Staffel 3

Sisko kehrt nach drei Monaten auf der Erde mit dem neuen Schiff, der Defiant, auf die Station zurück. Ein Schlachtschiff, noch im Experimentalstadium, einst wegen der Bedrohung durch die Borg entwickelt. Ausgerüstet mit einem romulanischen Tarnschild, zu dessen Überwachung ebenfalls eine romulanische Offizierin an Bord. Eine erste Mission in den Gamma Quadranten wird vorbereitet. Trotz Differenzen begleitet auch Odo die Offiziere auf dieser Mission. Mit dem neuen Schiff ist man nun auch tatsächlich in der Lage, die Jem´Hadar zu täuschen ‑ mit Hilfe des integrierten Tarnschildes. Odo bekommt inzwischen immer mehr das Gefühl, schon einmal in dem Sektor, den sie erkunden, gewesen zu sein. Überrascht von den Jem´Hadar, müssen Dax und O'Brien auf einem Planeten, den die beiden gerade erkunden, zurückgelassen werden. Nach einem harten Kampf wird schließlich die Defiant geentert, nur Kira und Odo gelingt die Flucht mit einem Shuttle. Die beiden Flüchtigen entdecken einen Planeten, auf dem sich ein riesiger See befindet: Odo's Heimat. Der See ist in Wirklichkeit das Kollektiv der Shapeshifter.

Während die Defiant unterzugehen droht, ergreift Odo mit der bewusstlosen Kira die Flucht in einem Shuttle. Auf merkwürdige Art wird der Gestaltwandler zu einem Planeten gezogen. Dort finden die beiden einen großen gallertartigen See und Odo erkennt, dass er Zuhause ist. Dies ist die Heimat der Gestaltwandler, die wiederum die Gründer des Dominion sind....

Quark tötet in Notwehr einen Klingonen in seiner Bar, stellt es im Nachhinein jedoch als große Heldentat hin. Wenig später tauchen weitere Klingonen auf und für Quark wird es immer verzwickter, denn schließlich muss er sogar das Oberhaupt des Hauses werden und Grilka heiraten...

Jadzia hat Visionen, die sie nicht versteht. Nach einer Untersuchung ist klar, dass mit ihr und dem Symbionten etwas nicht stimmt. Sie reist zur Heimatwelt der Trill, wo sich schließlich herausstellt dass sie das Opfer einer uralten Verschwörung wurde. Wie sich zeigt, hatte der Dax-Symbiont einen weiteren Wirt, was verheimlicht werden muss, da ein scheinbar inkompatibler Wirt aufzeigen würde, dass jeder Trill mit einem Symbionten verschmelzen kann.............

Kira wird entführt und wacht auf Cardassia auf. Sie hat nun das Äußere einer Cardassianerin und man erklärt ihr, dass sie die Tochter von Tekeny Ghemor ist, die einst als Undercoveragentin nach Bajor geschickt wurde. Tatsächlich ist dies jedoch nur ein Komplott des Obsidianischen Ordens, mit dem man Ghemor in Misskredit bringen will................

Quark findet in einigem Schrott, den er gekauft hat, ein Baby. Dies ist jedoch kein gewöhnliches Baby, sondern ein Jem´Hadar, der sehr schnell zu seiner vollen Größe heranwächst. Odo möchte die Gelegenheit nutzen, ihn zu mehr als nur einem Kämpfer zu machen, aber als er erkennt, dass dies nicht möglich ist, bringt er ihn zu seinem Volk zurück.................

Auf DS9 wird versehentlich ein altes Verteidigungsprogramm der Cardassianer aktiviert, das nun jedem auf der Station zum Verhängnis werden könnte. Erst als Gul Dukat auftaucht, scheint sich die Situation zu bessern, aber er will einige gute Konditionen für die Cardassianer herausschlagen..............

Im Gamma-Quadranten wird ein Planet entdeckt, der nur alle 60 Jahre aus seiner Dimension austritt. Nur in der kurzen Periode, da man in dieser Dimension ist, leben die Menschen dort normal. Als sich Jadzia in einen der Meridianer verliebt, will sie dort bleiben, kann es aber nicht, da ihr Körper den Übergang nicht überstehen würde.........

Will Riker kommt nach D59 und lässt sich die Defiant vorführen. Da nutzt er die Gelegenheit und bringt das Schiff in seine Gewalt. Tatsächlich ist dies nämlich nicht Will, sondern dessen Bruder Tom Riker, der sich mittlerweile dem Maquis angeschlossen hat. Als er mit dem Schiff in den cardassianischen Raum eintritt, kann er zwar eine geheime Basis nicht vernichten, macht aber immerhin Dukat darauf aufmerksam, dass der Obsidianische Orden weit über seine Grenzen hinaus operiert. Am Ende ergibt sich Riker und gerät in Gefangenschaft.......

Lwaxana Troi kommt zur Feier eines bajoranischen Festes nach DS9. Schon bald benehmen sich alle merkwürdig. Leute, die sich früher liebten, können sich nun nicht mehr ausstehen, und neue Liebschaften werden geboren. Bashir findet heraus, dass der Grund hierfür eine harmlose Krankheit der Botschafterin ist, die andere beeinflusst hat.......

Die Defiant fliegt zur Erde. Im dortigen Orbit geschieht schließlich ein Transporterunfall der Sisko, Bashir und Jadzia ins 21.Jahrhundert versetzt. In dieser düstere Zeit müssen sich die Drei zurechtfinden, wobei Sisko und Bashir in einer Art Ghetto landen. Dort ist Sisko schließlich gezwungen, die Rolle des historisch wichtigen Gabriel Bell zu übernehmen.

Ein Problem ist nun, dass die Zeitlinie gestört wurde und die Föderation nie entstand. Darum muss Sisko alles daran setzen, Bells historische Taten umzusetzen und zu einer Verbesserung der Gesellschaft beizutragen. Am Ende ist diese Aufgabe vollbracht und ein erster Schritt in Richtung Föderation ist getan......

Vedek Bareil wird bei einem Unfall schwer verletzt. Da er jedoch gerade sehr wichtige Verhandlungen mit den Cardassianern führt, die zum Wohle Bajors sind, besteht er darauf, dass Bashir dafür sorgt, dass er dies auch weiterhin unternehmen kann, auch wenn ihn das langsam umbringt. Während Kira versucht, Bareil zu überzeugen, sich selbst zu schonen, stirbt dieser schließlich. Nicht jedoch, ohne die Verhandlungen zu einem positiven Abschluss gebracht zu haben........

Kira und Odo landen auf einem Mond, auf dem Kira schließlich von einer kristallinen Masse eingeschlossen wird. Während ihr Körper mehr und mehr davon bedeckt wird, gesteht ihr Odo seine Liebe, woraufhin sich Kira in einen Wechselbalg verwandelt. Diese wollten endlich wissen, warum Odo den Solids die Loyalität. Nog bittet Sisko darum, ein gutes Wort für ihn einzulegen, da er der Sternenflotte beitreten will........

Die Föderation und Cardassia wollen ein gemeinsames Wissenschaftsprojekt betreiben. Ziel ist es, eine ständige Kommunikationsverbindung in den Gamma-Quadranten aufzubauen. Sisko erhält jedoch Besuch von einem Vedek der ihn warnt, dass das Wurmloch zum Kollabieren gebracht werden soll.......

Der Große Nagus kommt nach D59, doch er ist nicht mehr der geldgierige Ferengi, der er früher war. Nun predigt er anstelle der Erwerbsregeln Güte und Barmherzigkeit. Quark kann das alles nicht glauben. Tatsächlich stellt sich heraus, dass die Propheten dahinter stecken, da sie von dem Ferengi genervt waren und ihn darum ein wenig "modifiziert" haben......

O'Brien hat einen Unfall und wird dadurch ständig durch verschiedene Zeitebenen gerissen. Dabei erfährt er von seinem eigenen Tod und der Vernichtung von DS9. In dem Versuch, sowohl sein eigenes Leben als auch DS9 zu retten, unternimmt er einen kontrollierten Sprung, stirbt jedoch. Sein Alter Ego aus der Zukunft kehrt aber zurück und rettet DS9.............

Quark schlägt Bashir ein Geschäft mit dem Lethianer Altovar vor, der eine illegale Droge erwerben will. Als dieser schließlich in Bashirs Labor danach sucht, wird er von dem Doktor überrascht, woraufhin es Altovar gelingt, den Doktor in seinem eigenen Geist Schachmatt zu setzen.......

Der O'Brien aus dem Paralleluniversum kommt nach DS9, weil er Siskos Hilfe braucht und ihn deswegen entführt. Der parallele Sisko, der zu einem Helden des Widerstands geworden ist, ist tot, weswegen der andere Sisko für kurze Zeit dessen Rolle übernehmen soll. Immerhin gilt es, seine ehemalige Frau Jennifer davon abzuhalten, für die Allianz ein Gerät zu entwickeln, das den Widerstand zerschmettern würde.....

Sowohl auf Garak als auch auf andere prominente Cardassianer werden Anschläge verübt, wobei die Romulaner dahinter stecken. Odo und der Schneider reisen schließlich nach Cardassia, da Enabran Tain, einst Garaks Mentor, in Gefahr schwebt. Tatsächlich ist Tain jedoch der Kopfeiner cardassianisch romulanischen Allianz, die in den Gamma-Quadranten aufbrechen will, um das Dominion ein für allemal zu vernichten....

Tain bietet Garak an, wieder in den aktiven Dienst beim Obsidianischen Orden zurückzukehren. Um seine Loyalität zu beweisen, soll er jedoch Odo foltern, was er auch ausgiebig tut. Als die vereinte Flotte aus Schiffen des Tal Shiar und des Obsidianischen Ordens zum Angriff ansetzt, gerät sie jedoch in einen Hinterhalt, wobei Odo und Garak gerettet werden......

Sisko und Jake unternehmen gemeinsam eine Reise auf einem altertümlichen Sonnensegler, den sie nach Plänen alter bajoranischer Schiffe gebaut haben. Während der Reise haben Ben und Jake endlich Gelegenheit, miteinander zu reden, wobei Jake seinem Vater klarmacht, dass er sich Starfleet nicht anschließen wird, sondern lieber Schriftsteller und Reporter werden möchte....

Brunt, ein Beamter der FCA, der Ferengi Commercial Authority, kommt nach DS9 und setzt voller Schadenfreude alles daran, Quarks Leben zu vernichten. Schuld daran trägt Quarks Mutter Ishka, die auf Ferenginar die traditionelle Rolle der Frau abgestreift und sich sowohl im Geschäft als auch im Privatleben bewährt hat.............

Kai Winn beauftragt Kira, mit Shakaar, einem ehemaligen Widerstandskämpfe zu reden, da dieser angeblich Technologie gestohlen hat, die dringend für die Urbarkeitmachung des Bodens benötigt wird. Tatsächlich will die Kai jedoch nur das Versteck des Mannes erfahren und das Material mit Gewalt an sich reißen gerade rechtzeitig zur Ministerwahl. Kai Winn ist aber schließlich gezwungen, ihre Kandidatur zurückzunehmen, woraufhin Shakaar zum neuen Ersten Minister gewählt wird...........

Eine Zeremonie der Trill wird abgehalten, bei der das Bewusstsein der früheren Wirte von Dax auf Jadzias Freunde übergeht. Da Curzon sich in Odos Körper jedoch pudelwohl fühlt, denkt er gar nicht daran, diesen wieder zu verlassen. Nog besteht derweil die Aufnahmeprüfung für die Akademie der Sternenflotte....

Sisko reagiert mit der Defiant auf ein Notsignal. Schon bald zeigt das Schiff seinen eigenen Willen und nimmt mit aktivierten Waffen Kurs auf ein bewohntes Sonnensystem. Wie sich herausstellt, ist einer der Menschen an Bord ein Wechselbalg, der versucht, einen Krieg zu provozieren, welcher den Alpha-Quadranten schwächen soll. Am Ende tötet Odo den anderen Wechselbalg.................