieser den Strahl mit seinem Stirnband auf Renga und verletzt ihn an seiner Schulter. Plötzlich tauchen Shizune und Shikamaru auf um Renga festzunehmen. Kurz Bevor die Ninja abreisen, fragt Haruna Naruto ob er nicht bei ihr bleiben will, um das Grüne Land wieder aufzubauen.
Ino bekommt von Tsunade ihre neue Mission, bei der sie das Double einer Prinzessin spielen soll, da sie sich beide ziemlich ähnlich sehen. Bei der ganzen Mission soll Naruto, von Tsunade auserwählt, assistieren. Im Königreich angekommen, erfahren sie den Grund warum Ino die Prinzessin spielen soll. Da die Prinzessin früher einmal dünn war, bevor sie Chikara aus dem Nachbarsdorf traf und sich in ihn verliebt hat. Doch als Naruto und Ino Chikara sehen, sind sie fürchterlich geschockt.
Lee eröffnet ein Dojo und Gai will, da dieser keine Herausforderer hat, verkleidet, gegen ihn kämpfen. Bevor er das tun kann, geht er noch auf eine dringende Mission. Als Gai die Stadt verlässt, verwandelt sich ein Spion in diesen. Der Spion wird von Naruto in Lees Dojo gedrängt und kämpft einen aussichtslosen Kampf. Schließlich wird er besiegt und fliegt mit einem harten Schlag aus dem Gebäude. Der Betrüger in Form von Gai bittet Naruto, dass dieser sich in ihn verwandelt und gegen Lee kämpft, während er sich ausruht. Natürlich nur ein Vorwand um seine Mission fortzusetzen, dazu verwandelt sich der Spion in Lee. Zu seinem Unglück jedoch, kommt nun der wahre Gai und fordert den Betrüger in der Person von Lee heraus. Am Ende wird die Situtation aufgeklärt und es stellt sich heraus, dass der Spion bereits gesucht wurde. Der von Tsunade auf Lee, Naruto und Gai übertragene Auftrag wurde somit schnell erledigt.
Da Lady Kayo nach ihrer Abreise aus dem Honig-Reich, nicht in ihrer eigenen Heimat, dem Rote-Bohnen-Reich, angekommen ist, sollen Naruto, Hinata und Kiba sich nach aufmachen und nach ihr suchen. Unterwegs fängt es an zu regnen, doch die drei finden schnell einen Unterschlupf, nämlich ein Schloss und gehen hinein. Schnell merken die drei, dass etwas mit dem Gebäude nicht stimmt.
Alle Genin werden von Tsunade nacheinander gerufen um eine Medizinische Untersuchung durchzuführen. Es stellt sich jedoch dann heraus dass Lee sein Chakra überstrapaziert hat und somit für eine weile nicht mehr seine Lotus Techniken einsetzen darf. Dass macht ihn sehr traurig doch Gai muntert ihn wieder auf nicht aufzugeben und eine neue Technik die der Stärke eines Lotus entspricht zu kreieren. Er geht dann mit Lee trainieren und dabei treffen sie Gais alten Freund Yagura, der gegen Lee kämpfen will. Der Kampf dauert nicht lang, denn Yagura ist zwar jünger als Lee doch um einiges besser als er. Yagura bricht Lee während des Kampfes fast das Bein aber dann greift Maito Gai ein und somit gewinnt Yagura den Kampf. Lee will weiter kämpfen doch Gai bringt ihn ins Krankenhaus. Dort wird er von Sakura behandelt. Danach triffte er Yagura und Lee meint dass er sobald er wieder kämpfen dürfe gegen Yagura eine Revanche antreten wolle, doch Yagura meint dies sei nur Zeitverschwendung für ihn, da Lee sowieso nur die Jutsus Von Gai kopieren würde. Kurz darauf sieht Lee wie Gai zusammen mit Yagura zu einer Mission aufbrach. Während dessen erfährt Tsunade von Shizune dass der richtige Yagura auf dem Weg nach Konoha angegriffen worden war und verletzt ist. Somit ist der Mann der mit Gai auf die Mission gegangen ist nur eine Fälschung. Tsunade schickt sofort Neji, Tenten und Naruto los um Gai zu retten. Sie jagen den beiden durch einen Wald hinterher da sie glauben dass die beiden diesen Weg genommen haben und nicht den gefährlichen durch eine Gebirgskette. Doch sie haben sich geirrt, den Gai rennt zusammen mit dem falschen Yagura in den Bergen herum. Yagura tut so als ob er von einem schmalen Weg gestürzt währe und Gai folgt ihm sofort um ihn wenn nötig zu retten, doch Gai trifft auf viele Trainingspuppen die ihn sofort angreifen. Gai kämpft gegen die Puppen und schlägt sich gut, bis die Puppen zu langen Holzstäben werden und in in einem Haus gefangen halten. Neji schafft es immer noch nicht Gai mit seinem Byakugan zu sehen.
Gai versucht verbittert aus diesem Käfig rauszukommen doch es gelingt ihm nicht. Dann taucht plötzlich der falsche Yagura auf und man erfährt dass er einer der drei Ryuudoin Brüder ist. Sie wollen sich an Gai rächen, da dieser bei einer Mission Agira Ryuudouin den Vater der Brüder getötet hat. Agira macht aus dem Hölzernen Haus eine Burg wo er Gai festhält. Während dessen sind auch Neji, Tenten und Naruto aufgetaucht und finden heraus wie man die Puppen zerstören kann. Dann kommt auch Lee der wie sein Sensei in die Burg gesperrt wird. Beide kämpfen gegen einer der Puppen, die die Bewegungen des jeweils anderen nachahmt. Also kämpfen Lee und Gai eigentlich gegeneinander. Gai findet dass heraus und klopft mit seinem Fuß Morsezeichen, die die Puppe die gegen Lee kämpft nachmacht. Die beiden schaffen es die Technik von Agira zu brechen indem beide 5 Geistertore öffnen. Die ganze Burg bricht zusammen und Gai erklärt den Brüdern dass sie ihren Vater falsch verstanden haben und dass er gemeint hat dass sie Gai als starken Gegner bekämpfen sollen und nicht ihn umbringen. Gai sagte außerdem, dass er bei diesem Kampf gelernt habe, dass nicht Wunderkinder etwas besonderes sind, sondern jene, die bis zum Umfallen trainieren. Dies war wahrscheinlich eine Anspielung auf das Wunderkind des Hyuuga-Clans, Neji, und Rock Lee.
Die ANBU verfolgt einen Verbrecher, der Blaupausen von Konoha gestohlen hat und geflüchtet ist. Der Dieb jedoch kann entkommen.Tsunade ruft alle Jo-Nin und Chu-Nin zusammen, da ein Bombenspezialist vor hat Konoha zu zerstören. Tsunade schickt sie alle an die nördliche Grenze um den Feind aufzuspüren und nur noch die Ge-Nin, die unter der Führung von Shikamaru in Konoha für Ordnung sorgen, sind übrig. Naruto erfährt, wer Konoha zerstören will und kann es nicht glauben.
Die ANBU versucht anhand von Narutos Erinnerungen, alles über Gennou herauszufinden. Dabei wollen sie jedes kleinste Detail und Gespräch wissen um vielleicht einen Anhaltspunkt zu finden wer ihn beauftragt hat. Naruto jedoch kann sich überhaupt nicht mehr erinnern was er mit dem alten Mann geredet hat und die ANBU wendet Jigyaku no Jutsu an um es herauszufinden. Letztendlich fällt Naruto dadurch in einen tiefen Schlaf und spricht alles aus.
Naruto und Co. erfahren, dass der alte Mann Gennou nicht bei der Explosion gestorben ist und dieser einen Tunnel gegraben hat um vor den ANBU zu flüchten. Shikamarus Team sucht in ganz Konoha nach Fallen um diese zu entschärfen, jedoch leider ohne Erfolg. Schließlich finden sie mit Hilfe von Hinata und Neji heraus, dass überall in Konoha Briefbomben verstreut worden sind.
Naruto und Co. haben fast alle Kibakufuda, die in ganz Konohagakure verstreut waren, beisammen. Währenddessen findet Shikamaru heraus warum die Kibakufuda in Konoha verstreut waren. Naruto schießt plötzlich ein Gedanke durch den Kopf wer das alles verursacht hat. Und er behält Recht, der alte Mann mit dem er Ramen essen war, hatte den Plan Konoha in die Luft zujagen.
Shikamaru fällt letztendlich ein was Gennou vor hat und trommelt die anderen zusammen um ihn aufzuhalten. Währenddessen liefert sich Naruto einen Kampf zusammen mit dem alten Mann im inneren der Hokagestatuen. Gennou verrät Naruto, dass er vorhat die Hokagestatuen in die Luft zu sprengen um Konoha darunter zu begraben. Schließlich treffen die anderen ein und unterstützen Naruto im Kampf gegen den alten Mann, jedoch ohne Erfolg. Gennou beschwört einen riesigen Vogel herbei der davon fliegt, doch der alte Mann selber kann nicht flüchten und wird besiegt. Naruto und Co. erfahren letztendlich was wirklich der Plan mit dem Vogel war, jedoch zu spät.
Die fünf besten Ninja Kämpfe werden ausgewählt und auf Platz fünf landen Naruto vs Sasuke sowie auf dem vierten Platz Choji vs Jirobo. Bevor die ersten drei Plätze belegt werden, werden die beiden Kämpfe von Kakashi, Kakashi vs Zabuza und Kakashi gegen Platz zwei Kakashi vs Gai in Schere, Stein, Papier gezeigt. Schließlich kommt es zum Höhepunkt und auf Platzt drei liegt Kiba vs Sakon & Ukon, sowie Neji vs Kidomaru. Nachdem auch der beste Kampf ausgewählt wird meldet sich außerdem ein besonderer Ehrengast.
Ein fremdes Mädchen taucht in Konoha auf und steckt das Haus des Hokage, durch ein Gen-Jutsu in Brand. Es stellt sich heraus, dass das Mädchen früher die Schülerin von Kurenai war und diese gibt sich die Schuld dafür, dass sie zurückgekehrt ist und deshalb will sie ihr helfen. Kurenai muss eine Entscheidung treffen - Team 8 verlassen oder nicht.
Kurenai, hat eine Entscheidung getroffen und verlässt Team 8. Unterwegs zu Yakumo, wird sie aufgehalten von Naruto, der alles daran setzt sie dazu zu überreden nicht zu gehen doch scheitert er - Naruto fällt in Kurenais Gen-Jutsu. Als er wieder aufwacht, sind Hinata, Kiba, Shino, Sakura und Gai bei ihm, denen von Tsunade aufgetragen worden ist, ihm zu helfen. Als Kurenai am Ziel ist und das Haus erreicht hat, indem Yakumo ist, wird sie angegriffen.
Kurenai ist es gelungen, zu Yakumo vorzudringen, jedoch werden die beiden von zwei Mitgliedern des Kurama-Clans aufgehalten. Kurenai, gelingt es die beiden schnell mit ihrem Gen-Jutsu zu besiegen und flüchten. Als Naruto und die anderen am Haus angelangt sind, ist Kurenai schon verschwunden. Währenddessen wird diese unterwegs von Unkai, einem Mitglied des Kurama Clans aufgehalten. Im letzten Moment, gelingt es Naruto den Angriff von Unkai abzuwehren und besiegt diesen mit Uzumaki Naruto Rendan. Team 8, Gai, Sakura und Naruto bringen Yakumo wieder zurück ins Haus. Als Yakumo aufwacht, ist Naruto bei ihr und sie erzählt auf einige Fragen von ihm, dass ihre Eltern durch ein Feuer gestorben ist, dass der 3.Hokage angeordnet hatte.
Naruto, Hinata, Sakura, Kiba, Shino, Kurenai und Yakumo Kurama kehren zurück nach Konoha. Doch sie müssen feststellen, dass er durch einen Krieg völlig zerstört worden ist. Kurenai und Yakumo werden ins Krankenhaus gebracht - Es stellt sich heraus, dass alles nur ein Gen-Jutsu von Yakumo ist. Unkai taucht plötzlich wieder im Krankenhaus auf. Als es zum Kampf zwischen ihm Naruto kommt verwandelt sich der Raum nebenan in Magma und es gibt keinen Ausweg für die beiden, außer sie schalten ihre fünf Sinne aus. Schließlich gelingt es Unkai und Naruto herauszukommen aus dem Gen-Jutsu, jedoch trägt Unkai schwere Verletzungen davon. Kurenai ist immer noch im Raum zusammen mit Yakumo, die versucht Kurenai umzubringen. Naruto, Hinata, Kiba und Shino eilen zur Rettung.
Naruto und Co. gelingt es nicht vorzudringen wegen eines Feuers, erschaffen von Yakumo Kurama. Naruto jedoch gelingt es mithilfe seiner Schattendoppelgänger zu Kurenai zu gelangen. Mehr und mehr kommt der Idou in Yakumo zum Vorschein. Naruto und Kurenai können Yakumo aber davon überzeugen, dass nur sie es ist, die den Dämon in ihr besiegen kann. Schließlich gelingt es Yakumo ihren inneren Dämon zu besiegen.
Naruto und Kiba werden beauftragt zusammen mit Shinemon eine sehr wertvolle und kostbare Vase in eine kleine Stadt zu liefern. Auf dem Weg dorthin geraten die drei jedoch ständig in Schwierigkeiten. Kurz vor Ablieferung der Vase geht sie kaputt, doch es stellt sich heraus das Shinemon es war, der die Vase gemacht hat.
Naruto und Lee, sind gerade bei ihrem gemeinsamen Training als Sakura sie dabei stört wegen einer neuen Mission. Gemeinsam gehen die drei zu Tsunade und erfahren um was es dabei geht. Sie sollen Gantetsu, einen Shinobazu der im Wald-Reich bei einem Überfall gefangen wurde, in die Landeshauptstadt des Wald-Reiches eskortieren. Doch unterwegs dorthin läuft einiges Schief und sie werden, wie erwartet, von den Shinobazu angegriffen.
Lee und Sakura, stürzen über Bord und können sich jedoch ans Ufer retten. Währenddessen verteidigt Naruto immer noch den Gefangenen gegen die Angreifer, die Shinobazu. Schließlich schlägt der Rettungsversuch der Shinobazu fehl und das Schiff stürzt einen Wasserfall hinunter. Naruto, Todoroki und Gantetsu überleben den Sturz, doch es dauert nicht lange bis der Angriff weitergeht. Die drei flüchten und gehen dabei durch den "Wald der Verwirrung". Schließlich verlaufen sie sich und nach Angaben von Gantetsu, ist man für imme Verloren, wenn man sich in diesem Wald verläuft.
Todoroki versucht Gantetsu umzubringen, da dieser seine Familie bei einem Überfall vor fünf Jahren getötet hat.Todoroki erzählt Naruto alles, was damals passiert ist und dafür will er schließlich Rache nehmen. Naruto stellt sich im in den Weg als sie plötzlich von Monju, einem Mitglied der Shinobazu angegriffen werden.
Naruto taucht endlich auf und versucht Gantetsu aus dem Käfig von Monju zu befreien. Naruto gelingt es das Mitglied der Shinobazu zu besiegen, doch plötzlich taucht Shuura auf und entführt Akio, der sich als verstorben geglaubter Bruder von Todoroki entpuppt. Naruto, Gantetsu und Todoroki folgen Shuura, um die Sache zu erledigen. Während die Drei noch unterwegs zum Versteck sind, foltert Shuura den kleinen Bruder von Todoroki, um herauszufinden wo die Truhe versteckt ist.
Naruto findet auf seiner Suche nach Bambus Gipfelsprösslingen, die Ichirakus Nudelsuppe noch köstlicher macht, einen Jungen bewusstlos am Ufer eines Flusses. Er bringt ihn ins Krankenhaus, um ihn untersuchen zu lassen. Als der Junge aufwacht, kann er sich an nichts mehr erinnern und das Einzige, was er besitzt, ist eine Flöte. Naruto hilft ihm dabei, sein Gedächtnis wiederzuerlangen. Während sie die Statuen der Hokage putzen, werden sie angegriffen.
Naruto erzählt Tsunade davon, wie seine Kraft im Kampf gegen den Angreifer wuchs als Menma auf seiner Flöte spielte. Tsunade erzählt ihm und Menma, dass diese Fähigkeit im Reisfeld-Reich bei einem Angriff benutzt wurde und sie schickt Naruto, Menma, Neji und Tenten los, um dort Informationen über Menma und seine Vergangenheit zu erfahren. Im Dorf angekommen, erfahren sie das die Angreifer vom letzten Mal zurückkehren wollen und Naruto und die anderen entschließen sich dazu, eine Mauer um das Dorf zu errichten. Als plötzlich der selbe Angreifer, der Naruto und Memna töten wollte, die Ninja aus Konoha angreift, wird Memna dabei lebensgefährlich verletzt. Als die Dorfbewohner Menma wiedererkennen (Menma griff mit den Anderen zusammen das Dorf an und tötete einen Mann) sind sie nicht bereit ihn zu operieren.
Die Dorfbewohner operieren Menma doch, um sich einen Vorteil gegenüber den Angreifern zu verschaffen, falls sich dieser wieder an alles erinnern sollte. Nachdem der Schutzwall fertig gebaut wurde, wird das Dorf angegriffen. Naruto und Co. gelingt es die Angreifer zurückzuschlagen, doch der Frieden hält nicht lange und die Männer drohen, den Staudamm zu sprengen um das Dorf zu überfluten.
Kakashi ist in Takumigakure und sucht nach der ultimativen Waffe, von der Tsunade berichtet hat. Währenddessen erfahren Naruto und Shikamaru, dass Gaaras Team Lehrer in einer Schule aus Sunagakure geworden ist. Da alle Angst haben vor Gaara, gehen sie zu Temari und Kankuro. Nur Matsuri hat keine Angst und will Gaaras Schülerin werden. Shitenshounin sind mittlerweile in Suna eingetroffen und entführen Matsuri. Gaaras Team und die Genin aus Konoha, machen sich auf den Weg sie zu retten.
Naruto und Co. versuchen immer noch Gaaras Team einzuholen. Währenddessen treffen die drei auf Shitenshounin und Temari bleibt zurück um gegen Kujaku zu kämpfen. Als Kankuro und Gaara flüchten wollen, werden sie von Ryuugan aufgehalten und Kankuro bleibt zurück. Gerade als Temari und Kankuro geschlagen sind tauchen Shikamaru und Ino auf um Temari zu helfen, während Kiba und Choji Kankuro zur Hilfe kommen. Währenddessen nehmen Naruto, Lee und Sakura die Verfolgung von Gaara auf.
Der Kampf gegen die vier Shinobi aus Takumi geht immer noch weiter. Als plötzlich Jin, Kujaku, Ryuugan und Suiko, Ningu Kekkai: Gyaku Uroko no Jin anwenden um Gaara zu besiegen. Gaara fliegt zu Boden und liegt Hilflos da. Suiko, will die Sache beenden und will Gaara den Gnadenstoß verpassen als Lee aufkreutzt und den Schlag mit Konoha Senpuu abwehrt. Naruto und Sakura erreichen die beiden und während Sakura sich um Gaara kümmert, bekämpfen Lee und Naruto Ryuugan. Kankuro, Kiba und Choji gelingt es Ryuugan und Shikamaru, Temari und Ino Kujaku zu besiegen. Gaara hat inzwischen Suiko besiegt und nimmt die Verfolgung von Jin auf.
Gaara hat Jin eingeholt und es kommt zum Kampf zwischen den beiden. Naruto holt Gaara endlich ein und mischt im Kampf mit. Währenddessen schickt Tsunade, Kakashi und Jiraiya los um Naruto und den anderen zu helfen. Jin ist es mittlerweile gelungen, Gaaras Chakra zu nutzen um Seimei wieder zum Leben zu erwecken. Er saugt Jin in sich auf und verbündet sich mit dessen Waffen und erschafft somit eine ultimative Waffe.
Gaara kämpft immer noch gegen Seimei und es scheint als könne er den Kampf nicht gewinnen, da Seimei Gaaras Chakra komplett ausgesaugt hat. Gaara wendet Shukaku no Hoko und daraufhin sofort Sabaku Taisou an. Somit kann Gaara den Kampf für sich entscheiden und zusammen mit den anderen geht er wieder nach Konoha. Für Naruto ist es soweit Konoha zu verlassen, um zweieinhalb Jahre mit Jiraiya zu trainieren.