Gowron lässt die Klingonische Flotte vor Bajor zusammenziehen, um so eine Bedrohung aus dem Gamma Quadranten abzuwehren. Die vielen Klingonen sorgen jedoch auch für Probleme, selbst wenn General Martok Sisko gegenüber erklärt, mit ihm Seite an Seite gegen das Dominion zu kämpfen. Die Sternenflotte versetzt Worf von der Enterprise nach DS9, da er dort Sisko helfen soll, mit den Klingonen fertig zu werden. Die Cardassianer werden zusehends nervöser, da sie mit den Klingonen mehr oder minder auf Kriegsfuß stehen. Als die Klingonen auch noch ein Schiff mit Ratsmitgliedern attackieren, eskaliert die Situation und die Klingonen beginnen den Angriff auf DS9, der jedoch sowohl von der Station als auch einem sich nähernden Flottenverband von Starfleet abgeschlagen wird...................
Gowron lässt die Klingonische Flotte vor Bajor zusammenziehen, um so eine Bedrohung aus dem Gamma Quadranten abzuwehren. Die vielen Klingonen sorgen jedoch auch für Probleme, selbst wenn General Martok Sisko gegenüber erklärt, mit ihm Seite an Seite gegen das Dominion zu kämpfen. Die Sternenflotte versetzt Worf von der Enterprise nach DS9, da er dort Sisko helfen soll, mit den Klingonen fertig zu werden. Die Cardassianer werden zusehends nervöser, da sie mit den Klingonen mehr oder minder auf Kriegsfuß stehen. Als die Klingonen auch noch ein Schiff mit Ratsmitgliedern attackieren, eskaliert die Situation und die Klingonen beginnen den Angriff auf DS9, der jedoch sowohl von der Station als auch einem sich nähernden Flottenverband von Starfleet abgeschlagen wird...................
Der alte Jake Sisko erinnert sich daran, wie sein Vater starb, während er noch ein kleiner Junge war. In der Zukunft konnte Jake jedoch herausfinden, dass sein Vater damals in einer Zeitspalte gefangen war, weswegen er nun die Gelegenheit hat, ihn damals zu retten und die Zeitlinie zu verändern.....
O'Brien und Bashir befinden sich im Gamma-Quadranten und erleiden mit ihrem Runabout Schiffbruch. Dort werden sie von Jem'Hadar aufgegriffen, die die Hilfe des Doktors brauchen. Da ihr zum Überleben notwendiger Stoff, Ketracel White, zur Neige geht, soll Bashir neues White oder ein Heilmittel herstellen. O'Brien sieht die Gelegenheit für gekommen, den Feind zu vergiften, während Bashir in dieser Herausforderung eine Chance für den Frieden sieht.........
Dukat und Kira machen sich gemeinsam daran, ein Schiff der Breen zu verfolgen. Jeder von ihnen ist auf der Suche nach einer Person, die vor langer Zeit von den Breen verschleppt wurde. In Dukats Fall ist dies seine Tochter Ziyal, die er jedoch töten möchte, da sie seine neue Position als Botschafter bedrohen würde. Ein Skandal könnte den Gul stürzen, aber er entscheidet sich schließlich trotzdem für seine Tochter.....
Einige Trill kommen nach DS9, um wissenschaftliche Experimente durchzuführen. Eine der Trill ist Lenara Khan, deren früherer Wirt mit Curzon liiert war. Nach alter Trill Tradition dürfen neu vereinigte Trill keine alten Beziehungen mehr aufnehmen. Jadzia ist sich dessen bewusst, aber als sie Lenara trifft, brechen alte Gefühle wieder hervor..........
Captain Sisko trifft an Bord der Defiant mit Minister Hanok von den Karemma zusammen. Plötzlich greifen die Jem'Hadar an. Die Defiant wird beschädigt, Sisko schwer verletzt. Worf übernimmt das Kommando.
Quark bekommt von seinem Cousin Gaila ein Shuttle, mit dem er zusammen mit Rom seinen Neffen Nog zur Akademie der Sternenflotte auf die Erde bringen will. Da Gaila, der sich an Quark rächen will, das Shuttle jedoch manipuliert hat verschlägt es die drei Ferengi in die Vergangenheit. Im Jahr 1947 landen sie nun in Roswell und sind auf Odo angewiesen, der für die Rettung sorgen muss.
Kor besucht Jadzia und erklärt, dass er auf der Suche nach dem sagenumwobenen Schwert des Kahless ist, das er im Gamma-Quadranten vermutet. Zusammen mit Worf macht man sich nun auf die Suche und findet das Schwert auch. Als jedoch Streit zwischen Kor und Worf aufkommt, wird ihnen klar, dass dieses Schwert nie ins Klingonische Reich zurückkehren darf, da es sonst zu einem Bürgerkrieg kommen würde...........
Bashir spielt mit Garak ein Agentenabenteuer auf dem Holodeck. Schwierigkeiten tauchen auf, als einige Holocharaktere plötzlich wie Sisko, Kira, Dax, Worf und O'Brien aussehen. Diese gerieten bei einem Notfalltransport in die Muster des Holodecks, wobei sie nun jedoch ebenso wie echte Holocharaktere sterben können..............
Auf der Erde wird ein Terrorakt von einem Wechselbalg verübt. Das wiederum sorgt für aufkeimende Paranoia, die auf der Erde schnell um sich greift. Sisko soll auf der Erde für die Sicherheit des Sternenflottenkommandos sorgen. Dort hat Admiral Leighton bereits damit begonnen, die Erde langsam in einen Polizeistaat umzumodeln. Schließlich ruft er auch noch das Kriegsrecht aus..................
Sisko kommt einer Verschwörung auf die Spur, die jedoch nicht von den Formwandlern ausgeht, gerade einmal vier von ihnen befinden sich auf der Erde. Vielmehr hat Admiral Leighton alles zu einem Staatsstreich vorbereitet. Nun liegt es an Sisko und Odo, dafür zu sorgen, dass die Menschheit nicht wieder in ein dunkles, längst vergessen geglaubtes Zeitalter zurückfällt..............
Shakaar ist Premierminister von Bajor und trifft sich des Öfteren mit Kira. Da eine cardassianische Gruppe einen Anschlag auf Shakaar plant, liegt es an Odo, für dessen Sicherheit zu sorgen. Als er mit Shakaar zusammen arbeitet und von diesem in sein Vertrauen einbezogen wird, regt sich in Odo ein bislang ungekanntes Gefühl: Eifersucht..............
Shakaar beauftragt Kira, zu einem cardassianischen Außenposten zu reisen und geheime Informationen über die Klingonen einzuholen. Die Reise unternimmt sie auf einen Frachter, dessen Captain Dukat ist. Dieser hat alles verloren, als er Ziyal als Tochter anerkannte. Als sie sich dem Außenposten nähern, treffen sie auf ein klingonisches Schiff, das Dukat schließlich kapern kann. Mit diesem Bird of Prey will Dukat nun für seine Heimat kämpfen, während Ziyal mit Kira nach DS9 geht...............
Kurn sucht Worf auf. Er bittet seinen Bruder, ihm beim rituellen Selbstmord zu helfen da er nicht länger ohne Ehre leben will. Worf willigt ein, aber Kurn wird im letzten Moment gerettet. Für den Klingonen, für den scheinbar weder in seiner Heimat noch bei der Föderation ein Platz ist, findet Worf schließlich eine Lösung: Kurns Aussehen wird verändert und seine Erinnerung gehemmt, sodass er ein neues Leben beginnen kann...........
Quark kürzt wieder mal das Gehalt seiner Angestellten, die daraufhin beschließen, dass sie sich das nicht länger bieten lassen. Rom ruft zum Streik und der Gründung einer Gewerkschaft auf, womit er allen Ferengi-Regeln trotzt................
Aus dem Wurmloch kommt ein bajoranisches Schiff, auf dem sich der seit 200 Jahre verschollene Dichter Akorem Laan befindet. Akorem glaubt bald, der wahre Abgesandte zu sein, was Sisko nur recht ist, aber als der Dichter beginnt, sein Amt zu missbrauchen, schreitet Sisko ein und erfährt, dass ihm die Propheten mit diesem kleinen Ereignis die Augen in Bezug auf seine Aufgabe als Abgesandter öffnen wollten............
Worf wird von den Klingonen angeklagt mit der Defiant ein klingonisches ziviles Schiff angegriffen und vernichtet zu haben. Sein Ankläger wartet mit Beweisen auf, wobei es ihm gelingt, mehr und mehr die Schuld des Klingonen zu untermauern, aber tatsächlich ist dies nur ein perfider Versuch, Worfs Ruf zu schädigen...........
Die Argrathi beschuldigen O'Brien der Spionage. Sie bestrafen ihn auf ihre übliche Weise: O'Brien wird die Erinnerung an eine 20-jährige Haftzeit eingepflanzt. Er wird mit den schrecklichen Erinnerungen nicht fertig.
Jennifer Sisko aus dem Paralleluniversum kommt nach DS9 und verschwindet mit Jake. Als Sisko ihr folgt, erklären die Rebellen ihm, dass man seine Hilfe beim Bau einer Defiant braucht. Da Sisko keine andere Wahl hat, willigt er ein, doch die Zeit drängt, denn eine Flotte der Allianz unter dem Kommando von Worf ist auf dem Weg................
Lwaxana kommt nach DS9 und bittet Odo um Hilfe. Er soll sie heiraten, da sie sonst ihr Kind an ihren bisherigen Mann verliert. Der Gestaltwandler willigt schließlich ein, Lwaxana bei dieser heiklen Angelegenheit zu helfen. Derweil trifft Jake auf eine Muse die sein schriftstellerisches Talent fördert, aber tatsächlich ernährt sie sich von der Lebensenergie des jungen Manns..................
Man erwartet eine Lieferung von Replikatoren für die Cardassianer, aber als Sisko von Lt. Eddington darüber informiert wird, dass sich ein Spion des Maquis an Bord befindet, läuft alles nicht mehr glatt ab. Der Verdacht fällt auf Siskos Freundin Kasidy Yates, doch in Wahrheit ist Eddington der Spion, der die Replikatoren für den Maquis an sich bringt.............
Nach der Rückkehr aus dem Gamma Quadranten muss Sisko feststellen, dass DS9 von den Jem´Hadar angegriffen wurde. Mit der Defiant geht man an die Verfolgung und findet schließlich heraus, dass es sich bei den Jem'Hadar um Rebellen handelte, die sich vom Dominion losgesagt haben................
Bashir, Jadzia und Kira folgen einem Notsignal, das sie zu einem Planeten führt, auf dem ein grausamer Virus wütet, der von den Gründern verursacht wurde und über kurz oder lang alle töten wird. Bashir beginnt mit der Entwicklung eines Impfstoffes, hat am Ende aber nur teilweise Erfolg. Den Infizierten kann er nicht helfen, aber neugeborene Babys erhalten durch den Impfstoff Immunität gegen den Virus............
Quark ist todkrank. Um seine Schulden zu bezahlen, will er sich umbringen lassen, damit seine Überreste verkauft werden können. Er bekommt ein gutes Angebot und sagt zu. Da erfährt er, dass er doch nicht sterben muss. Der Käufer besteht allerdings auf Erfüllung des Vertrags.
Odo kann seine Gestalt nicht mehr halten. Da Bashir nichts für den Formwandler tun kann, bringt Sisko Odo mit der Defiant in den Gamma Quadranten und zu seinem Volk. Als sich ihnen ein Wechselbalg nähert, erfahren sie, dass diese Krankheit nur ein Trick war, die Odo herlocken sollte. Er muss sich nämlich für den Mord an einem Wechselbalg verantworten. Das Urteil sieht vor, dass Odo zu einem Solid wird...............