Odo erklärt, dass Gowron in Wahrheit ein Wechselbalg ist und sich darum die Klingonen so merkwürdig verhalten haben. Sisko und einige seiner Leute dringen, als Klingonen maskiert, nach Kronos vor, wo sie Gowron ausschalten und jedem zeigen wollen, dass er ein Wechselbalg ist. Tatsächlich ist jedoch Martok der Wechselbalg, wobei es der Plan des Dominion ist, mit der Ermordung Gowrons einen nochgewaltigeren Krieg im Alpha-Quadranten auszulösen.................
Im Gamma-Quadranten stößt man auf einem Planeten auf ein abgestürztes Schiff der Jem'Hadar. Sisko will es unbedingt haben, da es für den Geheimdienst wichtig sein kann. Just in dem Moment taucht ein weiteres Schiff der Jem'Hadar auf und eine Patt Situation entsteht. Immerhin wollen die Jem'Hadar etwas, das sich an Bord des Schiffes befindet: einen Gründer..........
Quark erhält Besuch von Grilka, die ihren Ex-Ehemann um Hilfe bei der Ordnung ihres Hauses bittet. Da Quark an Grilka interessiert ist, lässt er sich auch von Jadzia und Worf Lektionen in Sachen "Klingonisches Liebeswerben" geben. Derweil entdecken Jadzia und Worf, dass sie einander auch nicht ganz unattraktiv finden.......
Jake will ein Porträt von Dr. Bashir verfassen und begleitet ihn deshalb. Als ihr Shuttle einen Notruf auffängt, will Bashir diesen erst nicht erwidern, um Jake nicht in Gefahr zu bringen. Der junge Mann drängt ihn jedoch, dies nicht zu tun. Als man nach Ajilon Prime kommt, erkennt Jake, dass der Krieg hierzwischen Föderation und Klingonen - kein Abenteuer, sondern ein dreckiges Geschäft ist. In den Stunden, die er auf dem Schlachtfeld und mit den Verwundeten verbringt, wird Jake ein wenig erwachsener.....
O'Brien muss feststellen, dass Keikos Körper von einem Pagh-Wraith-Geist übernommen wurde. Diese erbitterten Feinde der Propheten wollen O'Brien nun dazu benutzen, den Himmelstempel für sich zurückzuerobern, wobei der Chief auf Schritt und Tritt überwacht wird und nur auf Roms Hilfe - der Ferengi arbeitet mittlerweile als Techniker für die Bajoraner - zurückgreifen kann................
Die Defiant transportiert einen Drehkörper, den ein klingonischer Spion benützt, um sie in der Zeit zurückzuversetzen. So gelangen Sisko und seine Leute ins 23. Jahrhundert und treffen auf einer Station auf den legendären Captain Kirk, der gerade einer Plage Tribbles Herr werden muss. Da der Klingone Kirk für seine damalige Entlarvung töten will, müssen Sisko und Co. nun alles daran setzen, den Captain zu retten und die Zeitlinie zu bewahren....................
Jadzia und Worf wollen in ihrer jungen Beziehung endlich gemeinsam Urlaub machen. Während Worf jedoch gerne etwas Martialisches machen würde, ist Jadzia für Risa und setzt in der Beziehung auch ihren Kopf durch. Bald beginnt der Streit, aber als ein Moralapostel namens Fullerton alles daran setzt, Risa dem Erdboden gleich zu machen, raufen sie sich schnell zusammen................
Das Runabout von Sisko, Dax, Odo und Garak gerät in einen Plasmasturm, worauf hin die vier geborgen werden, wobei sie zwar leblos wirken aber noch Gehirnaktivität vorhanden ist. Die vier finden sich auf Terok Nor und in der Vergangenheit wieder, Odo erkennt, dass sie die Rollen von vier Bajoranern haben, die einst trotz nicht schlüssig erwiesener Schuld exekutiert wurden, wofür Odo die Verantwortung trug. Nun hat ihn die Vergangenheit eingeholt.................
Odo soll Quark zu einer Gerichtsverhandlung eskortieren. Unterwegs entdecken sie, daß im Runabout eine Bombe versteckt ist. Als sie versuchen, die Bombe ins All zu beamen, geht sie hoch. Die Explosion wird durch das Transporterfeld eingegrenzt, daß Shuttle muß dennoch auf einem Planeten der L-Klasse notlanden. Die Kommunikationssysteme, der Replikator und viele Rationen sind zerstört. Nun sind beide aufeinander angewiesen, um in der Eiswelt zu überleben. Inzwischen besucht Nog die Station, und er muß sich mit Jake ein Quartier teilen...
Sisko ist von der versunkenen bajoranischen Stadt B'Ihala fasziniert. Er beschließt, nach ihr zu suchen und kann sie, unterstützt durch Visionen, sogar finden. Diese Entdeckung führt dazu, dass Kai Winn nun auch in Sisko den Abgesandten sieht und einem Beitritt Bajors zur Föderation zustimmt, Sisko jedoch hat von den Propheten eine andere Vision erhalten, die ihm aufzeigt, dass Bajor die Vernichtung drohen könnte, wenn es zu früh der Föderation beitritt. Darum rät er Bajor von diesem Schritt ab....
Als ein früheres Mitglied des Widerstands, mit dem Kira befreundet war, ermordet wird und sie eine Nachricht erhält, dass dies erst der Anfang ist, versucht sie herauszufinden, wer einen Rachefeldzug gegen den ehemaligen Widerstand führt. Tatsächlich findet sie auch den Cardassianer Silaran Prin, der durch einen Anschlag des Widerstands entstellt wurde. Nun will er Rache und Kira töten, auch wenn er bereit ist, das ungeborene und unschuldige Kind in ihrem Leib zu schonen................
Odo trifft auf einen verletzten Wechselbalg, der noch ein Kind ist. Er versucht, das Junge aufzuziehen, aber nichts, was er macht, bringt die gallertartige Masse zu einer Reaktion. Erst als Dr. Mora Pol kommt und Taktiken verwenden werden, die auch bei Odo benutzt wurden, gibt es Reaktionen, wodurch Odo erkennt, dass er dem Doktor viele Jahrelang umsonst unrecht getan hat. Am Ende stirbt der Wechselbalg, gibt Odo aber seine Fähigkeit des Gestaltwandelns zurück. Kira entbindet Keikos Kind...........
Eddington taucht wieder auf und Sisko beginnt mit der Defiant die Verfolgung. Da es Eddington jedoch gelingt, die Defiant außer Gefecht zusetzen, muss ein anderes Schiff die Verfolgung fortsetzen. Da erfährt Sisko, dass Eddington biogenetische Waffen gegen Welten der Cardassianer einsetzen und diese damit unbewohnbar machen will. Nun setzt der Captain alles daran, Eddington aufzuspüren. Als es zur Konfrontation kommt, droht Sisko, diese biogenetischen Waffen gegen Maquiswelten einzusetzen, und so dem Maquis die Grundlage zum Kampf zu entziehen.................
Man fängt eine verschlüsselte cardassianische Botschaft auf, die Garak für Sisko entschlüsselt. Sie stammt von Enabran Tain, der damals im Kampf mit den Jem'Hadar nicht starb, sondern sich nun in einem Gefängnis des Dominion befindet. Garak und Worf brechen in einer Geheimmission auf, um die Gefangenen zu befreien. Im Gamma-Quadranten müssen sie erleben, wie die Jem'Hadar eine gewaltige Invasionsflotte zusammen ziehen. Sie geraten in Gefangenschaft und werden aufeinen Gefängnisasteroiden gebracht. Dort treffen sie auf den echten General Martok und den echten Julian Bashir.............
Durch das Wurmloch kommt eine gewaltige Flotte der Jem'Hadar, die Kurs auf Cardassia nimmt. Gul Dukat erklärt, Cardassia sei nun offizielles Mitglied des Dominions, wobei mit Hilfe der Jem'Hadar auch die Klingonen aus dem cardassianischen Gebiet zurückgedrängt werden. Derweil können Bashir, Garak, Martok und Worf aus der Gefangenschaft fliehen. Im Alpha-Quadranten schließen Klingonen und Föderation Frieden, um gemeinsam gegen den neuen Feind vorzugehen...............
Dr. Zimmerman, der Erschaffer des Medizinischen Notfall Hologramms, das er seinem Äußeren entsprechend gestaltet hat, kommt auf die Station. Er möchte Bashir als Vorbild für die nächste Generation des MHN. Zu diesem Zweck hält Zimmerman mit Freunden und Verwandten Interviews ab. Dabei spricht er auch mit Bashirs Eltern und bohrt in deren Vergangenheit. Wie sich herausstellt, wurde Bashir in jungen Jahren genetisch aufgewertet. Ein Vorgehen, dass von der Föderation als Verbrechen geahndet wird......
Odo lernt die junge Frau Arissa kennen, in die er sich sogar verliebt. Allerdings wird er aus ihr nicht schlau, da sie ihm ein ums andere Mal eine andere Geschichte ihrer Vergangenheit erzählt....................
Quark hat geschäftliche Probleme, als Gaila auftaucht und ihm anbietet, in den Handel mit Waffen einzusteigen. Nach der Vorstellung des Partners Hagath erklärt Gaila, wie es ablaufen soll. Quark führt den potentiellen Käufern in den Holosuiten Simulationen der Waffen vor, während der Verkauf außerhalb der Station stattfindet. Alsbald treten Probleme auf..........
Tekeny Ghemor kommt nach DS9. Er erklärt Kira, dass er bald sterben wird und will, alter cardassianischer Sitte folgend, ihr all die Informationen mitteilen, die er im Laufe seines bisherigen Lebens über seine Feinde sammeln konnte. Gul Dukat ist darüber natürlich wenig erfreut, geraten doch auch Regierungsgeheimnisse in die Hand des Feindes. Darum lässt er Kira wissen, dass Ghemor einst für den Tod zahlreicher Bajoraner verantwortlich war...............
Quark braucht eine Handelslizenz. Er sucht deshalb seine Mutter auf, die mit dem Großen Nagus liiert ist. Seine Versuche, über ihn eine Lizenz zu bekommen, schlagen fehl. Da taucht Brunt von der Handelsorganisation auf und schlägt ihm ein unsauberes Geschäft vor.
Martok erhält von Gowron den Auftrag, mit der Rotarran nach dem verschollen Schiff B'Moth zu suchen. Ebenfalls an Bord befinden sich Worf und Jadzia, die mit ansehen müssen, wie Martok mit sich selbst kämpft, den Mut zu finden, gegen die Jem'Hadar vorzugehen. Da die Besatzung das Vertrauen in Martok verliert, fordert Worf ihn zum Kampf und lässt ihm den Sieg, was seinen alten Kampfeswillen zurückbringt. Zum Dank nimmt Martok Worf in sein Haus auf..................
Im Gamma-Quadranten stößt die Defiant auf eine Welt, die von einer Energiebarriere umgeben wird. Beim Durchbrechen der Barriere wird das Schiff beschädigt und man landet auf dem Planeten. Dort finden Sisko und seine Leute ihre eigenen Nachfahren. Sie erfahren, dass die Defiant irgendwie in die Vergangenheit verschlagen wurde und man schließlich ein neues Leben auf dem Planeten begann, da Flucht unmöglich war. Nun jedoch scheint sie in greifbarer Nähe, aber wenn sie ihnen gelingt, werden all ihre Nachkommen aufhören zu existieren...................
Eine Nachricht an Eddington gerät in Siskos Hände. Sie besagt, dass der Maquis einen letzten großen Schlag gegen die Cardassianer plant. Mit einigen Raketen sollen Millionen auf Cardassia sterben. Sisko will Eddingtons Hilfe beim Aufspüren der Raketen. Erst lehnt er ab, stimmt dann jedoch zu. Als sie die Basis erreichen, wird klar, dass die Jem'Hadar schon da waren...........
O'Brien braucht für einige Reparaturen spezielle Ersatzteile. Diese will man der ebenfalls von den Cardassianern verlassenen Station Empok Nor entnehmen. O'Brien, Nog, Garak und ein paar andere fliegen dorthin und sehen sich bald einer finalen Falle der Cardassianer gegenüber: zwei Cardassianer, die durch Drogeneinfluss nur noch auf das Töten aus sind. Zwar können diese besiegt werden, doch auch Garak gerät unter den Einfluss der Droge..............
Der Krieg gegen das Dominion wird immer wahrscheinlicher. Während Sisko mit dem Vorta Weyoun zusammentrifft und man sich gegenseitige Floskeln des Friedenswillens präsentiert, macht sich Jake auf, nach einer kleinen Freude für seinen Vater zu suchen: eine seltene Baseballkarte.....................
Das Dominion zieht eine gewaltige Flotte zusammen. Sisko erhält den Befehl, das Wurmloch zu verminen, um so den Nachschub aus dem Gamma Quadranten auszuschalten. Kurz vor Ausbruch des Krieges kann Sisko noch einen Nichtangriffspakt zwischen Bajor und dem Dominion in Gang setzen, aber dann ist auch schon alles zu spät. Der sich selbst erneuernde Minenteppich wird noch aktiviert, bevor das Starfleet Personal DS9 verlassen muss und Cardassianer und Jem'Hadar Einzug halten...