Nach seiner Bruchlandung auf der Erde wird der Klingone Klaang von einem Farmer angeschossen und bewusstlos ins Flottenhospital gebracht. Es stellt sich heraus, dass Klaang ein Kurier ist, der mit wichtigen Informationen für sein Volk auf dem Weg nach Kronos war, der Heimatwelt der Klingonen. Unterwegs wurde er von unbekannten Außerirdischen angegriffen und musste auf der Erde notlanden. Captain Archer besteht darauf, Klaang selbst nach Kronos zurückzubringen. Doch dazu kommt es nicht, denn der Klingone wird entführt. Archer und seine Crew machen sich auf die Suche nach den Entführern ...
Nach seiner Bruchlandung auf der Erde wird der Klingone Klaang von einem Farmer angeschossen und bewusstlos ins Flottenhospital gebracht. Es stellt sich heraus, dass Klaang ein Kurier ist, der mit wichtigen Informationen für sein Volk auf dem Weg nach Kronos war, der Heimatwelt der Klingonen. Unterwegs wurde er von unbekannten Außerirdischen angegriffen und musste auf der Erde notlanden. Captain Archer besteht darauf, Klaang selbst nach Kronos zurückzubringen. Doch dazu kommt es nicht, denn der Klingone wird entführt. Archer und seine Crew machen sich auf die Suche nach den Entführern ...
2.5.2151 - 6.5.2151: Die Enterprise stößt auf ein fremdes Schiff, das auf Funksprüche nicht reagiert. Ein Außenteam muss entsetzt feststellen, dass jemand die Crew brutal abgeschlachtet hat. T’Pol überredet Captain Archer, das Raumgebiet zu verlassen. Doch dann gehen Captain Archer die toten Aliens nicht aus dem Kopf.
Anfang Mai 2151: Endlich erreicht die Enterprise einen unbewohnten Planeten mit einer Sauerstoffatmosphäre. Schnell ist ein Außenteam zusammengestellt. Als T'Pol, Tucker und Mayweather für weitere Tests über Nacht auf dem Planeten bleiben, infizieren sich alle mit einem heimtückischen Virus.
Mitte Mai 2151: Ein getarntes Alienschiff sorgt auf der Enterprise für technische Probleme. Archer nimmt Kontakt zu dem xyrillianischen Captain auf, dessen Antrieb ausgefallen ist. Tucker soll bei der Reparatur assistieren. Dort lernt er Ah’Len kennen, die ihm ein seltsames Spiel zeigt. Kurz darauf ist Tucker schwanger.
Die Enterprise fliegt Terra Nova an, eine der ersten Erdkolonien. Nach Auseinandersetzungen ist der Kontakt zur Erde vor Jahrzehnten abgebrochen. Archer trifft auf der Planetenoberfläche auf mutierte Menschen, die die Erdbewohner dafür verantwortlich machen, dass auf Terra Nova plötzlich die Atmosphäre giftig wurde. Seitdem lebt die Kolonie im Untergrund.
Captain Archer besichtigt mit einigen Kollegen das vulkanische Kloster eines bislang unbekannten Sterns. Während ihres Besuches wird die Gruppe von Andorianern gefangen genommen, einem mit den Vulkaniern auf Kriegsfuß stehenden Volk. Diese vermuten, die Vulkanier hätten im Kloster Langstreckensensoren versteckt, mit denen sie einen Angriff auf die Andorianer starten wollen. Als Captain Archer sieht, wie brutal die Geiselnehmer vorgehen, ruft er die Enterprise zu Hilfe ...
Juli 2151: Die Crew der Enterprise untersucht den größten Kometen, den die Menschheit bislang entdeckte. Da taucht überraschend das vulkanische Raumschiff Ti’Mur auf. Archer wird misstrauisch, als er herausfindet, dass T’Pol dem vulkanischen Captain Vanik heimlich Botschaften zukommen lässt.
Juli 2151: Die Enterprise entdeckt einen bewohnten Planeten mit 500 Millionen Bewohnern, die sich Akaal nennen. Die vorindustrielle Gesellschaft ist hilflos einer tödlichen Epidemie ausgeliefert. Seltsamerweise gehen Neutrino-Emissionen von der Oberfläche aus, die offenbar von einem Antimateriereaktor stammen. Archer schmuggelt sich als Akaali verkleidet unter die Bevölkerung, um das Phänomen zu untersuchen.
August 2151: Die Enterprise hat den Auftrag, dem Frachtschiff Fortunate zu helfen, das von nausicaanischen Piraten angegriffen und schwer beschädigt wurde. Die Crew der Fortunate verhält sich sehr feindselig, nur Mayweather, der jahrelang auf einem Frachtschiff gelebt hat, kann das Vertrauen der Leute gewinnen. Er findet heraus, dass auf der Fortunate ein Nausicaaner gefangen gehalten wird.
Die Enterprise nimmt eine Gruppe Pilger an Bord, die ein Naturspektakel beobachten wollen, bei dem einer der Protosterne eine Unmenge Neutronen entlässt. Voller Stolz präsentiert "Trip" den Gästen zunächst die technischen Errungenschaften des Raumschiffs. Dabei macht sich einer der Ankömmlinge an einem Kabel zu schaffen. Kurz darauf kommt es zu einem Spannungsstoß, der sich in unzähligen Explosionen entlädt, die anscheinend unaufhaltsam auf den Hauptreaktor zurasen ...
Gerade als Captain Archer in den Vorbereitungen zu Malcolm Reeds Geburtstag steckt, nähert sich der Enterprise ein Raumschiff mit hoher Geschwindigkeit. Genauso schnell, wie das Schiff aufgetaucht ist, verschwindet es auch wieder. Archer beschließt, lieber zur Erde zurückzukehren und das Schiff aufrüsten zu lassen, um sich in Zukunft besser wehren zu können. Doch dazu bleibt keine Zeit, denn schon kurz darauf wird die Enterprise von feindlichen Aliens angegriffen ...
29.9.2151: Auf dem Planeten Valakis leben die Valakianer und die Menk. Die Valakianer dominieren den Planeten, leiden aber an einer schrecklichen Krankheit, die bald zur Ausrottung der Rasse führen wird. Davon könnten die in ihrer Entwicklung unterdrückten Menk jedoch profitieren. Soll man den Valakianern ein Heilmittel geben?
Anfang Oktober 2151: Ein Außenteam der Enterprise versucht, die bewusstlose Mannschaft eines Klingonenschiffs zu retten. Als eine überlebende Klingonin mit dem Shuttle flieht, ist das Außenteam in der Falle.
Ende Oktober 2151: Als Konsequenz der Ereignisse auf P’Jem soll T’Pol die Enterprise verlassen. Kurz darauf werden Archer und T’Pol auf einem Handelsplaneten von Rebellen gefangen genommen, die nicht wollen, dass die Regierung Geschäfte mit den Vulkaniern macht.
9. November 2151: Die Enterprise transportiert 34 Überlebende eines auf einem Asteroiden zerschellten Raumschiffs zurück zur Heimatwelt Tenia. Kurz zuvor hatte man die Tür einer Shuttlerampe verloren. Als Trip und Reed wegen einer defekten Sensorenphalanx drei Tage zu früh von einer Shuttlemission zurückkehren, finden sie die Überreste des Raumschiffs und die Tür mit der Aufschrift „01 ENT“. Sie sind nun überzeugt, dass die Enterprise vernichtet wurde und dass sie im Shuttle dem Tod geweiht sind.
Ende November 2151: Die Enterprise trifft auf Vulkanier, die dem „V’tosh ka’tur“ angehören, was übersetzt „Vulkanier ohne Logik“ heißt. Der Vulkanier Tolaris zeigt T’Pol die Technik der Gedankenverschmelzung. Dabei wird er gewalttätig.
Auf einem fremden Planeten, der von Aliens zur Jagd genutzt wird, hat Captain Archer die Erscheinung einer geheimnisvollen Frau. Doch der Planet beherbergt kein intelligentes Leben. Oder doch?
Die Enterprise treibt durchs All, als ein Raumschiff andockt, aus dem kleine Wesen mit großen Ohren in das Schiff gelangen. Die Crew liegt am Boden, durch Gas betäubt. Ein Eindringling nimmt die Atemmaske ab - es ist ein Ferengi! Doch während die Großohren das Schiff nach Profit durchsuchen, erwacht Chefingenieur Tucker auf der Krankenstation in der Dekontaminationskammer und macht sich auf, sein Schiff wieder aus der Hand der unbekannten Aliens zu befreien.
Die Crew der Enterprise hört von einem Geisterschiff und kann der Versuchung nicht widerstehen, auf dem Planeten zu landen, wo das Geisterschiff liegen soll. An Bord des Wracks werden sie tatsächlich mit Geistern konfrontiert, die sich jedoch recht schnell als Überlebende eines Absturzes entpuppen, der etwas mehr als drei Jahre zurückliegt. Archer erklärt sich gern zur Hilfe bereit und so wird das Wrack wieder raumtauglich gemacht. Plötzlich macht man an Bord der Enterprise jedoch eine interessante Entdeckung: Der Absturz dieses Schiffes muss mehr als zwanzig Jahre zurückliegen.
Als Archer und Mayweather einen Planeten untersuchen, geraten sie in einen "Militärbereich" und werden in ein Lager der Tandaraner gesperrt, die mit den Suliban im Krieg liegen. Während die früheren Aufeinandertreffen der Crew der Enterprise mit den Suliban katastrophal verlaufen waren, finden sich Archer und Mayweather nun mit einer Gruppe von Suliban in einer Zelle inhaftiert, die anscheinend zu Unrecht festgehalten werden. Es stellt sich heraus, dass die Suliban ursprünglich eine friedliebende Rasse waren, die ihre Heimatwelt vor 1000 Jahren verließ, um zwischen den Sternen zu reisen. Einige der Suliban integrierten sich in andere Gesellschaften, sieben Jahre später allerdings tauchte die Cabal auf - die genetisch verbesserten Suliban. Aus unbekannten Gründen begann die Cabal damit, die Tandaraner anzugreifen und nach hunderten von friedlichen Jahren der Koexistenz misstrauten die Tandaraner plötzlich allen Suliban und steckte sie als Staatsfeinde in Gefangenenlager.
Die Crew wird von einer neuen unbekannten Spezies auf der Enterprise heimgesucht die einige Crewmitglieder u.a. Captian Archer als Wirte nimmt. T'Pol und Hoshi finden heraus, dass diese Rasse hoch intelligent ist und die Wirte zum Überleben braucht. Die Enterprise hat nur wenig Zeit die Heimatwelt dieser Rasse zu finden, den je länger die die Crew als Wirte dienen, desto kleiner wird die Chance, dass sie gerettet werden können.
Die Enterprise soll die vulkanische Botschafterin V’Lar von einem Planeten abholen, weil ihr dort Korruption vorgeworfen wird. Als sich V’Lar gegen die Anschuldigungen gar nicht zu Wehr setzt, kommen T’Pol Zweifel an ihrem großen Vorbild.
Captain Archer nimmt das Angebot von Zobral für ein Essen an. Doch schon bald erkennen er und Tucker das sie geradewegs inmitten eines Bürgerkrieges gekommen sind. Als einzige Hoffnung sehen sie die Flucht in die Wüste...
Endlich angekommen auf Risa: die Crew macht nun endlich Urlaub. Während Archer sich nur entspannen will, Travis klettern gehen will, Reed und Tucker das risanische Nachtleben erforschen und Hoshi neue Sprachen kennenlernen will, bleibt T'Pol mit Dr. Phlox an Bord. Doch für jeden ist der Urlaub nicht das was man sich erwartet hat...
Bei einem Anflug auf einem Bergbauplaneten lässt das Shuttle der Enterprise zuviel Plasma aus und der Planet explodiert daraufhin. Völlig aufgelöst erfährt Archer von Admiral Forrest das die Reise der Enterprise nun endgültig zuende wäre. Als er sich schlafen legt, wacht er in seiner Wohnung in San Francisco auf, einen Tag bevor Klaang auf der Erde abgestürzt ist. Daniels erklärt jemand hätte in die Zeitlinie eingegriffen und rekrutiert nun Archer damit er die waren Täter des Vorfalls findet. Mit den neuen Informationen werden die Suliban entlarvt, diese fordern jedoch den Captain. Da er keine andere Möglichkeit hat will er sich stellen, doch plötzlich sitzt er gemeinsam mit Daniels im 31. Jahrhundert fest...