Kira befreit den bajoranischen Volkshelden Li Nalas aus cardassianischer Kriegsgefangenschaft. Zuhause soll er helfen, das Volk zu einen, aber Li ist kriegsmüde und der Verantwortung überdrüssig geworden. Erst als "der Kreis", eine radikale Gruppe von Bajoranern, die gegen alle Fremdeinflüsse sind, immer stärker wird, akzeptiert er die Verantwortung und wird neuer Verbindungsoffizier auf DS9....................
Auf Bajor wird Kira gekidnappt und erfährt, dass Minister Jaro der Anführer des Kreises ist. Während Jaro und Winn gemeinsame Pläne schmieden und die Föderation auffordern, DS9 zu verlassen, findet Odo heraus, dass der Kreis von den Cardassianern mit Waffen versorgt wird. Sisko und seine Leute müssen die Station verlassen, aber eine kleine Gruppe bleibt im Verborgenen zurück........
General Krim übernimmt das Kommando auf DS9. Wenig später gelingt es Sisko und seinen Leuten, ihn davon zu überzeugen, dass dies alles ein Komplott der Cardassianer ist. Derweil versuchen Kira und Jadzia, dem Ministerrat die Beweise für die cardassianische Beteiligung am Kreis näher darzulegen. Als Sisko hinzukommt und Opfer eines feigen Attentats werden soll, wirft sich Li Nalas in die Schusslinie. Der Heldentod hat ihn nun zu einer Legende gemacht...........
Die Station muss auf Grund eines Plasmasturms bis auf eine Notbesatzung geräumt werden. Das nutzt der Trill Verad, um auf DS9 einzudringen und Jadzias Symbiont an sich zu bringen. Da der unvereinte Trill der Meinung ist, dass ihm Dax rechtmäßig zusteht, ist ihm Jadzias Schicksal (der Tod) egal. Er hat aber nicht mit dem vehementen Einsatz ihrer Freunde gerechnet..............
Rugal, ein cardassianischer Jugendlicher, wurde wie viele andere Kinder auf Bajor zurückgelassen. Nun kommt sein leiblicher Vater nach DS9 und möchte Rugal wieder mit sich nehmen, aber der junge Cardassianer denkt längst wie ein Bajoraner und hasst sein eigenes Volk. Dass er am Ende mit seinem leiblichen Vater gehen muss, ist eine schwere Entscheidung, die nicht unbedingt zum Besseren des Jungen ist.................
Melora Pazlar ist Elaysianerin und an die geringe Schwerkraft ihres Planeten gewöhnt. Außerhalb ihrer Welt ist sie auf den Rollstuhl angewiesen. Da sich Dr. Bashir in diese ungewöhnliche Frau verliebt, setzt er alles daran, ihr zu helfen. Tatsächlich findet er einen Weg, wie Melora in normaler Schwerkraft gehen kann. Da die dafür nötige Prozedur aber unumkehrbar ist, entscheidet sie sich dagegen...................
Der große Nagus kommt nach DS9, um mit einer Rasse aus dem Gamma-Quadranten Geschäftliches zu verhandeln. Dabei lernt Quark den Ferengi Pel kennen, mit dem er ausgezeichnet zusammenarbeiten kann. Wie sich jedoch bald herausstellt, ist Pel eine Frau. Das sorgt für einen mittelschweren Skandal, da Frauen in der Ferengi-Gesellschaft nichts bedeuten.................
Ermittlungen in einem Fall, führen zu der Bajoranerin Pallra, deren Mann vor fünf Jahren auf der damals noch von Cardassianern geführten Station umgebracht wurde. Während Odo langsam erkennt, dass Pallra in Erpressungsversuche verstrickt ist, wird ihm auch klar, dass der Mörder damals jemand anderes gewesen sein muss: Kira...........
Sisko lernt die wunderschöne Fenna kennen, in die er sich schnell verliebt. Kurz darauf darauf ist sie jedoch verschwunden, aber bei einem Dinner mit dem genialen Wissenschaftler Seyetik erkennt Sisko in dessen Frau Fenna. Die weiß allerdings von nichts. Wie sich herausstellt, materialisiert Fenna nur eine Projektion aus ihrem Unterbewusstsein, sie selbst liegt im Koma..............
Durch das Wurmloch kommt ein Schiff, deren Besatzung, die Skrreea, eine verfolgte Rasse, in Bajor den Planeten ihrer Prophezeiung gefunden zu haben glaubt. Als sie darum bitten, auf Bajor leben zu können, wobei sie sich sogar mit einem kargen Stück des Planeten zufrieden geben würden, lehnt die provisorische Regierung von Bajor ab. Darum sucht Jadzia nach Draylon II, dass für die Skrreea zur zweiten Heimat werden kann..............
Quark bekommt in dem Schwindler Martus einen Konkurrenten. Der Kleinganove hat ein Gerät an sich gebracht, das sein eigenes Casino zum florierenden Laden macht. Überhaupt zeigt sich an Bord der Station schnell, dass manche enorme Glücks-, andere unglaubliche Pechsträhnen haben. Und so wendet sich schließlich auch für Quark und Martus das Schicksal einmal mehr..............
Mora Pol kommt nach DS9. Odo ist darüber wenig erfreut, ist Dr. Mora Pol doch der Wissenschaftler, der als erster mit ihm experimentiert hat, nachdem Odo als gallertartige Flüssigkeit entdeckt wurde. Nun verkündet Dr. Mora, dass er eine Idee hat, wo Odos Volk herkommen könnte. Gemeinsam begibt man sich in den Gamma-Quadranten und sucht den entsprechenden Planten auf. Dort kommt es zu einem Zwischenfall, der für Odo wahrhaftig bewusstseinsverändernd ist..........
O'Brien und Bashir sollen als Abgeordnete der Föderation den einstmals verfeindeten T'Lani und Kellerunern bei der Vernichtung ihrer biochemischen Harvesta-Waffen helfen. Kurz nachdem dies geschehen ist, taucht ein Todeskommando auf, dem O'Brien und Bashir nur knapp entgehen können. Wie sich herausstellt, haben sich die beiden Völker dazu entschlossen, jeden zu töten, der die Zusammensetzung der Harvesta-Waffen kennt, um so zu verhindern, dass sie jemals wieder gebaut werden können...........
O'Brien kommt nach einer Mission aus dem Paradas Sektor nach DS9 zurück, wo sich jeder ihm gegenüber merkwürdig verhält. Schnell beginnt der Chief niemandem mehr zu vertrauen und als er Sisko und Kira zu Friedensverhandlungen nach Parada II folgt, wird klar, dass hier etwas nicht stimmt: O'Brien gibt es zwei mal, doch derjenige, der sich verfolgt gefühlt hat, ist in Wirklichkeit ein Klon..........
Sisko und O'Brien beamen auf einen Planeten, auf dem keinerlei Technik funktioniert, weswegen sie von ihrem Shuttle abgeschnitten sind. Hier treffen sie auf die Besatzung eines vor zehn Jahren verunglückten Schiffes, die nun hier leben. Das Leben an sich könnte schön sein, doch Alixus, die Leiterin der Gemeinde, versucht, mit drakonischen Mitteln zu regieren und betrügt ihre Leute darüber hinaus noch..........
Odo und Jadzia landen auf einem Planeten des Gamma-Quadranten. Dort treffen sie auf ein kleines Dorf, dessen Bewohner besorgt sind, da bereits einige von ihnen verschwunden sind. Die beiden finden schließlich heraus, dass niemand bis auf einen in diesem Dorf echt ist. Alle sind nur geschickt gemachte Hologramme, auch wenn sie das selbst nicht wissen. Nachdem der Projektor repariert ist, tauchen auch die Verschwundenen wieder auf...........
Jadzia soll den Vereinigungskandidaten Arjin auf seine Eignung testen. Dafür hat sie jedoch sehr wenig Zeit, da nicht nur die Station, sondern das ganze Universum selbst durch die Entstehung eines neuen Protouniversums in Gefahr ist. Da Arjin von Jadzia vernachlässigt wird, fürchtet dieser schließlich, als ungeeignet für die Vereinigung abgestempelt zu werden.....................
Die Cardassianerin Natima kommt mit zwei Schülern nach DS9. Sie sind auf der Flucht vor dem Obsidianischen Orden, der sie als Verräter jagt. Als ein cardassianisches Schiff auftaucht und die Herausgabe der Dissidenten fordert, greift Quark, der Natima einst liebte, ein und hilft ihnen bei der Flucht...............
Die Klingonen Kang, Koloth und Kor kommen nach DS9. Sie haben einst geschworen den Albino, einen Klingonen, der vor 80 Jahren ihre Söhne ermordete, umzubringen. Mit von der Partie ist nun auch Jadzia Dax, deren vorheriger Wirt Curzon ebenfalls diesen Blutschwur abgelegt hat. Gemeinsam macht man sich auf, den Albino zu suchen. Als es zur Begegnung kommt, kann der Rache Genüge getan werden, auch wenn Kang und Koloth sterben.............
Ein cardassianisches Schiff, das DS9 verlässt, explodiert. Offensichtlich war es Sabotage, wobei schnell klar wird, dass diese nicht von Bajoranern, sondern vom Marquis ausging. Als Gul Dukat nach DS9 kommt und dem illegalen Krieg des Marquis gegen Cardassia erzählt, wird er entführt. Wenig später muss Sisko herausfinden, dass sein alter Freund Cal Hudson ein Mitglied des Marquis ist..............
Hudson bittet Sisko, sich seiner Sache anzuschließen. Die Föderation hat die Menschen der entmilitarisierten Zone verlassen, während die Cardassianer ihresgleichen mit Waffen versorgen. Nachdem es Sisko gelingt, Dukat zu befreien, vereinbaren die beiden einen Deal: Sisko geht gegen den Marquis vor, während Dukat die Waffenlieferungen an die Cardassianer stoppt..............
Bashir bemerkt bei seinem üblichen Essen mit Garak, dass es dem Schneider nicht sehr gut geht. Als er ihn untersucht, fällt ihm ein Implantat auf. Dies ist dafür da, den Träger gegen Schmerzen unempfindlich zu machen, wurde von garak auf DS9 aber im Dauereinsatz gebraucht und funktioniert nun nicht mehr. Während der Doktor nach einer Möglichkeit sucht, seinem Freund zu helfen, will er auch mehr über dessen Vergangenheit herausfinden. Er erhält aber nur widersprüchliche Informationen........
Kira und Bashir geraten durch einen Unfall im Wurmloch in ein paralleles Universum, wo die Menschen die Sklaven einer Allianz aus Bajoranern, Klingonen und Cardassianern sind. Auf DS9 stoßen sie auf die Doppelgänger in diesem Universum, aber keiner entspricht dem, was Kira und Bashir gewohnt sind: am allerwenigsten die Intendantin der Station, die niemand anderes als Kira ist...
Die Wahl des neuen Kai steht an. Nominiert sind Vedek Winn und Vedek Bareil, wobei erstere in ihrer Geltungssucht nichts unversucht lässt, um ihren Gegner in Misskredit zu bringen. Als sie Kira, die mit Bareil ein Verhältnis hat, davon in Kenntnis setzt, dass dieser ein Kollaborateur der Cardassianer gewesen sein soll, untersucht sie die Vorgänge und findet heraus, dass Kai Opaka seinerzeit einige Widerstandskämpfer verriet, um unschuldige zu retten. Nun will Bareil das ansehen der Kai schützen.....................
O'Brien wird von einigen Cardassianern gekidnappt und nach Cardassia gebracht. Dort soll ihm der Prozess gemacht werden, obwohl er gar nicht weiß, welchen Verbrechens er eigentlich angeklagt ist. Während Odo und Sisko sich für den Chief einsetzen, zeigt sich, dass ein cardassianischer Spion dafür verantwortlich ist, dass O'Brien in diese bedrohliche Lage geriet........................
Sisko, Jake, Quark und Nog reisen in den Gamma-Quadranten, um ein wenig Urlaub zu machen. Auf einem Planeten stoßen sie auf eine Telepatin die von den Jem'Hadar, den Elitekriegern des Dominions, verfolgt wird. Schon bald geraten auch Sisko und Quark in Gefangenschaft, aber kurz darauf gelingt die Flucht. Bei einer großen Auseinandersetzung zwischen der U.S.S. Odyssey und den Jem'Hadar zeigt sich, dass das Dominion weitere Einfälle in sein Territorium nicht toleriert.................